seq1 = pF1KE4204.tfa, 2133 bp
seq2 = pF1KE4204/gi568815584f_55250391.tfa (gi568815584f:55250391_55452523), 202133 bp

>pF1KE4204 2133
>gi568815584f:55250391_55452523 (Chr14)

1-2133  (100001-102133)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACCTAAAGCCATATTGGAAGCTCCAGAAGAAAGAGCACCCCCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACCTAAAGCCATATTGGAAGCTCCAGAAGAAAGAGCACCCCCCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTCAGCAGGGAAACGCAGAGAACTCCTATGAACCACCAAAAGGCTGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTCAGCAGGGAAACGCAGAGAACTCCTATGAACCACCAAAAGGCTGTAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGATGAAACATGCAAAGCTAGCCACATAACATCAAGTGTCTTTCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGATGAAACATGCAAAGCTAGCCACATAACATCAAGTGTCTTTCCTTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTCTCTCGGTAAAGCATCATCTCGAAAGCCATTTGGGATCCTTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTCTCTCGGTAAAGCATCATCTCGAAAGCCATTTGGGATCCTTTCTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AAATGTTCTGTGCAGTATGAGTGGGAAGAGTCCTGTAGAGAGCAGCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AAATGTTCTGTGCAGTATGAGTGGGAAGAGTCCTGTAGAGAGCAGCTTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGTTAAAACCAAAAAGAATGCACCATCTGCAACGATCCACCAGGGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGTTAAAACCAAAAAGAATGCACCATCTGCAACGATCCACCAGGGCGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAAGAAGGACCACTTGATATCTGGGCTGTTGTGAAACCTGGAAATACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAAGAAGGACCACTTGATATCTGGGCTGTTGTGAAACCTGGAAATACCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGAAAAAATTGCATTCTTTGCATCCCACCAGTGTAGTAACAGGATAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGAAAAAATTGCATTCTTTGCATCCCACCAGTGTAGTAACAGGATAGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTATGAAAATAAAAAGTTCCTGGGATATTGATGGGAGAGCTACTAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTATGAAAATAAAAAGTTCCTGGGATATTGATGGGAGAGCTACTAAGAGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGGAAAAAATCAGGGGATCTTAAAAAAGCCAAGGTACAGGTGGAAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGAAAAAATCAGGGGATCTTAAAAAAGCCAAGGTACAGGTGGAAAGGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAGGGAGGTTAACAGCAGGTGCTACCAACCTGAGCCTTTTGCATGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAGGGAGGTTAACAGCAGGTGCTACCAACCTGAGCCTTTTGCATGTGGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTGAGCACTGTTCTGTGCACTATGTGAGTGACAGTGGGGATGGAGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 100551 TTGAGCACTGTTCTGTGCACTATGTGAGTGACAGTGGGGATGGAGTCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTGGGAGGCCTCTGTCAGTTATACAGATGGTTGCCTTCTTGGAGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTGGGAGGCCTCTGTCAGTTATACAGATGGTTGCCTTCTTGGAGCAAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGCCAGTGCTCTGCTAGCTAGCTGTTCAAAAAACTGCACAAACTCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGCCAGTGCTCTGCTAGCTAGCTGTTCAAAAAACTGCACAAACTCACCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAATTGTGAGGTTTTCTGGCCAATCCAGAGGTGTGCCTGCAGTGTCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CAATTGTGAGGTTTTCTGGCCAATCCAGAGGTGTGCCTGCAGTGTCTGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TCCTATTCTGCCCCAGGAGCTTGTGAAGAACCCACAGAAAGGGGAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TCCTATTCTGCCCCAGGAGCTTGTGAAGAACCCACAGAAAGGGGAAATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGAGGTTGGTGAACCACAGAGCGAACCAGTCCGTGTCCTTGACATGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGAGGTTGGTGAACCACAGAGCGAACCAGTCCGTGTCCTTGACATGGTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCAAGTTGGAGTCTGAGTGCCTGAAGCGGCAGGGCCAGCGTGAGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCAAGTTGGAGTCTGAGTGCCTGAAGCGGCAGGGCCAGCGTGAGCCTGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AGCCTCTCAAGGAATAACAGCTTCCGTCGAAATGTGGGCAGAGTATTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AGCCTCTCAAGGAATAACAGCTTCCGTCGAAATGTGGGCAGAGTATTGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGCAAATAGCACTCAGGCTGATGAAGGCAAAACAAAGAAAGGCGTCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGCAAATAGCACTCAGGCTGATGAAGGCAAAACAAAGAAAGGCGTCTTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGCACCTGACACTCAGGTGAATCCTGTGGGGTCTGTATCTGTGGATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGCACCTGACACTCAGGTGAATCCTGTGGGGTCTGTATCTGTGGATTGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGCCCTTCAAGAGCTGATCGTTGTTCTCCTAAGGAGGACCAGGCCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGCCCTTCAAGAGCTGATCGTTGTTCTCCTAAGGAGGACCAGGCCTGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGGTGCTTCTCAGGACTGCCCCCCATTGCCAGCAGGAGTGAGTTTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGGTGCTTCTCAGGACTGCCCCCCATTGCCAGCAGGAGTGAGTTTCCACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TAGACAGTGCAGAGTTAGAGCCGGGTTCGCAAACTGCCGTGAAAAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TAGACAGTGCAGAGTTAGAGCCGGGTTCGCAAACTGCCGTGAAAAACAGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AACAGATATGATGTGGAAATGACAGATGAACTCGTTGGGTTACCTTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AACAGATATGATGTGGAAATGACAGATGAACTCGTTGGGTTACCTTTTTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTCTCATACCTATTCCCAAGCCTCTGAATTGCCCACAGATGCTGTTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CTCTCATACCTATTCCCAAGCCTCTGAATTGCCCACAGATGCTGTTGATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GTATGAGCAGAGAGCTTGTGTCCCTTACTAGCCGAAATCCTGATCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GTATGAGCAGAGAGCTTGTGTCCCTTACTAGCCGAAATCCTGATCAAAGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 AAAGAATCTTTGTGCATTAGTATCACTGTGTCCAAGGTAGACAAAGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 AAAGAATCTTTGTGCATTAGTATCACTGTGTCCAAGGTAGACAAAGACCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GCCTTCCAATTTAAACTCCTGTGAAGACCCAGTTCCAGGGATGTTGTTTT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GCCTTCCATTTTAAACTCCTGTGAAGACCCAGTTCCAGGGATGTTGTTTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TTTTGCCACCTGGTCAGCACTTGTCAGACTATTCCCAGTTGAATGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TTTTGCCACCTGGTCAGCACTTGTCAGACTATTCCCAGTTGAATGAAAGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ACAACAAAAGAGTCTTCAGAGGCCAGCCAGCTTGAAGATGCTGCTGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ACAACAAAAGAGTCTTCAGAGGCCAGCCAGCTTGAAGATGCTGCTGGGGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TGACAGTGCATCTGAGGAAAAAAGTGGGTCTGCTGAGCCATTTGTACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 101551 TGACAGTGCATCTGAGGAAAAAAGTGGGTCTGCTGAGCCATTTGTACTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CAGCCTCTTCTGTGGAAAGTACATTACCAGTGCTTGAGGCATCCAGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CAGCCTCTTCTGTGGAAAGTACATTACCAGTGCTTGAGGCATCCAGTTGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 AAGAAGCAGGTGTCGCATGACTTCCTGGAGACCAGGTTTAAAATCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 AAGAAGCAGGTGTCGCATGACTTCCTGGAGACCAGGTTTAAAATCCAGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 GCTTTTGGAGCCTCAGCAGTACATGGCTTTTCTGCCCCACCACATTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 GCTTTTGGAGCCTCAGCAGTACATGGCTTTTCTGCCCCACCACATTATGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TAAAAATCTTCAGGTTACTTCCCACCAAGAGTTTAGTGGCCCTTAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TAAAAATCTTCAGGTTACTTCCCACCAAGAGTTTAGTGGCCCTTAAATGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 ACCTGCTGCTATTTCAAGTTTATCATTGAGTACTACAATATCAGGCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 ACCTGCTGCTATTTCAAGTTTATCATTGAGTACTACAATATCAGGCCAGC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 AGATTCTCGCTGGGTTCGAGATCCACGCTATAGAGAGGATCCTTGCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 AGATTCTCGCTGGGTTCGAGATCCACGCTATAGAGAGGATCCTTGCAAAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 AGTGCAAGAAAAAGTATGTGAAAGGGGATGTGTCCCTGTGCCGATGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 AGTGCAAGAAAAAGTATGTGAAAGGGGATGTGTCCCTGTGCCGATGGCAC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 CCCAAGCCCTATTGCCAGGCATTGCCCTATGGGCCAGGGTATTGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 CCCAAGCCCTATTGCCAGGCATTGCCCTATGGGCCAGGGTATTGGATGTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 CTGCCACCGGTCTCAGAAAGGATTCCCTGGCTGTAAGCTGGGGCTTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 CTGCCACCGGTCTCAGAAAGGATTCCCTGGCTGTAAGCTGGGGCTTCATG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 ACAATCACTGGGTTCCTGCCTGCCACAGCTTTAATCGGGCAATCCATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 ACAATCACTGGGTTCCTGCCTGCCACAGCTTTAATCGGGCAATCCATAAG

   2100     .    :    .    :    .    :
   2101 AAAGCAAAAGGGACTGAAGCTGAAGAGGAATAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 AAAGCAAAAGGGACTGAAGCTGAAGAGGAATAC