seq1 = pF1KE4202.tfa, 2124 bp
seq2 = pF1KE4202/gi568815581r_41753743.tfa (gi568815581r:41753743_41965326), 211584 bp

>pF1KE4202 2124
>gi568815581r:41753743_41965326 (Chr17)

(complement)

1-545  (99957-100501)   100% ->
546-2124  (110006-111584)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCTGCGGCAGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCGGCTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99957 ATGGCGGCTGCGGCAGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCGGCTGCATC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTTCAGGTACTGGAGATGGAGAGCATGGAGACGGCCGCCGCCGGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100007 TCTTCAGGTACTGGAGATGGAGAGCATGGAGACGGCCGCCGCCGGCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGACTGGCCGCCGAGGTCCGAGGCAGCGGCACGGTGGACTTCGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100057 CAGGACTGGCCGCCGAGGTCCGAGGCAGCGGCACGGTGGACTTCGGGCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGGCCGGGGATCTCTGCAATGGAGGCGAGCGGGGGCGATCCGGGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100107 GGGCCGGGGATCTCTGCAATGGAGGCGAGCGGGGGCGATCCGGGCCCAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCCGAGGATTTCGAGTGCAGCTCTCACTGCTCAGAGCTGTCCTGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100157 AGCCGAGGATTTCGAGTGCAGCTCTCACTGCTCAGAGCTGTCCTGGCGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAACGAGCAGCGGCGCCAGGGCCTCTTCTGCGACATTACCCTGTGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100207 AGAACGAGCAGCGGCGCCAGGGCCTCTTCTGCGACATTACCCTGTGCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGCGGGGCTGGAGGCCGCGAGTTCCGGGCCCACCGCTCGGTACTGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100257 GGCGGGGCTGGAGGCCGCGAGTTCCGGGCCCACCGCTCGGTACTGGCTGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGCCACCGAGTACTTCACGCCCCTGCTCTCGGGCCAGTTTTCCGAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100307 CGCCACCGAGTACTTCACGCCCCTGCTCTCGGGCCAGTTTTCCGAGTCCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCTCGGGACGGGTGGAGATGCGCAAGTGGAGCTCCGAGCCGGGGCCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100357 GCTCGGGACGGGTGGAGATGCGCAAGTGGAGCTCCGAGCCGGGGCCCGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCGACACAGTGGAAGCCGTAATCGAGTACATGTACACCGGGCGCATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100407 CCCGACACAGTGGAAGCCGTAATCGAGTACATGTACACCGGGCGCATCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGTCAGCACGGGCAGCGTGCACGAGGTGCTGGAGTTGGCCGACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100457 CGTCAGCACGGGCAGCGTGCACGAGGTGCTGGAGTTGGCCGACAGGTA..

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    546     GTTCCTACTCATTCGTTTAAAAGAATTTTGTGGAGAATTTCTCAAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100507 .TAGGTTCCTACTCATTCGTTTAAAAGAATTTTGTGGAGAATTTCTCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAAAAACTTCATCTCTCAAATTGTGTGGCAATTCATAGCTTAGCACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110052 AAAAAACTTCATCTCTCAAATTGTGTGGCAATTCATAGCTTAGCACACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GTACACCCTGAGCCAACTTGCTCTGAAGGCTGCTGATATGATACGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110102 GTACACCCTGAGCCAACTTGCTCTGAAGGCTGCTGATATGATACGGAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATTTCCACAAAGTGATTCAGGATGAAGAATTTTATACGTTACCTTTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110152 ATTTCCACAAAGTGATTCAGGATGAAGAATTTTATACGTTACCTTTCCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTCATTAGAGACTGGCTTTCAGATTTGGAAATTACAGTTGATTCTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110202 CTCATTAGAGACTGGCTTTCAGATTTGGAAATTACAGTTGATTCTGAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGTTCTCTTTGAAACCGTTTTGAAATGGGTTCAGAGAAATGCTGAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110252 GGTTCTCTTTGAAACCGTTTTGAAATGGGTTCAGAGAAATGCTGAAGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GAGAGAGATACTTTGAAGAACTTTTTAAATTGCTCAGGTTGTCCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110302 GAGAGAGATACTTTGAAGAACTTTTTAAATTGCTCAGGTTGTCCCAGATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AAACCTACCTACCTTACTCGACATGTCAAACCAGAGAGGCTGGTAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110352 AAACCTACCTACCTTACTCGACATGTCAAACCAGAGAGGCTGGTAGCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TAATGAAGTTTGTGTCAAGTTGGTCGCTGACGCAGTGGAGAGACATGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110402 TAATGAAGTTTGTGTCAAGTTGGTCGCTGACGCAGTGGAGAGACATGCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TGAGAGCTGAGAATATACAATCTGGCACATGCCAGCACCCCACTTCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110452 TGAGAGCTGAGAATATACAATCTGGCACATGCCAGCACCCCACTTCTCAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GTGTCACTATTGCCTCGTTATGGGCAAAACATGGATGTGATCATGGTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110502 GTGTCACTATTGCCTCGTTATGGGCAAAACATGGATGTGATCATGGTTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TGGAGGTGTGTCAGAAGGAGGGGACTATTTAAGTGAATGTGTGGGATATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 110552 TGGAGGTGTGTCAGAAGGAGGGGACTATTTAAGTGAATGTGTGGGATACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TTGTTGATGAGGACAGATGGGTAAATCTGCCACATATTCATAATCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110602 TTGTTGATGAGGACAGATGGGTAAATCTGCCACATATTCATAATCACCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 GATGGACATGCTGTTGCAGTAACAGAATCCTACGTGTATGTTGCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110652 GATGGACATGCTGTTGCAGTAACAGAATCCTACGTGTATGTTGCTGGATC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 AATGGAGCCAGGGTTTGCTAAAACTGTAGAAAGGTATAACCCAAATTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110702 AATGGAGCCAGGGTTTGCTAAAACTGTAGAAAGGTATAACCCAAATTTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 ATACATGGGAACATGTTTGTAGTCTGATGACAAGAAAGCATTCTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110752 ATACATGGGAACATGTTTGTAGTCTGATGACAAGAAAGCATTCTTTTGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 CTAACAGAAGTCAAAGGGAAGCTCTATAGCATTGGAGGACATGGCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110802 CTAACAGAAGTCAAAGGGAAGCTCTATAGCATTGGAGGACATGGCAACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 TAGTCCTGGTTTTAAAGATGTGACTGTTTATAATCCTGAGCTTGATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110852 TAGTCCTGGTTTTAAAGATGTGACTGTTTATAATCCTGAGCTTGATAAAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 GGCACAACTTGGAATCGGCACCAAAGATTCTTCGAGATGTCAAAGCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110902 GGCACAACTTGGAATCGGCACCAAAGATTCTTCGAGATGTCAAAGCACTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 GCCATTGAAGACCGGTTTGTATACATTGCCGCCCGCACTCCTGTAGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110952 GCCATTGAAGACCGGTTTGTATACATTGCCGCCCGCACTCCTGTAGACCG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 GGACACTGAAGATGGATTAAAGGCTGTAATTACTTGCTATGATACAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111002 GGACACTGAAGATGGATTAAAGGCTGTAATTACTTGCTATGATACAGAGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 CTCGACAGTGGCAAGATGTGGAATCTTTGCCGCTTATTGACAATTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111052 CTCGACAGTGGCAAGATGTGGAATCTTTGCCGCTTATTGACAATTACTGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 TTTTTCCAAATGTCTGTGGTCAATTCAAACTTTTATCAGACAGCATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111102 TTTTTCCAAATGTCTGTGGTCAATTCAAACTTTTATCAGACAGCATCATG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 TTGTCCCAAGAGTTATTGTTTAGAAAACGAAGAGGCAGTAAGAAAAATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111152 TTGTCCCAAGAGTTATTGTTTAGAAAACGAAGAGGCAGTAAGAAAAATTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 CCAGCCAAGTGTCTGATGAGATCCTTGAAAGCTTGCCTCCAGAAGTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111202 CCAGCCAAGTGTCTGATGAGATCCTTGAAAGCTTGCCTCCAGAAGTCCTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 AGCATCGAAGGAGCAGCCATTTGCTATTACAAAGATGATGTCTTCATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111252 AGCATCGAAGGAGCAGCCATTTGCTATTACAAAGATGATGTCTTCATTAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1842 AGGAGGCTGGAAAAACAGTGATGATATTGATAAACAGTATCGGAAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111302 AGGAGGCTGGAAAAACAGTGATGATATTGATAAACAGTATCGGAAAGAAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1892 CCTACCGATATTGTGCGGAGAGGAAGAGGTGGATGCTTCTTCCTCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111352 CCTACCGATATTGTGCGGAGAGGAAGAGGTGGATGCTTCTTCCTCCTATG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1942 CCACAACCTCGTTGTAGAGCCACTGCTTGTCACGTGAGGATCCCATACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111402 CCACAACCTCGTTGTAGAGCCACTGCTTGTCACGTGAGGATCCCATACCG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1992 GTACTTGCATGGCACACAGAGATACCCTATGCCTCAAAACCTGATGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111452 GTACTTGCATGGCACACAGAGATACCCTATGCCTCAAAACCTGATGTGGC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2042 AGAAGGACCGCATCAGACAGATGCAAGAGATACATCGTCACGCCCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111502 AGAAGGACCGCATCAGACAGATGCAAGAGATACATCGTCACGCCCTGAAC

   2100     .    :    .    :    .    :
   2092 ATGAGGCGAGTGCCAAGCTCTCAGATTGAATGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 111552 ATGAGGCGAGTGCCAAGCTCTCAGATTGAATGC