seq1 = pF1KE4189.tfa, 2025 bp
seq2 = pF1KE4189/gi568815593f_149497770.tfa (gi568815593f:149497770_149732188), 234419 bp

>pF1KE4189 2025
>gi568815593f:149497770_149732188 (Chr5)

1-186  (100001-100186)   100% ->
187-310  (103339-103462)   100% ->
311-458  (111779-111926)   100% ->
459-658  (118798-118997)   100% ->
659-789  (120407-120537)   100% ->
790-894  (121169-121273)   100% ->
895-1005  (122585-122695)   100% ->
1006-1335  (123964-124293)   100% ->
1336-1464  (126243-126371)   100% ->
1465-1660  (129307-129502)   99% ->
1661-1818  (131040-131197)   100% ->
1819-2025  (134213-134419)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAAGCATGGAGCCGACGAGCCATCCTCCAGGTCAGGGAGTCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAAGCATGGAGCCGACGAGCCATCCTCCAGGTCAGGGAGTCCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGGAAGGTAGGGCCTCTGAGGACAGATCGCTGCTTCATCAGAGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGGAAGGTAGGGCCTCTGAGGACAGATCGCTGCTTCATCAGAGGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTCCGGGAGCTCATCGACACTGAGGTCTCCTACTTGCACATGCTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGTCCGGGAGCTCATCGACACTGAGGTCTCCTACTTGCACATGCTCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCTGTGCCTCTGACATCAGGAGCCGCCTCCAGCAG         TTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100151 CTCTGTGCCTCTGACATCAGGAGCCGCCTCCAGCAGGTA...CAGTTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCAGGGAGATCTGGATGTCCTGTTCTCAAACATTGATGATATCATCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103344 GCAGGGAGATCTGGATGTCCTGTTCTCAAACATTGATGATATCATCAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAACAGCAGATTCCTCCATGATCTGCAGGAGACAGCCTCCAAGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103394 TGAACAGCAGATTCCTCCATGATCTGCAGGAGACAGCCTCCAAGGAAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GAACAAGTGCAGCTAGTTG         GTAACATATTTCTGGAATTCCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 103444 GAACAAGTGCAGCTAGTTGGTA...CAGGTAACATATTTCTGGAATTCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGAGGAGTTGGAGCAAGTCTATAAGGTCTACTGTGCCAGCTACGACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111801 AGAGGAGTTGGAGCAAGTCTATAAGGTCTACTGTGCCAGCTACGACCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTTGCTACTGGTGGACACGTACCGGAAGGAGCCGGAGCTGCAGCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111851 CCTTGCTACTGGTGGACACGTACCGGAAGGAGCCGGAGCTGCAGCGGCAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATCCAGGGCATCGTTGAGGCGGTGGT         GCCGCAAGCTGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 111901 ATCCAGGGCATCGTTGAGGCGGTGGTGTG...CAGGCCGCAAGCTGGATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTCAGGCCTCAGTTTCTTGCTGGTAATTCCTCTGCAGAGGATCACCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118813 TTCAGGCCTCAGTTTCTTGCTGGTAATTCCTCTGCAGAGGATCACCAGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACCCACTGCTGCTGCAGAAAATCCTGGAGAACACAGTCCCTGATGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118863 ACCCACTGCTGCTGCAGAAAATCCTGGAGAACACAGTCCCTGATGCCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCTATCCTGTCCTTCAGAGGGCTGTCTCTGCCCTCCAGGACGTGAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118913 GCCTATCCTGTCCTTCAGAGGGCTGTCTCTGCCCTCCAGGACGTGAACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAATATCAATGAGTACAAGATGCGCAAGGAAGTGG         CCTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 118963 CAATATCAATGAGTACAAGATGCGCAAGGAAGTGGGTA...CAGCCTCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AGTACACCAAGGTAGAGCAGCTGACCCTCCGGGAGCGGCTGGCCCGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120413 AGTACACCAAGGTAGAGCAGCTGACCCTCCGGGAGCGGCTGGCCCGCATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AACACACACACCCTCTCCAAGAAGACCACCCGGCTGAGCCAGCTGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120463 AACACACACACCCTCTCCAAGAAGACCACCCGGCTGAGCCAGCTGCTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCAGGAGGCGGGGCTGATCCCCAGG         ACAGAAGACAAGGAAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 120513 GCAGGAGGCGGGGCTGATCCCCAGGGTG...CAGACAGAAGACAAGGAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TTGATGATTTAGAAGAGAGGTTCCAGTGGGTGTCTCTGTGTGTGACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121185 TTGATGATTTAGAAGAGAGGTTCCAGTGGGTGTCTCTGTGTGTGACTGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTGAAGAACAACGTGGCTGCTTACCTGGACAATCTGCAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 121235 CTGAAGAACAACGTGGCTGCTTACCTGGACAATCTGCAGGTG...CAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTTCCTCTACTTCAGGCCGCACGAATACAATCTGGACATCCCCGAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122587 TTTCCTCTACTTCAGGCCGCACGAATACAATCTGGACATCCCCGAGGGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTGCAGTGCAGTATTGCAATTTGGCAAGAGACCTTCACCTTGAGGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122637 CTGCAGTGCAGTATTGCAATTTGGCAAGAGACCTTCACCTTGAGGCCTTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGAAATTT         AAGCAACGGCTAGAAGGCCTGGTGTGGCAGCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 122687 CTGAAATTTGTG...CAGAAGCAACGGCTAGAAGGCCTGGTGTGGCAGCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 ACTGTGCAGCCTGGCCAAAGCCCTGCTTGGCCCTCAGAACCTGATCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123996 ACTGTGCAGCCTGGCCAAAGCCCTGCTTGGCCCTCAGAACCTGATCAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGCGTCTGGACAAGCTACTGGACTTTGAGCGGGTGGAAGAGAAGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124046 AGCGTCTGGACAAGCTACTGGACTTTGAGCGGGTGGAAGAGAAGCTGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GAGGTGGGCAGTGTGACCTACCAGGAGGAGGCCGCCCGGCACACATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124096 GAGGTGGGCAGTGTGACCTACCAGGAGGAGGCCGCCCGGCACACATACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGCACTCAACTCGCTGCTAGTGGCTGAGCTCCCACAGTTTAACCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124146 GGCACTCAACTCGCTGCTAGTGGCTGAGCTCCCACAGTTTAACCAGCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCATGCAGTGGCTGGGCCAGATCATGTGCACATTCGTGACCCTCCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124196 TCATGCAGTGGCTGGGCCAGATCATGTGCACATTCGTGACCCTCCAGAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GACCTTGCAAAGCAAGTGCTGCAGAGGGCAGAGGGAAGCATGGCCCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 124246 GACCTTGCAAAGCAAGTGCTGCAGAGGGCAGAGGGAAGCATGGCCCAGGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1336        CTGCCCCACCACCACGTCCCAGAGCCTGCCTTCAGGAAGCTGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124296 A...TAGCTGCCCCACCACCACGTCCCAGAGCCTGCCTTCAGGAAGCTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGGAGGACGCACTGGGCCGGACGAGTAACCAGCTTCGCTCCTTTCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126286 TGGAGGACGCACTGGGCCGGACGAGTAACCAGCTTCGCTCCTTTCAAGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 ACCTTTGAGAAAGTGCAGCCACCTCCCACCACACAA         CTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>| |||
 126336 ACCTTTGAGAAAGTGCAGCCACCTCCCACCACACAAGTA...CAGCCGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CCTTCCAGGGTCTGAACGCCAGGTGCAGGCTCTCCTGAGCAGGTATGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129312 CCTTCCAGGGTCTGAACGCCAGGTGCAGGCTCTCCTGAGCAGGTATGGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 CTGGGAAGCTGTACCAGGTGACAAGCAACATCAGTGGGACTGGGACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129362 CTGGGAAGCTGTACCAGGTGACAAGCAACATCAGTGGGACTGGGACTCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GACCTGACTCTGCCTCGGGGCCAAATCGTGGCCATCCTTCAAAACAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129412 GACCTGACTCTGCCTCGGGGCCAAATCGTGGCCATCCTTCAAAACAAGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CACCAAAGGCAACAGCGGCCGCTGGCTGGTGGACACCGGGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 129462 CACCAAAGGCAACAGCGGCCGCTGGCTGGTGGACACCGGGGGTA...TAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GACATCGTGGGTATGTGCCGGCTGGGAAACTACAGCTGTACCATGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131040 GACATCGTGGGTATGTGCCGGCTGGGAAACTACAGCTGTACCATGTGGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CCCAGTGCAGAGGAGCTCAGAAGGCAGGCGGGGCTGAACAAAGACCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131090 CCCAGTGCAGAGGAGCTCAGAAGGCAGGCGGGGCTGAACAAAGACCCCCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 ATGTCTAACACCGGAGCCCAGCCCAGCTCTAGTGCCCTCTATTCCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131140 ATGTCTAACACCGGAGCCCAGCCCAGCTCTAGTGCCCTCTATTCCCACCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 TGAACCAG         GTCATAGCCGCGTACCCTTTTGTGGCCAGAAGC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 131190 TGAACCAGGTG...CAGGTCATAGCCGCGTACCCTTTTGTGGCCAGAAGC

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 AGCCATGAAGTGAGCCTGCAGGCAGGCCAGCCTGTGACCATCCTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134246 AGCCATGAAGTGAGCCTGCAGGCAGGCCAGCCTGTGACCATCCTGGAGGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CCAGGACAAGAAGGGGAACCCTGAGTGGAGCCTGGTGGAAGTGAATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134296 CCAGGACAAGAAGGGGAACCCTGAGTGGAGCCTGGTGGAAGTGAATGGAC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 AGAGGGGTTATGTGCCTTCTGGCTTCTTGGCCAGGGCTCGGAGCCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134346 AGAGGGGTTATGTGCCTTCTGGCTTCTTGGCCAGGGCTCGGAGCCCAGTT

   2100     .    :    .    :
   2002 CTGTGGGGCTGGAGTCTGCCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||
 134396 CTGTGGGGCTGGAGTCTGCCCTCT