seq1 = pF1KE4181.tfa, 1959 bp
seq2 = pF1KE4181/gi568815587r_29910720.tfa (gi568815587r:29910720_30112678), 201959 bp

>pF1KE4181 1959
>gi568815587r:29910720_30112678 (Chr11)

(complement)

1-1959  (100001-101959)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGTTGCAATGGTGAGTGCGGAGAGCTCAGGGTGCAACAGTCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGTTGCAATGGTGAGTGCGGAGAGCTCAGGGTGCAACAGTCACAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTTATGGTTATGCTGCCCAGGCCCGGGCCCGGGAGCGGGAGAGGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCTTATGGTTATGCTGCCCAGGCCCGGGCCCGGGAGCGGGAGAGGCTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCACTCCAGGGCAGCTGCAGCAGCTGCTGTTGCAGCGGCCACAGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCACTCCAGGGCAGCTGCAGCAGCTGCTGTTGCAGCGGCCACAGCTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCGAAGGTAGCGGGGGTTCTGGTGGGGGCTCCCACCACCACCACCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCGAAGGTAGCGGGGGTTCTGGTGGGGGCTCCCACCACCACCACCAGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACGCGGGGCCTGTACCTCCCATGACCCTCAGAGCAGCCGGGGTAGTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACGCGGGGCCTGTACCTCCCATGACCCTCAGAGCAGCCGGGGTAGTCGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGAGGAGGCGACAGCGGTCTGAGAAGAAGAAAGCCCACTACCGGCAGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGAGGAGGCGACAGCGGTCTGAGAAGAAGAAAGCCCACTACCGGCAGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCTTCCCTCATTGCTCTGACCTGATGCCCAGTGGCTCTGAGGAGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCTTCCCTCATTGCTCTGACCTGATGCCCAGTGGCTCTGAGGAGAAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGAGGGAGCTGAGTGAGGAGGAGGAAGATGAGGAGGAGGAGGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTGAGGGAGCTGAGTGAGGAGGAGGAAGATGAGGAGGAGGAGGAAGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGAAGAGGAGGGAAGGTTTTACTATAGTGAAGATGACCATGGTGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGAAGAGGAGGGAAGGTTTTACTATAGTGAAGATGACCATGGTGATGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGTTCCTACACAGATCTGCTGCCTCAGGATGAGGGCGGTGGCGGCTACAG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGTTCCTACACGGATCTGCTGCCTCAGGATGAGGGCGGTGGCGGCTACAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTCAGTCCGCTACAGTGACTGTTGTGAACGTGTGGTGATAAATGTGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTCAGTCCGCTACAGTGACTGTTGTGAACGTGTGGTGATAAATGTGTCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCCTACGCTTTGAGACCCAAATGAAAACTCTGGCCCAGTTTCCAGAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCCTACGCTTTGAGACCCAAATGAAAACTCTGGCCCAGTTTCCAGAGACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTGTTGGGAGACCCTGAAAAGAGGACTCAGTACTTTGACCCTTTGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTGTTGGGAGACCCTGAAAAGAGGACTCAGTACTTTGACCCTTTGCGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGAGTATTTTTTTGACAGGAACCGCCCCAGCTTTGATGCCATCTTGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGAGTATTTTTTTGACAGGAACCGCCCCAGCTTTGATGCCATCTTGTATT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATTATCAATCAGGAGGCCGCCTGAAGAGGCCAGTCAATGTCCCCTTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATTATCAATCAGGAGGCCGCCTGAAGAGGCCAGTCAATGTCCCCTTTGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCTTCACTGAGGAGGTGAAGTTCTATCAGTTGGGGGAGGAGGCCCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCTTCACTGAGGAGGTGAAGTTCTATCAGTTGGGGGAGGAGGCCCTGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GAAGTTTCGGGAGGACGAGGGCTTTGTGAGAGAAGAGGAAGACAGGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GAAGTTTCGGGAGGACGAGGGCTTTGTGAGAGAAGAGGAAGACAGGGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCCCCGAGAATGAATTTAAAAAGCAGATTTGGCTCCTCTTTGAATATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCCCCGAGAATGAATTTAAAAAGCAGATTTGGCTCCTCTTTGAATATCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGAGCTCCAGTCCTGCAAGGGGCATAGCCATTGTGTCCGTCCTGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGAGCTCCAGTCCTGCAAGGGGCATAGCCATTGTGTCCGTCCTGGTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTTAATCTCCATTGTCATCTTTTGCCTGGAAACCTTGCCTGAGTTTAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTTAATCTCCATTGTCATCTTTTGCCTGGAAACCTTGCCTGAGTTTAGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACGACAGGGATCTCGTCATGGCACTGAGTGCTGGCGGGCATGGTGGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACGACAGGGATCTCGTCATGGCACTGAGTGCTGGCGGGCATGGTGGGTTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TTGAATGATACTTCAGCACCCCATCTGGAGAACTCAGGGCACACAATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TTGAATGATACTTCAGCACCCCATCTGGAGAACTCAGGGCACACAATATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CAATGACCCCTTCTTCATCGTGGAAACAGTCTGTATTGTATGGTTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CAATGACCCCTTCTTCATCGTGGAAACAGTCTGTATTGTATGGTTTTCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTGAGTTTGTGGTTCGCTGCTTTGCTTGTCCCAGCCAAGCACTCTTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTGAGTTTGTGGTTCGCTGCTTTGCTTGTCCCAGCCAAGCACTCTTCTTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAAAACATCATGAACATCATTGACATTGTCTCCATTTTGCCTTACTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AAAAACATCATGAACATCATTGACATTGTCTCCATTTTGCCTTACTTCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CACACTGGGCACTGACCTGGCCCAGCAACAGGGGGGTGGCAATGGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CACACTGGGCACTGACCTGGCCCAGCAACAGGGGGGTGGCAATGGTCAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGCAGCAGGCCATGTCCTTTGCCATCCTCAGAATCATTCGTCTGGTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGCAGCAGGCCATGTCCTTTGCCATCCTCAGAATCATTCGTCTGGTCCGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GTATTCCGGATCTTCAAACTCTCCAGGCACTCCAAAGGCCTGCAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GTATTCCGGATCTTCAAACTCTCCAGGCACTCCAAAGGCCTGCAGATCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GGGCCACACCCTCAGAGCCAGCATGCGGGAACTGGGCCTTCTGATCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GGGCCACACCCTCAGAGCCAGCATGCGGGAACTGGGCCTTCTGATCTTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 TCCTCTTCATTGGGGTCATCCTCTTTTCTAGTGCTGTGTATTTTGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 TCCTCTTCATTGGGGTCATCCTCTTTTCTAGTGCTGTGTATTTTGCAGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GCGGATGAACCTACTACCCATTTCCAAAGCATCCCAGATGCATTTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GCGGATGAACCTACTACCCATTTCCAAAGCATCCCAGATGCATTTTGGTG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GGCTGTGGTGACCATGACAACTGTGGGCTATGGGGACATGAAGCCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GGCTGTGGTGACCATGACAACTGTGGGCTATGGGGACATGAAGCCCATCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CTGTAGGGGGCAAGATTGTCGGGTCCCTGTGTGCCATTGCGGGTGTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CTGTAGGGGGCAAGATTGTCGGGTCCCTGTGTGCCATTGCGGGTGTCTTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 ACCATTGCTTTGCCAGTGCCAGTGATTGTCTCTAACTTTAACTATTTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 ACCATTGCTTTGCCAGTGCCAGTGATTGTCTCTAACTTTAACTATTTCTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CCACAGAGAGACTGAAAATGAGGAACAGACACAGCTAACGCAGAATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CCACAGAGAGACTGAAAATGAGGAACAGACACAGCTAACGCAGAATGCAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 TCAGTTGTCCATACCTCCCCTCTAATTTGCTCAAGAAATTTCGGAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 TCAGTTGTCCATACCTCCCCTCTAATTTGCTCAAGAAATTTCGGAGCTCT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 ACTTCTTCTTCCCTGGGGGACAAGTCAGAGTATCTAGAGATGGAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 ACTTCTTCTTCCCTGGGGGACAAGTCAGAGTATCTAGAGATGGAAGAAGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 AGTTAAGGAATCTCTGTGTGCAAAGGAGGAGAAGTGTCAGGGAAAGGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 AGTTAAGGAATCTCTGTGTGCAAAGGAGGAGAAGTGTCAGGGAAAGGGGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 ATGACAGTGAGACAGATAAAAACAACTGTTCTAATGCAAAGGCTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 ATGACAGTGAGACAGATAAAAACAACTGTTCTAATGCAAAGGCTGTGGAG

   1950     .
   1951 ACTGATGTG
        |||||||||
 101951 ACTGATGTG