seq1 = pF1KE4179.tfa, 1932 bp
seq2 = pF1KE4179/gi568815575r_21555857.tfa (gi568815575r:21555857_21757788), 201932 bp

>pF1KE4179 1932
>gi568815575r:21555857_21757788 (ChrX)

(complement)

1-1932  (100001-101932)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTACTTCCTGTCTTACTGCAAAGCTCATGGCGGCGCGCTGCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTACTTCCTGTCTTACTGCAAAGCTCATGGCGGCGCGCTGCTCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCTACCAGGCCCTGCGCGCCGAGGGCTTCCTGTGCGACGTGACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCTACCAGGCCCTGCGCGCCGAGGGCTTCCTGTGCGACGTGACACTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACCGAGGGCAGCGAATTCCCGGCGCACAGGTCGCTCCTGGCGTGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACCGAGGGCAGCGAATTCCCGGCGCACAGGTCGCTCCTGGCGTGCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGTGACTACTTCAGGGCCCTGTTCAAGAGCCACACCCAGGAATCCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGTGACTACTTCAGGGCCCTGTTCAAGAGCCACACCCAGGAATCCCGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGCGTGATCCACCTGCACGTGCCATCGGCAGCCGGCCTGCAGCGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGCGTGATCCACCTGCACGTGCCATCGGCAGCCGGCCTGCAGCGCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGACTTCATCTACACTGCCTGGCTGTCGCTTTCCATGGACACTGTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGACTTCATCTACACTGCCTGGCTGTCGCTTTCCATGGACACTGTAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACACTCTGGAGGCCGCCAGCTACCTGCAGGTCACTGAGGCCCTGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACACTCTGGAGGCCGCCAGCTACCTGCAGGTCACTGAGGCCCTGGGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTGTGGGCGCTACTTGGAGCGCCAGCTGGCTCCAGAGAACTGCTGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTGTGGGCGCTACTTGGAGCGCCAGCTGGCTCCAGAGAACTGCTGCTTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGCCAACGTGGCAGCGCGCTTTGGCCTGGCTCACACGCTGGACGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGCCAACGTGGCAGCGCGCTTTGGCCTGGCTCACACGCTGGACGCGGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGCGCTGCATCGTGAGCCACTTGCAGGAGCTGCTGGCGCGGGGCGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGCGCTGCATCGTGAGCCACTTGCAGGAGCTGCTGGCGCGGGGCGCGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCCGCGGGACTCCTGGAGCTCAACCCTACATCGCTGAGGGCTGTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCCGCGGGACTCCTGGAGCTCAACCCTACATCGCTGAGGGCTGTACTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGCCCCCGACGTGGCGCGGGTGCCCGAGGCCCGGCTACTGGGCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGCCCCCGACGTGGCGCGGGTGCCCGAGGCCCGGCTACTGGGCCTGGCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTAGCTTGGTTGCGGCAGGAGCCCACAACTGAGCGCCTGGCACACTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTAGCTTGGTTGCGGCAGGAGCCCACAACTGAGCGCCTGGCACACTGTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGAGTTGCTGGAGCGTGTCCGCTTTGGCCTGGTTCCCGCCGACGTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGAGTTGCTGGAGCGTGTCCGCTTTGGCCTGGTTCCCGCCGACGTACTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGCGCGTGTACTCGGGCTCTGGCCTCGTGCTGCCCGCCCGGGTCAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCGCGTGTACTCGGGCTCTGGCCTCGTGCTGCCCGCCCGGGTCAAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCATCATCCAGGCCCTCAACTACCACACGACGCCCTCCCGCCAGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCATCATCCAGGCCCTCAACTACCACACGACGCCCTCCCGCCAGCCGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATGCAGGGCGAGCAGACCAGCATCCGGAGCCCCCAGACCCGCATCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATGCAGGGCGAGCAGACCAGCATCCGGAGCCCCCAGACCCGCATCTTGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGTGGGGGGGCGCAGGGCACGGGAGGTGGTGATTGAGGAGGTCGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGTGGGGGGGCGCAGGGCACGGGAGGTGGTGATTGAGGAGGTCGCGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCGCAGAGGGCAGCTAGGGGCCAGGTCGCCGCCCCAGAGCCCGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCGCAGAGGGCAGCTAGGGGCCAGGTCGCCGCCCCAGAGCCCGAGGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGAGGAAGAGTTGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGTGGGAGCTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGAGGAAGAGTTGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGTGGGAGCTCACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGAACGTGGTGGCCTTCGATGTGTACAATCACCGCTGGCGCAGCCTTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGAACGTGGTGGCCTTCGATGTGTACAATCACCGCTGGCGCAGCCTTACG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGCTACCCACACCACTGCTGGGGCACAGCGTGTGCACCGCGGGCAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGCTACCCACACCACTGCTGGGGCACAGCGTGTGCACCGCGGGCAACTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CCTGTTTGTCCTGGGTGGGGAGAGCCCTTCCGGCAGTGCATCCTCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CCTGTTTGTCCTGGGTGGGGAGAGCCCTTCCGGCAGTGCATCCTCTCCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TGGCCGACGACTCGCGGGTGGTCACGGCCCAAGTGCACCGTTACGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TGGCCGACGACTCGCGGGTGGTCACGGCCCAAGTGCACCGTTACGACCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 CGCTTCCACGCTTGGACGGAAGTGCCCGCCATGCGGGAAGCGCGGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CGCTTCCACGCTTGGACGGAAGTGCCCGCCATGCGGGAAGCGCGGGCCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CTTCTGGTGCGGCGCGGTGGGCGAGAGGCTCCTGGCCGTCGGGGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CTTCTGGTGCGGCGCGGTGGGCGAGAGGCTCCTGGCCGTCGGGGGCCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GTGCGGGCGGTGAGGTGCTGGCCTCGGTGGAGATGTACGACCTGCGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GTGCGGGCGGTGAGGTGCTGGCCTCGGTGGAGATGTACGACCTGCGTCGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 GACCGCTGGACGGCGGCTGGGGCACTACCGCGGGCTCTGCACGGTCACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 GACCGCTGGACGGCGGCTGGGGCACTACCGCGGGCTCTGCACGGTCACGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GGGGGCCGTCGGGGACCGCGGTGTTGTGTACATCTCGGGGGGCAAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 GGGGGCCGTCGGGGACCGCGGTGTTGTGTACATCTCGGGGGGCAAGGCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GGAGAGGCGAGGGCGGAGCGAGCAGCCTCCGGGACTTATACGTCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GGAGAGGCGAGGGCGGAGCGAGCAGCCTCCGGGACTTATACGTCCTGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 CCTGAGGAGCAGGTTTGGAGCAAGAAGGCACCCATGGGCACCGCACGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 CCTGAGGAGCAGGTTTGGAGCAAGAAGGCACCCATGGGCACCGCACGTTT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 CGGGCACCACATGGCAGTGCTGCGCGGCGCTGTGTTTGCTTTTCTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 CGGGCACCACATGGCAGTGCTGCGCGGCGCTGTGTTTGCTTTTCTGGGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 GATACGAGCCCTTCTCTGAGATCGAGCGCTACGACCCCGGCGCCGACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 GATACGAGCCCTTCTCTGAGATCGAGCGCTACGACCCCGGCGCCGACCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TGGACTCGGTTGCGGCCGCTGCCCTACGACCGCTTCTGCTATGGGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TGGACTCGGTTGCGGCCGCTGCCCTACGACCGCTTCTGCTATGGGCTGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CGTGGTCGAGGAGACAGCGTTGCTGCTGGGCGGCCTCAAGTGGCGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CGTGGTCGAGGAGACAGCGTTGCTGCTGGGCGGCCTCAAGTGGCGGGACT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CGCGCCAGGTGCCTACCCGCAACGTAGTGGGCTACGACCTCGACCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CGCGCCAGGTGCCTACCCGCAACGTAGTGGGCTACGACCTCGACCTGGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 CGTTGGGAGGACATCGGCTGCGCGTTGCCCTGGGCCTGGAGCGGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 CGTTGGGAGGACATCGGCTGCGCGTTGCCCTGGGCCTGGAGCGGCCTGCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 GTGCGCAGTGCTGCAGCTGGCCGAGGGTGGGGACGACGAGAGGGAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 GTGCGCAGTGCTGCAGCTGGCCGAGGGTGGGGACGACGAGAGGGAGGGAG

   1900     .    :    .    :    .    :
   1901 AGGTTGGAGAGGCGCTAGATTTGGTGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 AGGTTGGAGAGGCGCTAGATTTGGTGCTGGGC