seq1 = pF1KE4170.tfa, 1863 bp
seq2 = pF1KE4170/gi568815592r_98774281.tfa (gi568815592r:98774281_99026988), 252708 bp

>pF1KE4170 1863
>gi568815592r:98774281_99026988 (Chr6)

(complement)

1-512  (100001-100512)   100% ->
513-858  (109270-109615)   99% ->
859-1103  (121319-121563)   100% ->
1104-1317  (127508-127721)   100% ->
1318-1389  (146365-146436)   100% ->
1390-1702  (151262-151574)   100% ->
1703-1863  (152548-152708)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATGCCTTCGGCGCCGAGCCAGGACAGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATGCCTTCGGCGCCGAGCCAGGACAGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCATAGAGCTATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCATAGAGCTATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCATTATGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCATTATGGAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGAATAGTATGTCCTATACTATGTGGAATTTGGCTGGTGTACCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGAATAGTATGTCCTATACTATGTGGAATTTGGCTGGTGTACCAAATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TATTCCCAAGTTCTGGTGACTTTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAACTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TATTCCCAAGTTCTGGTGACTTTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAACTTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGACATGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGACATGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCCACCTAATTTTCAGAGCCAGGACTATGTGGAACTTACTTTTGAACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCCACCTAATTTTCAGAGCCAGGACTATGTGGAACTTACTTTTGAACAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGAAACCTATCATCCCGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGAAACCTATCATCCCGGAGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCATTAGAATTCTCGCTTGTTCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCATTAGAATTCTCGCTTGTTCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGCTGAAGTAAG         ATGGGAGATTCTTTGGTCAGAGAGACCTA
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGCTGAAGTAAGGTA...CAGATGGGAGATTCTTTGGTCAGAGAGACCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGAAGGTGAATGCTTCCCAAGCTCGCCAGTTCAAACCTTGTATTAAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 109299 CGAAGGTGAATGCTTCCCAAGCTCGCCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATAAATTTCCCCACAAATCTTATACGACTGGAAGTAAATAGTTCTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109349 ATAAATTTCCCCACAAATCTTATACGACTGGAAGTAAATAGTTCTCTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGAATATTACACTGAATTAGATGCAGTTGTGCTACATGGTGTGAAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109399 GGAATATTACACTGAATTAGATGCAGTTGTGCTACATGGTGTGAAGGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AGCCAGTGCTTTCTCTCAAGACTTCACTTATTGACATGAATGATATAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109449 AGCCAGTGCTTTCTCTCAAGACTTCACTTATTGACATGAATGATATAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109499 GATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCGGGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109549 AAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCGGGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ATAAACTACCTTATGAG         CTTATTCAGCTGATTCTGAATCAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 109599 ATAAACTACCTTATGAGGTA...TAGCTTATTCAGCTGATTCTGAATCAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CTTACACTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121343 CTTACACTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACATCCACCTCAATCTGCAACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121393 CCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACATCCACCTCAATCTGCAACCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121443 ACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ACTCTTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121493 ACTCTTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTCTGTTGCAGGATTTAGCAG         GTTTCTGAAGGTTTGTGGAT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 121543 CTCTGTTGCAGGATTTAGCAGGTT...CAGGTTTCTGAAGGTTTGTGGAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 CCGAATTAGTACGCCTTGAATTGTCTTGCAGCCACTTTCTTAATGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127528 CCGAATTAGTACGCCTTGAATTGTCTTGCAGCCACTTTCTTAATGAAACT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 TGCTTAGAAGTTATTTCTGAGATGTGTCCAAATCTACAGGCCTTAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127578 TGCTTAGAAGTTATTTCTGAGATGTGTCCAAATCTACAGGCCTTAAATCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CTCCTCCTGTGATAAGCTACCACCTCAAGCTTTCAACCACATTGCCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127628 CTCCTCCTGTGATAAGCTACCACCTCAAGCTTTCAACCACATTGCCAAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TATGCAGCCTTAAACGACTTGTTCTCTATCGAACAAAAGTAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 127678 TATGCAGCCTTAAACGACTTGTTCTCTATCGAACAAAAGTAGAGGTG...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1318    CAAACAGCACTGCTCAGCATTTTGAACTTCTGTTCAGAGCTTCAGCA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146362 CAGCAAACAGCACTGCTCAGCATTTTGAACTTCTGTTCAGAGCTTCAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CCTCAGTTTAGGCAGTTGTGTCATG         ATTGAAGACTATGATG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 146412 CCTCAGTTTAGGCAGTTGTGTCATGGTA...CAGATTGAAGACTATGATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 TGATAGCTAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAAACTCCGGACCCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151278 TGATAGCTAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAAACTCCGGACCCTGGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CTGTGGAGATGTAAGAATATTACTGAGAATGGAATAGCAGAACTGGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151328 CTGTGGAGATGTAAGAATATTACTGAGAATGGAATAGCAGAACTGGCTTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TGGGTGTCCACTACTGGAGGAGCTTGACCTTGGCTGGTGCCCAACTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151378 TGGGTGTCCACTACTGGAGGAGCTTGACCTTGGCTGGTGCCCAACTCTGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 AGAGCAGCACCGGGTGCTTCACCAGACTGGCACACCAGCTCCCAAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151428 AGAGCAGCACCGGGTGCTTCACCAGACTGGCACACCAGCTCCCAAACTTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1606 CAAAAACTCTTTCTTACAGCTAATAGATCTGTGTGTGACACAGACATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151478 CAAAAACTCTTTCTTACAGCTAATAGATCTGTGTGTGACACAGACATTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1656 TGAATTGGCATGTAATTGTACCAGGTTACAGCAGCTGGACATATTAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 151528 TGAATTGGCATGTAATTGTACCAGGTTACAGCAGCTGGACATATTAGGTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1703       GAACAAGAATGGTAAGTCCGGCATCCTTAAGAAAACTCCTGGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151578 ...TAGGAACAAGAATGGTAAGTCCGGCATCCTTAAGAAAACTCCTGGAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1747 TCTTGTAAAGATCTTTCTTTACTTGATGTGTCCTTCTGTTCGCAGATTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152592 TCTTGTAAAGATCTTTCTTTACTTGATGTGTCCTTCTGTTCGCAGATTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1797 TAACAGAGCTGTGCTAGAACTGAATGCAAGCTTTCCAAAAGTGTTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152642 TAACAGAGCTGTGCTAGAACTGAATGCAAGCTTTCCAAAAGTGTTCATAA

   1900     .    :    .
   1847 AAAAGAGCTTTACTCAG
        |||||||||||||||||
 152692 AAAAGAGCTTTACTCAG