seq1 = pF1KE4167.tfa, 1857 bp
seq2 = pF1KE4167/gi568815580r_47929263.tfa (gi568815580r:47929263_48141107), 211845 bp

>pF1KE4167 1857
>gi568815580r:47929263_48141107 (Chr18)

(complement)

1-1208  (100001-101208)   100% ->
1209-1857  (111197-111845)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCAATGACATTGATGAGCTCATTGGCATTCCCTTCCCCAACCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCAATGACATTGATGAGCTCATTGGCATTCCCTTCCCCAACCACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGTGAGGTCCTGTGCAGCCTCAATGAGCAACGGCACGATGGCCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGTGAGGTCCTGTGCAGCCTCAATGAGCAACGGCACGATGGCCTGCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GTGACGTGCTCCTGGTGGTGCAGGAGCAGGAGTATCGGACCCACCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GTGACGTGCTCCTGGTGGTGCAGGAGCAGGAGTATCGGACCCACCGCTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTCCTGGCTGCCTGCAGCAAGTACTTCAAGAAGCTTTTCACAGCCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTCCTGGCTGCCTGCAGCAAGTACTTCAAGAAGCTTTTCACAGCCGGCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTAGCCAGCCAGCCCTACGTCTATGAGATCGACTTTGTCCAGCCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTAGCCAGCCAGCCCTACGTCTATGAGATCGACTTTGTCCAGCCTGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTCTGGCTGCTATCCTGGAGTTCGCCTACACCTCCACGCTCACCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTCTGGCTGCTATCCTGGAGTTCGCCTACACCTCCACGCTCACCATCACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCTGGCAATGTCAAGCACATCCTCAACGCAGCCAGGATGCTGGAGATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCTGGCAATGTCAAGCACATCCTCAACGCAGCCAGGATGCTGGAGATCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGCATCGTGAACGTGTGCCTGGAGATCATGGAGCCTGGGGGGGACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTGCATCGTGAACGTGTGCCTGGAGATCATGGAGCCTGGGGGGGACGGGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGAGGAGGATGACAAGGAGGACGATGACGACGACGAAGATGATGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGAGGAGGATGACAAGGAGGACGATGACGACGACGAAGATGATGATGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGGAGGACGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGATGACGATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGGAGGACGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGATGACGATGATGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACGGAGGACTTTGCTGACCAAGAAAACTTGCCTGACCCCCAGGACATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACGGAGGACTTTGCTGACCAAGAAAACTTGCCTGACCCCCAGGACATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTGCCACCAAAGCCCTTCCAAGACAGACCATCTCACAGAGAAGGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTGCCACCAAAGCCCTTCCAAGACAGACCATCTCACAGAGAAGGCCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCAGACACCCCCAGGGACTTCCCTGACTCCTTCCAGGCTGGCAGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCAGACACCCCCAGGGACTTCCCTGACTCCTTCCAGGCTGGCAGTCCTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCATCTGGGGGTGATCCGGGACTTCTCCATCGAATCTCTGCTAAGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCATCTGGGGGTGATCCGGGACTTCTCCATCGAATCTCTGCTAAGGGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCTGTACCCCAAGGCCAACATCCCCGACAGGAGACCCTCCTTGTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCTGTACCCCAAGGCCAACATCCCCGACAGGAGACCCTCCTTGTCTCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCGCCCCGGACTTCTTTCCACACCTCTGGCCAGGGGACTTCGGTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCGCCCCGGACTTCTTTCCACACCTCTGGCCAGGGGACTTCGGTGCCTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGCCCAGCTGCCTGAGCAGCCCATGGACAGTGGGCCACTGGATCTGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGCCCAGCTGCCTGAGCAGCCCATGGACAGTGGGCCACTGGATCTGGTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCAAGAATCGGAAGATCAAGGAGGAGGAGAAGGAGGAGCTGCCCCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCAAGAATCGGAAGATCAAGGAGGAGGAGAAGGAGGAGCTGCCCCCACCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCACCGCCACCCTTCCCTAATGACTTCTTCAAGGACATGTTCCCTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCACCGCCACCCTTCCCTAATGACTTCTTCAAGGACATGTTCCCTGACCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCCGGGGGGGCCTCTGGGACCCATCAAGGCGGAGAACGACTACGGTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCCGGGGGGGCCTCTGGGACCCATCAAGGCGGAGAACGACTACGGTGCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ATCTCAACTTCCTGAGTGCCACCCACCTGGGAGGCCTCTTCCCACCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ATCTCAACTTCCTGAGTGCCACCCACCTGGGAGGCCTCTTCCCACCCTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CCCCTGGTAGAAGAGCGCAAGCTGAAGCCCAAGGCCTCTCAGCAGTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CCCCTGGTAGAAGAGCGCAAGCTGAAGCCCAAGGCCTCTCAGCAGTGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CATCTGCCACAAAGTCATCATGGGGGCCGGGAAGCTGCCGCGGCACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CATCTGCCACAAAGTCATCATGGGGGCCGGGAAGCTGCCGCGGCACATGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGACCCATACCGGGGAGAAGCCATACATGTGCACCATCTGCGAGGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GGACCCATACCGGGGAGAAGCCATACATGTGCACCATCTGCGAGGTCCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTCACCAG         GCAGGACAAGCTGAAAATCCACATGCGGAAGCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TTCACCAGGTG...CAGGCAGGACAAGCTGAAAATCCACATGCGGAAGCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CACAGGGGAGCGGCCCTACCTGTGCATCCACTGCAACGCCAAGTTCGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111230 CACAGGGGAGCGGCCCTACCTGTGCATCCACTGCAACGCCAAGTTCGTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 ACAACTACGACCTCAAGAACCACATGCGCATCCACACGGGCGTGCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111280 ACAACTACGACCTCAAGAACCACATGCGCATCCACACGGGCGTGCGGCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TACCAGTGCGAGTTCTGCTACAAGAGCTTCACGCGCTCTGACCACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111330 TACCAGTGCGAGTTCTGCTACAAGAGCTTCACGCGCTCTGACCACCTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CCGCCACATCAAGCGCCAGAGCTGCCGCATGGCACGGCCCCGACGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111380 CCGCCACATCAAGCGCCAGAGCTGCCGCATGGCACGGCCCCGACGCGGCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 GCAAGCCTGCTGCGTGGAGGGCCGCCAGCCTGCTCTTCGGGCCCGGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111430 GCAAGCCTGCTGCGTGGAGGGCCGCCAGCCTGCTCTTCGGGCCCGGCGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 CCGGCCCCCGACAAGGCGGCCTTCGTGATGCCCCCTGCGCTGGGCGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111480 CCGGCCCCCGACAAGGCGGCCTTCGTGATGCCCCCTGCGCTGGGCGAGGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 GGGCGGCCACCTGGGCGGCGCAGCTGTGTGCCTCCCGGGCCCCAGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111530 GGGCGGCCACCTGGGCGGCGCAGCTGTGTGCCTCCCGGGCCCCAGCCCCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 CCAAGCACTTCCTGGCAGCGCCCAAGGGCGCCCTGAGCCTGCAAGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111580 CCAAGCACTTCCTGGCAGCGCCCAAGGGCGCCCTGAGCCTGCAAGAGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 GAGCGGCAGTTCGAGGAGACACAGATGAAGCTGTTCGGGCGCGCGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111630 GAGCGGCAGTTCGAGGAGACACAGATGAAGCTGTTCGGGCGCGCGCAGCT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 GGAGGCCGAGAGGAACGCGGGGGGCCTCCTGGCCTTCGCGCTGGCCGAGA
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111680 GGAGGCTGAGAGGAACGCGGGGGGCCTCCTGGCCTTCGCGCTGGCCGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 ACGTGGCGGCGGCGCGGCCCTACTTCCCGCTGCCCGACCCTTGGGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111730 ACGTGGCGGCGGCGCGGCCCTACTTCCCGCTGCCCGACCCTTGGGCCGCC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1792 GGCCTGGCCGGCCTCCCTGGGCTCGCCGGCCTCAACCACGTGGCCTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111780 GGCCTGGCCGGCCTCCCTGGGCTCGCCGGCCTCAACCACGTGGCCTCCAT

   1850     .    :    .
   1842 GTCCGAAGCCAACAAC
        ||||||||||||||||
 111830 GTCCGAAGCCAACAAC