seq1 = pF1KE4164.tfa, 1824 bp
seq2 = pF1KE4164/gi568815587r_105952853.tfa (gi568815587r:105952853_106159085), 206233 bp

>pF1KE4164 1824
>gi568815587r:105952853_106159085 (Chr11)

(complement)

1-221  (100001-100221)   100% ->
222-1824  (104631-106233)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATAATTCATATGCTTTCAATCAACGAAGCACATGTAATGGAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATAATTCATATGCTTTCAATCAACGAAGCACATGTAATGGAATTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTGAGAAGAAAAACAACTTCCTTGTATCAGAAGATCATGGACAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCTGAGAAGAAAAACAACTTCCTTGTATCAGAAGATCATGGACAAAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTAAGTGTACTACAGAATTTTAGAGAACAAAATGTCTTTTATGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTAAGTGTACTACAGAATTTTAGAGAACAAAATGTCTTTTATGATTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAATAATTATGAAAGATGAAATAATCCCGTGTCATCGTTGTGTGTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAAATAATTATGAAAGATGAAATAATCCCGTGTCATCGTTGTGTGTTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCATGCAGTGACTTTTTCAG         GGCTATGTTTGAAGTAAACA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100201 AGCATGCAGTGACTTTTTCAGGTA...CAGGGCTATGTTTGAAGTAAACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGAAAGAAAGAGATGATGGAAGTGTTACCATTACTAATTTGTCCTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104651 TGAAAGAAAGAGATGATGGAAGTGTTACCATTACTAATTTGTCCTCCAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCAGTAAAAGCATTTCTCGATTATGCCTATACTGGAAAAACAAAAATAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104701 GCAGTAAAAGCATTTCTCGATTATGCCTATACTGGAAAAACAAAAATAAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGATGATAATGTGGAAATGTTCTTCCAGTTGTCATCATTTCTTCAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104751 AGATGATAATGTGGAAATGTTCTTCCAGTTGTCATCATTTCTTCAAGTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CCTTCCTATCCAAAGCTTGCAGTGACTTTTTAATAAAAAGTATTAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104801 CCTTCCTATCCAAAGCTTGCAGTGACTTTTTAATAAAAAGTATTAATCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GTCAATTGTTTACAGTTATTATCTATATCAGATAGCTATGGCTCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104851 GTCAATTGTTTACAGTTATTATCTATATCAGATAGCTATGGCTCCACCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TTTGTTTGATCATGCATTACACTTTGTACAACATCACTTTTCTTTATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104901 TTTGTTTGATCATGCATTACACTTTGTACAACATCACTTTTCTTTATTAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTAAATCCAGTGATTTCTTAGAGATGAATTTTGGAGTACTACAGAAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104951 TTAAATCCAGTGATTTCTTAGAGATGAATTTTGGAGTACTACAGAAATGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CTGGAATCAGATGAATTAAATGTTCCTGAAGAAGAAATGGTACTGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105001 CTGGAATCAGATGAATTAAATGTTCCTGAAGAAGAAATGGTACTGAAAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGTCCTTAGTTGGACTAAACATAACTTAGAATCAAGGCAAAAGTATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105051 TGTCCTTAGTTGGACTAAACATAACTTAGAATCAAGGCAAAAGTATCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CTCATTTGATTGAAAAAGTGAGATTACATCAGTTATCTGAGGAGACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105101 CTCATTTGATTGAAAAAGTGAGATTACATCAGTTATCTGAGGAGACACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CAGGACTGTCTGTTCAATGAAGAGAGTTTACTCAAAAGCACAAACTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105151 CAGGACTGTCTGTTCAATGAAGAGAGTTTACTCAAAAGCACAAACTGTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TGACATAATCATGGATGCAATTAAGTGTGTGCAAGGTTCTGGTGGACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105201 TGACATAATCATGGATGCAATTAAGTGTGTGCAAGGTTCTGGTGGACTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCCCTGATGCTCGACCATCCACAACTGAGAAATACATATTCATTCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105251 TCCCTGATGCTCGACCATCCACAACTGAGAAATACATATTCATTCACAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ACTGAGGAAAATGGAGAAAATCAATATACATTTTGCTATAACATTAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105301 ACTGAGGAAAATGGAGAAAATCAATATACATTTTGCTATAACATTAAATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TGATTCATGGAAAATACTGCCGCAATCACACCTGATTGATTTGCCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105351 TGATTCATGGAAAATACTGCCGCAATCACACCTGATTGATTTGCCAGGAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CTAGTCTTTCGAGTTACGGAGAGAAAATATTCTTGACAGGTGGTTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105401 CTAGTCTTTCGAGTTACGGAGAGAAAATATTCTTGACAGGTGGTTGCAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 GGGAAATGTTGTCGAACGGTTCGACTGCATATTGCCGAGTCATATCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105451 GGGAAATGTTGTCGAACGGTTCGACTGCATATTGCCGAGTCATATCATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 TGCCACTGATCAAACCTGGTGCTACTGTCCAGTGAAAAATGATTTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105501 TGCCACTGATCAAACCTGGTGCTACTGTCCAGTGAAAAATGATTTCTTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TGGTATCAACTATGAAAACACCAAGAACCATGCATACATCAGTTATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105551 TGGTATCAACTATGAAAACACCAAGAACCATGCATACATCAGTTATGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CTCGATAGATTATTTGTCATAGGTGGAAAAACTAGAGGATCCCGGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105601 CTCGATAGATTATTTGTCATAGGTGGAAAAACTAGAGGATCCCGGGACAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 TAAAAGTCTCTTAGATGTTGAATCTTACAATCCTCTTTCCAAAGAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105651 TAAAAGTCTCTTAGATGTTGAATCTTACAATCCTCTTTCCAAAGAATGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 TATCTGTTAGCCCATTACCCAGAGGCATATACTATCCAGAAGCAAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105701 TATCTGTTAGCCCATTACCCAGAGGCATATACTATCCAGAAGCAAGCACA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 TGCCAAAATGTAATTTATGTTCTTGGATCAGAGGTAGAGATTACAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105751 TGCCAAAATGTAATTTATGTTCTTGGATCAGAGGTAGAGATTACAGATGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 TTTTAACCCATCACTTGATTGCTTTTTTAAATACAATGCTACAACTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105801 TTTTAACCCATCACTTGATTGCTTTTTTAAATACAATGCTACAACTGATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1442 AGTGGTCTGAACTAGTAGCAGAGTTTGGGCAATTTTTTCATGCAACATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105851 AGTGGTCTGAACTAGTAGCAGAGTTTGGGCAATTTTTTCATGCAACATTA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1492 ATTAAAGCTGTACCAGTAAACTGTACACTGTATATATGTGACCTTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105901 ATTAAAGCTGTACCAGTAAACTGTACACTGTATATATGTGACCTTTCCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1542 CTATAAGGTTTATAGTTTTTGTCCAGACACTTGTGTTTGGAAAGGCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105951 CTATAAGGTTTATAGTTTTTGTCCAGACACTTGTGTTTGGAAAGGCGAAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1592 GATCTTTTGAGTGTGCAGGCTTTAATGCAGGTGCAATTGGAATTGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106001 GATCTTTTGAGTGTGCAGGCTTTAATGCAGGTGCAATTGGAATTGAAGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1642 AAAATTTATATATTAGGTGGTGATTATGCACCAGATGAAATCACAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106051 AAAATTTATATATTAGGTGGTGATTATGCACCAGATGAAATCACAGATGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1692 AGTGCAGGTCTACCACAGCAACAGGTCTGAATGGGAAGAAGTTTCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106101 AGTGCAGGTCTACCACAGCAACAGGTCTGAATGGGAAGAAGTTTCACCAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1742 TGCCTAGAGCCTTAACAGAATTTTACTGCCAGGTGATTCAGTTTAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106151 TGCCTAGAGCCTTAACAGAATTTTACTGCCAGGTGATTCAGTTTAATAAA

   1800     .    :    .    :    .    :
   1792 TACAGAGACCCATGGTTTTCTAATCTATGTGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 106201 TACAGAGACCCATGGTTTTCTAATCTATGTGCT