seq1 = pF1KE4157.tfa, 1791 bp
seq2 = pF1KE4157/gi568815582f_81215114.tfa (gi568815582f:81215114_81477593), 262480 bp

>pF1KE4157 1791
>gi568815582f:81215114_81477593 (Chr16)

1-167  (100001-100167)   100% ->
168-282  (136470-136584)   100% ->
283-633  (139292-139642)   100% ->
634-851  (141672-141889)   100% ->
852-973  (142697-142818)   100% ->
974-1086  (147386-147498)   100% ->
1087-1236  (148681-148830)   100% ->
1237-1373  (149861-149997)   100% ->
1374-1502  (150237-150365)   100% ->
1503-1612  (162106-162215)   100% ->
1613-1791  (162302-162480)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGAGGGCAGTGCCGTGTCTGACCCTCAGCACGCCGCGCGTCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGAGGGCAGTGCCGTGTCTGACCCTCAGCACGCCGCGCGTCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGAGCGCTCAGCTCTTTCCGCGAGGAGTCTCGCTTCTGCGACGCGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGAGCGCTCAGCTCTTTCCGCGAGGAGTCTCGCTTCTGCGACGCGCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTCCTCGACGGGGAGGAGATCCCGGTGCAGAAGAACATCCTGGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTCCTCGACGGGGAGGAGATCCCGGTGCAGAAGAACATCCTGGCGGCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCAGCCCGTACATCAG         GACAAAGTTAAACTATAATCCTCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCAGCCCGTACATCAGGTG...TAGGACAAAGTTAAACTATAATCCTCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AAAAGATGATGGATCAACTTATAAGATTGAACTTGAAGGGATATCGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136494 AAAAGATGATGGATCAACTTATAAGATTGAACTTGAAGGGATATCGGTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGTTATGAGAGAGATCCTGGATTACATCTTCAGTGGGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 136544 TGGTTATGAGAGAGATCCTGGATTACATCTTCAGTGGGCAGGTA...TAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCAGGCTAAATGAAGATACAATCCAAGATGTTGTTCAGGCAGCTGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139292 ATCAGGCTAAATGAAGATACAATCCAAGATGTTGTTCAGGCAGCTGACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCTGCTACTGACGGACCTTAAAACCCTGTGCTGTGAGTTTTTGGAAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139342 GCTGCTACTGACGGACCTTAAAACCCTGTGCTGTGAGTTTTTGGAAGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCATTGCTGCTGAGAACTGTATTGGTATCCGTGACTTTGCACTACATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139392 GCATTGCTGCTGAGAACTGTATTGGTATCCGTGACTTTGCACTACATTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGCCTCCATCACGTTCATTACCTTGCCACAGAATACCTGGAGACTCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139442 TGCCTCCATCACGTTCATTACCTTGCCACAGAATACCTGGAGACTCATTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCGAGACGTCAGCAGCACGGAAGAATTCTTAGAGCTGAGTCCTCAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139492 CCGAGACGTCAGCAGCACGGAAGAATTCTTAGAGCTGAGTCCTCAAAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTAAAGAAGTGATTTCTCTTGAGAAGTTAAACGTTGGCAATGAAAGATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139542 TTAAAGAAGTGATTTCTCTTGAGAAGTTAAACGTTGGCAATGAAAGATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTCTTTGAAGCAGTAATTCGATGGATAGCACATGATACAGAAATAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139592 GTCTTTGAAGCAGTAATTCGATGGATAGCACATGATACAGAAATAAGAAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 G         GTCCACATGAAGGATGTTATGTCAGCTCTGTGGGTTTCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139642 GGTA...CAGGTCCACATGAAGGATGTTATGTCAGCTCTGTGGGTTTCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GGTTGGACTCCAGTTATTTACGGGAACAGATGCTGAATGAACCATTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141712 GGTTGGACTCCAGTTATTTACGGGAACAGATGCTGAATGAACCATTAGTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGAGAAATTGTCAAAGAGTGTAGCAATATACCGCTCAGCCAGCCGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141762 CGAGAAATTGTCAAAGAGTGTAGCAATATACCGCTCAGCCAGCCGCAGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGGGGAGGCGATGCTGGCCAACTTCAAACCCCGGGGCTACTCTGAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141812 AGGGGAGGCGATGCTGGCCAACTTCAAACCCCGGGGCTACTCTGAGTGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TCGTGACTGTTGGTGGAGAAGAGAGAGT         TTCACGGAAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 141862 TCGTGACTGTTGGTGGAGAAGAGAGAGTGTA...TAGTTCACGGAAACCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 ACAGCAGCGATGCGATGCATGTGCCCTCTCTATGACCCTAACAGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142710 ACAGCAGCGATGCGATGCATGTGCCCTCTCTATGACCCTAACAGGCAGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 TTGGATCGAACTGGCCCCTTTAAGCATGCCGAGAATTAACCATGGAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142760 TTGGATCGAACTGGCCCCTTTAAGCATGCCGAGAATTAACCATGGAGTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TCTCAGCAG         AAGGATTTTTGTTTGTATTCGGGGGCCAAGAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 142810 TCTCAGCAGGTA...CAGAAGGATTTTTGTTTGTATTCGGGGGCCAAGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GAAAATAAGCAGACTCTTAGCTCAGGAGAAAAGTATGATCCAGATGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147418 GAAAATAAGCAGACTCTTAGCTCAGGAGAAAAGTATGATCCAGATGCAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 TACATGGACAGCATTGCCACCTATGAACGAG         GCAAGACATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 147468 TACATGGACAGCATTGCCACCTATGAACGAGGTA...CAGGCAAGACATA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 ACTTCGGAATTGTGGAGATAGATGGGATGCTGTACATTTTGGGAGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148691 ACTTCGGAATTGTGGAGATAGATGGGATGCTGTACATTTTGGGAGGAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GATGGTGAAAAGGAGCTGATTTCCATGGAGTGTTACGATATTTATTCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148741 GATGGTGAAAAGGAGCTGATTTCCATGGAGTGTTACGATATTTATTCTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 AACCTGGACAAAGCAACCTGATTTGACCATGGTCAGAAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 148791 AACCTGGACAAAGCAACCTGATTTGACCATGGTCAGAAAGGTG...CAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TCGGCTGCTATGCAGCTATGAAAAAGAAAATCTACGCCATGGGTGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149862 TCGGCTGCTATGCAGCTATGAAAAAGAAAATCTACGCCATGGGTGGAGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 TCCTACGGAAAGCTTTTTGAGTCTGTAGAGTGTTATGATCCCAGGACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149912 TCCTACGGAAAGCTTTTTGAGTCTGTAGAGTGTTATGATCCCAGGACCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 GCAGTGGACTGCCATATGTCCACTAAAAGAGAGGAG         GTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 149962 GCAGTGGACTGCCATATGTCCACTAAAAGAGAGGAGGTA...CAGGTTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 GAGCGGTGGCCTGTGGAGTTGCTATGGAGCTGTATGTGTTTGGGGGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150242 GAGCGGTGGCCTGTGGAGTTGCTATGGAGCTGTATGTGTTTGGGGGAGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CGAAGTCGTGAGGACGCCCAGGGTAGCGAGATGGTAACTTGCAAGTCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150292 CGAAGTCGTGAGGACGCCCAGGGTAGCGAGATGGTAACTTGCAAGTCCGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1479 GTTCTACCATGATGAGTTTAAAAG         GTGGATCTATCTTAACG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 150342 GTTCTACCATGATGAGTTTAAAAGGTA...CAGGTGGATCTATCTTAACG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 ACCAGAATTTATGCATCCCCGCCAGTTCCTCTTTTGTTTATGGAGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162123 ACCAGAATTTATGCATCCCCGCCAGTTCCTCTTTTGTTTATGGAGCTGTA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 CCTATAGGAGCCAGTATTTATGTTATTGGAGATCTTGATACAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 162173 CCTATAGGAGCCAGTATTTATGTTATTGGAGATCTTGATACAGGTA...T

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1613   GTACCAATTACGACTACGTGCGTGAGTTTAAAAGAAGCACAGGAACCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162300 AGGTACCAATTACGACTACGTGCGTGAGTTTAAAAGAAGCACAGGAACCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 GGCACCACACTAAACCACTCCTTCCATCCGACCTTCGCCGTACAGGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162350 GGCACCACACTAAACCACTCCTTCCATCCGACCTTCGCCGTACAGGATGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 GCAGCCTTACGCATTGCGAATTGCAAGCTTTTCCGCCTGCAGCTTCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162400 GCAGCCTTACGCATTGCGAATTGCAAGCTTTTCCGCCTGCAGCTTCAGCA

   1850     .    :    .    :    .    :
   1761 AGGCTTATTCCGTATTCGTGTTCATTCCCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 162450 AGGCTTATTCCGTATTCGTGTTCATTCCCCT