seq1 = pF1KE4150.tfa, 1755 bp
seq2 = pF1KE4150/gi568815584r_44829031.tfa (gi568815584r:44829031_45060928), 231898 bp

>pF1KE4150 1755
>gi568815584r:44829031_45060928 (Chr14)

(complement)

1-42  (100001-100042)   100% ->
43-941  (115001-115899)   100% ->
942-1385  (126371-126814)   100% ->
1386-1594  (129388-129596)   100% ->
1595-1755  (131738-131898)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACTTCAAATGCAAGTATTCCTACCCTGCTCTGTACCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 100001 ATGCACTTCAAATGCAAGTATTCCTACCCTGCTCTGTACCAGGTG...TA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     43  ATGGACCACACATCCCCGACCTACATGCTTGCTAACTTAACCCACTTGC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115000 GATGGACCACACATCCCCGACCTACATGCTTGCTAACTTAACCCACTTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTCTGAACAACTTCTGCAGGGCTTGAATCTTCTTCGCCAACATCACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115050 ATTCTGAACAACTTCTGCAGGGCTTGAATCTTCTTCGCCAACATCACGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCTGTGACATCATTCTTCGAGTAGGTGATGTTAAAATTCATGCTCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115100 CTCTGTGACATCATTCTTCGAGTAGGTGATGTTAAAATTCATGCTCACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGTGGTACTTGCCAGCGTCAGCCCGTATTTCAAAGCTATGTTCACTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115150 AGTGGTACTTGCCAGCGTCAGCCCGTATTTCAAAGCTATGTTCACTGGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACCTTTCTGAAAAAGAGAACAGTGAGGTTGAGTTTCAATGCATTGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115200 ACCTTTCTGAAAAAGAGAACAGTGAGGTTGAGTTTCAATGCATTGATGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ACTGCTCTCCAGGCCATTGTGGAGTATGCCTATACAGGGACTGTTTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115250 ACTGCTCTCCAGGCCATTGTGGAGTATGCCTATACAGGGACTGTTTTTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TTCTCAGGACACAGTTGAATCTCTCCTGCCAGCAGCAAACCTACTCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115300 TTCTCAGGACACAGTTGAATCTCTCCTGCCAGCAGCAAACCTACTCCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TAAAACTTGTCCTGAAAGAATGTTGTGCATTTCTTGAAAGCCAACTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115350 TAAAACTTGTCCTGAAAGAATGTTGTGCATTTCTTGAAAGCCAACTTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CCTGGTAATTGTATTGGAATTTCTCGTTTTGCAGAAACATATGGTTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115400 CCTGGTAATTGTATTGGAATTTCTCGTTTTGCAGAAACATATGGTTGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TGACCTTTATTTGGCAGCCACTAAATACATATGCCAGAATTTTGAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115450 TGACCTTTATTTGGCAGCCACTAAATACATATGCCAGAATTTTGAAGCTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TTTGCCAGACTGAAGAGTTTTTTGAGCTTACACATGCTGACTTGGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115500 TTTGCCAGACTGAAGAGTTTTTTGAGCTTACACATGCTGACTTGGATGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 ATTGTTTCCAATGACTGTTTGAATGTAGCTACCGAAGAGACTGTTTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115550 ATTGTTTCCAATGACTGTTTGAATGTAGCTACCGAAGAGACTGTTTTTTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGCATTAGAGTCTTGGATCAAGTATGATGTACAAGAACGCCAGAAATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115600 TGCATTAGAGTCTTGGATCAAGTATGATGTACAAGAACGCCAGAAATACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TAGCACAGTTACTAAACAGTGTACGATTACCATTGTTGAGTGTTAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115650 TAGCACAGTTACTAAACAGTGTACGATTACCATTGTTGAGTGTTAAGTTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTCACTAGACTATATGAAGCAAATCATCTTATTCGTGATGATCGCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115700 CTCACTAGACTATATGAAGCAAATCATCTTATTCGTGATGATCGCACTTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TAAACATCTTTTGAATGAAGCCCTAAAGTACCACTTTATGCCTGAACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115750 TAAACATCTTTTGAATGAAGCCCTAAAGTACCACTTTATGCCTGAACATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GACTCTCTCATCAGACAGTCTTGATGACACGACCTCGCTGTGCTCCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115800 GACTCTCTCATCAGACAGTCTTGATGACACGACCTCGCTGTGCTCCCAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GTACTTTGTGCAGTAGGAGGGAAATCTGGACTCTTTGCCTGTTTGGATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115850 GTACTTTGTGCAGTAGGAGGGAAATCTGGACTCTTTGCCTGTTTGGATAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942          TGTGGAGATGTACTTTCCTCAGAATGACTCTTGGATTGGTT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115900 GTA...TAGTGTGGAGATGTACTTTCCTCAGAATGACTCTTGGATTGGTT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGGCACCCCTAAACATTCCTCGCTATGAATTTGGAATATGCGTTTTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126412 TGGCACCCCTAAACATTCCTCGCTATGAATTTGGAATATGCGTTTTAGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CAAAAAGTATATGTTATAGGTGGTATTGCAACTAATGTGCGTCCTGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126462 CAAAAAGTATATGTTATAGGTGGTATTGCAACTAATGTGCGTCCTGGCGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CACTATCAGAAAACATGAAAATTCAGTGGAATGCTGGAATCCTGATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126512 CACTATCAGAAAACATGAAAATTCAGTGGAATGCTGGAATCCTGATACAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ATACTTGGACTTCTCTAGAGAGAATGAATGAAAGCCGAAGTACTCTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126562 ATACTTGGACTTCTCTAGAGAGAATGAATGAAAGCCGAAGTACTCTTGGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GTAGTAGTACTTGCAGGAGAACTTTATGCCTTAGGTGGTTATGATGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126612 GTAGTAGTACTTGCAGGAGAACTTTATGCCTTAGGTGGTTATGATGGACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 ATCTTATTTACAATCTGTAGAGAAGTACATTCCCAAAATAAGAAAATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126662 ATCTTATTTACAATCTGTAGAGAAGTACATTCCCAAAATAAGAAAATGGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AACCTGTGGCACCAATGACGACAACAAGAAGTTGTTTTGCTGCAGCGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126712 AACCTGTGGCACCAATGACGACAACAAGAAGTTGTTTTGCTGCAGCGGTA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TTGGATGGAATGATATATGCCATTGGTGGGTATGGTCCTGCCCACATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126762 TTGGATGGAATGATATATGCCATTGGTGGGTATGGTCCTGCCCACATGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 CAG         TGTGGAGCGTTATGATCCAAGTAAGGACTCCTGGGAGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126812 CAGGTA...CAGTGTGGAGCGTTATGATCCAAGTAAGGACTCCTGGGAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TGGTTGCATCCATGGCAGATAAAAGGATTCACTTTGGCGTGGGTGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129426 TGGTTGCATCCATGGCAGATAAAAGGATTCACTTTGGCGTGGGTGTCATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CTAGGCTTTATTTTTGTGGTGGGTGGACATAATGGAGTCTCACATTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129476 CTAGGCTTTATTTTTGTGGTGGGTGGACATAATGGAGTCTCACATTTGTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 CAGCATTGAAAGATACGATCCTCATCAAAATCAGTGGACTGTGTGTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129526 CAGCATTGAAAGATACGATCCTCATCAAAATCAGTGGACTGTGTGTAGAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 CAATGAAAGAACCTAGAACAG         GAGTTGGTGCTGCTGTAATC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 129576 CAATGAAAGAACCTAGAACAGGTA...TAGGAGTTGGTGCTGCTGTAATC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1615 GATAACTACCTTTATGTCGTCGGTGGTCACTCAGGGTCTTCCTATCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131758 GATAACTACCTTTATGTCGTCGGTGGTCACTCAGGGTCTTCCTATCTGAA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1665 TACAGTGCAGAAATATGATCCTATCTCAGATACGTGGCTGGATTCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131808 TACAGTGCAGAAATATGATCCTATCTCAGATACGTGGCTGGATTCAGCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :
   1715 GCATGATATACTGTCGCTGCAACTTTGGGTTAACTGCACTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131858 GCATGATATACTGTCGCTGCAACTTTGGGTTAACTGCACTT