seq1 = pF1KE4142.tfa, 1704 bp
seq2 = pF1KE4142/gi568815590r_142564355.tfa (gi568815590r:142564355_142766058), 201704 bp

>pF1KE4142 1704
>gi568815590r:142564355_142766058 (Chr8)

(complement)

1-1704  (100001-101704)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCCAAGCCGGCTGCCGGGAAGAGCAGAGGGGAGAAGCGGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCCAAGCCGGCTGCCGGGAAGAGCAGAGGGGAGAAGCGGAAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGTGCTGACACTGAAGGAGAAGATTGACATCTGCACGCGCCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGTGCTGACACTGAAGGAGAAGATTGACATCTGCACGCGCCTGGAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGCGAGAGCCGGAAGGCACTGATGCAGGAGTACAATGTGGGCATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGCGAGAGCCGGAAGGCACTGATGCAGGAGTACAATGTGGGCATGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCCTCTACGACATCAGGGCCCACAAGGCGCAGCTGCTCCGGTTCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCCTCTACGACATCAGGGCCCACAAGGCGCAGCTGCTCCGGTTCTTCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCTCGGACTCCAACAAGGCGCTGGAGCAGCGGCGCACGCTGCACACGC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCTCCGACTCCAACAAGGCGCTGGAGCAGCGGCGCACGCTGCACACGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAAGCTGGAGCACCTGGACCGCGTCCTGTACGAGTGGTTCCTGGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAAGCTGGAGCACCTGGACCGCGTCCTGTACGAGTGGTTCCTGGGGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGCTCCGAGGGCGTCCCCGTGTCAGGCCCCATGCTCATCGAGAAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CGCTCCGAGGGCGTCCCCGTGTCAGGCCCCATGCTCATCGAGAAGGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGACTTCTACGAGCAGATGCAGCTCACTGAGCCCTGCGTGTTCTCCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGACTTCTACGAGCAGATGCAGCTCACTGAGCCCTGCGTGTTCTCCGGAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGTGGCTTTGGCGCTTTAAGGCCAGACACGGCATTAAAAAGCTAGATGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGTGGCTTTGGCGCTTTAAGGCCAGACACGGCATTAAAAAGCTAGATGCA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCAGTGAAAAGCAGTCAGCCGACCACCAGGCCGCGGAGCAGTTCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCAGTGAAAAGCAGTCAGCCGACCACCAGGCCGCGGAGCAGTTCTGTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTTTTCAGGAGCTTGGCTGCTGAGCACGGGCTGTCCGCCGAGCAGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTTTTTCAGGAGCTTGGCTGCTGAGCACGGGCTGTCCGCCGAGCAGGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACAACGCTGATGAGACCGGCCTTTTCTGGCGGTGCCTGCCAAATCCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACAACGCTGATGAGACCGGCCTTTTCTGGCGGTGCCTGCCAAATCCCACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCGGAAGGCGGGGCTGTGCCTGGCCCCAAGCAGGGCAAGGACCGGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCGGAAGGCGGGGCTGTGCCTGGCCCCAAGCAGGGCAAGGACCGGCTGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGTGCTGATGTGTGCCAACGCCACGGGCTCCCACAGGCTCAAGCCCTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGTGCTGATGTGTGCCAACGCCACGGGCTCCCACAGGCTCAAGCCCTTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCATCGGGAAGTGCAGCGGTCCCAGGGCTTTCAAAGGCATCCAGCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCATCGGGAAGTGCAGCGGTCCCAGGGCTTTCAAAGGCATCCAGCACCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCCGTCGCCTATAAGGCCCAGGGGAATGCCTGGGTGGACAAGGAGATTTT
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100751 CCCGTCGCCTATAAGGCCCAGGGGAACGCCTGGGTGGACAAGGAGATTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTCCGATTGGTTCCATCATATCTTTGTGCCCTCGGTGAGAGAGCACTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTCCGATTGGTTCCATCATATCTTTGTGCCCTCGGTGAGAGAGCACTTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GAACCATAGGTTTGCCGGAAGACAGCAAAGCCGTTCTCTTGCTGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GAACCATAGGTTTGCCGGAAGACAGCAAAGCCGTTCTCTTGCTGGACAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TCCCGGGCTCACCCGCAGGAGGCCGAGCTGGTGTCCAGTAACGTTTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TCCCGGGCTCACCCGCAGGAGGCCGAGCTGGTGTCCAGTAACGTTTTCAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CATCTTCCTGCCTGCCAGCGTGGCCTCATTGGTGCAGCCCATGGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CATCTTCCTGCCTGCCAGCGTGGCCTCATTGGTGCAGCCCATGGAGCAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCATTCGGAGAGATTTCATGAGGAACTTCATTAACCCTCCGGTCCCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCATTCGGAGAGATTTCATGAGGAACTTCATTAACCCTCCGGTCCCCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGGGCCCCCATGCCCGCTACAACATGAACGATGCCATATTCAGCGTGGC
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGGGCCCCCACGCCCGCTACAACATGAACGATGCCATATTCAGCGTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CTGTGCCTGGAACGCAGTCCCTAGCCACGTCTTCAGGCGGGCCTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CTGTGCCTGGAACGCAGTCCCTAGCCACGTCTTCAGGCGGGCCTGGAGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AGCTGTGGCCGTCGGTTGCGTTTGCCGAAGGCTCCTCCTCTGAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AGCTGTGGCCGTCGGTTGCGTTTGCCGAAGGCTCCTCCTCTGAGGAGGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTGGAGGCAGAGTGCTTCCCAGTGAAGCCCCACAACAAGTCCTTTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TTGGAGGCAGAGTGCTTCCCAGTGAAGCCCCACAACAAGTCCTTTGCACA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CATCCTGGAGCTTGTGAAGGAAGGCTCCTCCTGCCCGGGCCAGCTTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 CATCCTGGAGCTTGTGAAGGAAGGCTCCTCCTGCCCGGGCCAGCTTCGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 AGCGCCAGGCCGCCAGCTGGGGGGTAGCGGGAAGGGAGGCAGAAGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 AGCGCCAGGCCGCCAGCTGGGGGGTAGCGGGAAGGGAGGCAGAAGGGGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CGGCCCCCTGCTGCCACGTCGCCAGCAGAGGTTGTGTGGAGTTCAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CGGCCCCCTGCTGCCACGTCGCCAGCAGAGGTTGTGTGGAGTTCAGAAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 GACTCCAAAAGCTGACCAGGACGGCGGAGGAGATCCTGGTGAGGGCGAGG
        |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 101401 GACTCCGAAAGCTGACCAGGACGGCAGAGGAGATCCTGGTGAGGGCGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 AGGTGGCCTGGGAGCAGGCGGCCGTGGCCTTTGACGCAGTCCTGCGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 AGGTGGCCTGGGAGCAGGCGGCCGTGGCCTTTGACGCAGTCCTGCGCTTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 GCGGAGCGGCAGCCATGCTTCAGTGCGCAGGAAGTGGGGCAGCTGCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 GCGGAGCGGCAGCCATGCTTCAGTGCGCAGGAAGTGGGGCAGCTGCGGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 GCTGCGTGCCGTGTTCCGGAGCCAGCAGCAGGTGAGGAGGCGGCGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 GCTGCGTGCCGTGTTCCGGAGCCAGCAGCAGGTGAGGAGGCGGCGTGGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 CCCTCGGGGCTGTGGTCAAGGTTGAAGCCCTCCAGGAGGGCCCTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 CCCTCGGGGCTGTGGTCAAGGTTGAAGCCCTCCAGGAGGGCCCTGGTGGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TGTGGGGCCACAGCTCAGTCTCCCTTGCCCTGCTCATCCACAGCAGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TGTGGGGCCACAGCTCAGTCTCCCTTGCCCTGCTCATCCACAGCAGGTGA

   1700 
   1701 CAAC
        ||||
 101701 CAAC