seq1 = pF1KE4139.tfa, 1665 bp
seq2 = pF1KE4139/gi568815584r_39299519.tfa (gi568815584r:39299519_39532162), 232644 bp

>pF1KE4139 1665
>gi568815584r:39299519_39532162 (Chr14)

(complement)

1-599  (100001-100599)   100% ->
600-710  (129652-129762)   100% ->
711-1396  (130302-130987)   100% ->
1397-1665  (132376-132644)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTGTTGTTCTTGTCAGTGCCGCAGCCCCGACCGCCGGGAGCTCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTGTTGTTCTTGTCAGTGCCGCAGCCCCGACCGCCGGGAGCTCGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGAGCCGGGGCCGCCCGGGTGGCGCGGTGGCGGCGGCTGCGGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGAGCCGGGGCCGCCCGGGTGGCGCGGTGGCGGCGGCTGCGGCTGCAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTGCGACGGCTGCGGGGGCTGCTCCGGGTACTGCGGGGGCGGCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTGCGACGGCTGCGGGGGCTGCTCCGGGTACTGCGGGGGCGGCCGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCGGCAGCCGGCGGCGGGGCCGGATGGCTCTGTGCGGGCAGGCGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCGGCAGCCGGCGGCGGGGCCGGATGGCTCTGTGCGGGCAGGCGGCGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCTGCGTCGCTGCCCAGCGAGCTGATCGTGCACATCTTCTCTTTTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCTGCGTCGCTGCCCAGCGAGCTGATCGTGCACATCTTCTCTTTTCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGCGCCCGACCGGCTGCGGGCCTCGGCCTCCTGCTCGCACTGGCGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGCGCCCGACCGGCTGCGGGCCTCGGCCTCCTGCTCGCACTGGCGTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGCCTCTTCTATCCGGCCCTGTGGCCCCAGCTCCGCATCTGCCTCCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGCCTCTTCTATCCGGCCCTGTGGCCCCAGCTCCGCATCTGCCTCCGCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCGCCCGCGGAGCAGCCTCGGCTGGAATTCCTCATGCGCAAGTGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCGCCCGCGGAGCAGCCTCGGCTGGAATTCCTCATGCGCAAGTGCGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGTTCGTGCGAGAGCTGCGTGTTGAATTCGCCGCCGAGAACTATCTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGTTCGTGCGAGAGCTGCGTGTTGAATTCGCCGCCGAGAACTATCTGAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCGGTGGCCCAGGGGACGGAGGTGGCGCGGACACCGGGACTGGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCGGTGGCCCAGGGGACGGAGGTGGCGCGGACACCGGGACTGGAGGGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGAAGTCGAGGCCCTGCAGCTCTCAGCTCGTTGGCTGGAAGTGCTGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGAAGTCGAGGCCCTGCAGCTCTCAGCTCGTTGGCTGGAAGTGCTGCGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCTACTTGGAGCTGGTGCTTTGCGTGCTGGTCAGCATCCGGAACAACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100551 CCTACTTGGAGCTGGTGCTTTGCGTGCTGGTCAGCATCCGGAACAACAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    600         GAACCTTCAGAAGTTTAGTCTTTTTGGAGACATAAGTGTTCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TA...TAGGAACCTTCAGAAGTTTAGTCTTTTTGGAGACATAAGTGTTCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ACAACAGCAAGGAAGTTTGTCAAATACATACCTCAGCAAGGTGGACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129694 ACAACAGCAAGGAAGTTTGTCAAATACATACCTCAGCAAGGTGGACCCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATGGCAAAAAAATTAAACA         AATTCAGCAACTGTTTGAAGAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 129744 ATGGCAAAAAAATTAAACAGTA...TAGAATTCAGCAACTGTTTGAAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATCCTGAGTAATAGTAGGCAACTGAAATGGCTGTCCTGTGGGTTTATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130324 ATCCTGAGTAATAGTAGGCAACTGAAATGGCTGTCCTGTGGGTTTATGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGAAATAGTAACCCCAACATCACTGTCATCTCTCTCTAATGCTGTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130374 GGAAATAGTAACCCCAACATCACTGTCATCTCTCTCTAATGCTGTTGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACACCATGGAGCACCTCAGTTTACTGGACAATAATATTCCTGGTAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130424 ACACCATGGAGCACCTCAGTTTACTGGACAATAATATTCCTGGTAACAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ACTCTTATTACTGCAGTTGAACTGGAGCGATTTGTGAATCTGCACTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130474 ACTCTTATTACTGCAGTTGAACTGGAGCGATTTGTGAATCTGCACTCACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGCCTTGGATTTTTGTGACTTTACAGCTGAGATGGCAAGAGTCTTAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130524 TGCCTTGGATTTTTGTGACTTTACAGCTGAGATGGCAAGAGTCTTAACTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATAGCAACCATGTGCCTTTGCAACGACTGTCTCTTCTGGTTCACAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130574 ATAGCAACCATGTGCCTTTGCAACGACTGTCTCTTCTGGTTCACAATGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TCTGTAATGCACAAGTCTCTGGACAACATGCCAAATGATGAGCATTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130624 TCTGTAATGCACAAGTCTCTGGACAACATGCCAAATGATGAGCATTGGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 AGCCCTGTCACGAAAGAGCACCAGCTTTCGGGTCTATATAATGGCTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130674 AGCCCTGTCACGAAAGAGCACCAGCTTTCGGGTCTATATAATGGCTTTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ATATCAAGAGTGAAGATATGTTAAAGATTCTGAAACCCAGTATACCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130724 ATATCAAGAGTGAAGATATGTTAAAGATTCTGAAACCCAGTATACCACTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GAGAGGATTCATTTTGATAGCTATATCACTTGTGTTTCAGGGGCTATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130774 GAGAGGATTCATTTTGATAGCTATATCACTTGTGTTTCAGGGGCTATTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TGATCTTATATCCAGGCAATATGACAAGTTCCTCACTCATTTTATTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130824 TGATCTTATATCCAGGCAATATGACAAGTTCCTCACTCATTTTATTTTAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TGAATGATGTGATTGACACATCTGGTTTTCCAGATCTTAGTGACAACCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130874 TGAATGATGTGATTGACACATCTGGTTTTCCAGATCTTAGTGACAACCGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 AATGAAGATCCGTTGGTTTTATTAGCATGGAGGTGCACAAAGCTCTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130924 AATGAAGATCCGTTGGTTTTATTAGCATGGAGGTGCACAAAGCTCTCTCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TCTGGCAATTCATG         GTTACACGGTGTGGGCACACAACCTCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 130974 TCTGGCAATTCATGGTA...CAGGTTACACGGTGTGGGCACACAACCTCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 TTGCCATTGCTCGTCTTCGGGGCTCTGATCTGAAAGTGCTTGAAGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132403 TTGCCATTGCTCGTCTTCGGGGCTCTGATCTGAAAGTGCTTGAAGTCACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 GAAGAAAGCATTGATTTTGACCAAGGTGAACTGGCCGACCAGGATGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132453 GAAGAAAGCATTGATTTTGACCAAGGTGAACTGGCCGACCAGGATGTAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 TCCAGTGCATAACCTTATTGAGCAGGTATCCCTGGGCCTGGGTCAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132503 TCCAGTGCATAACCTTATTGAGCAGGTATCCCTGGGCCTGGGTCAACCTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 GGCATGCAGTCATGGACATCGAATCACTCAGTGTCTTCACTGAACCAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132553 GGCATGCAGTCATGGACATCGAATCACTCAGTGTCTTCACTGAACCAAAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 CGTCATTTTTACAGAGAGATGCAAAGCTTCAGTGAAGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132603 CGTCATTTTTACAGAGAGATGCAAAGCTTCAGTGAAGACATT