seq1 = pF1KE4135.tfa, 1629 bp
seq2 = pF1KE4135/gi568815587r_47472933.tfa (gi568815587r:47472933_47678074), 205142 bp

>pF1KE4135 1629
>gi568815587r:47472933_47678074 (Chr11)

(complement)

1-664  (100001-100664)   100% ->
665-771  (102376-102482)   100% ->
772-1629  (104285-105142)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGTGAATTCCTCAGGTTACTCAAGATGGTGTTGCTTTGCAGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGTGAATTCCTCAGGTTACTCAAGATGGTGTTGCTTTGCAGACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGCAGAGAGAGAAGTTGGCTAGCATGGAATCACCAGAGGAGCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGGCAGAGAGAGAAGTTGGCTAGCATGGAATCACCAGAGGAGCCTGGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CATCCATGGATGAGAACTACTTTGTGAACTACACTTTCAAAGATCGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CATCCATGGATGAGAACTACTTTGTGAACTACACTTTCAAAGATCGGTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATTCAGGCCGTGTGGCTCAAGGCATCATGAAACTGTGTCTAGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATTCAGGCCGTGTGGCTCAAGGCATCATGAAACTGTGTCTAGAGGAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCTTTGCTGATGTCACCATTTCGGTGGAAGGCCGGGAGTTTCAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTCTTTGCTGATGTCACCATTTCGGTGGAAGGCCGGGAGTTTCAGCTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCGGCTGGTCCTCTCAGCTCAGAGCTGCTTCTTCCGATCCATGTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCGGCTGGTCCTCTCAGCTCAGAGCTGCTTCTTCCGATCCATGTTCACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCCAACCTGAAGGAGGCCCACAACCGGGTGATTGTGCTGCAGGATGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCCAACCTGAAGGAGGCCCACAACCGGGTGATTGTGCTGCAGGATGTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGAGTCTGTTTTCCAGCTCCTGGTTGATTATATCTACCATGGGACTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGAGTCTGTTTTCCAGCTCCTGGTTGATTATATCTACCATGGGACTGTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AACTTCGAGCTGAGGAGTTGCAGGAAATTTATGAGGTGTCAGACATGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AACTTCGAGCTGAGGAGTTGCAGGAAATTTATGAGGTGTCAGACATGTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGCTGACATCTCTCTTTGAGGAATGCTCTCGGTTTTTGGCCCGCACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGCTGACATCTCTCTTTGAGGAATGCTCTCGGTTTTTGGCCCGCACAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCAAGTGGGAAACTGCCTTCAGGTGATGTGGCTGGCAGATCGGCACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCAAGTGGGAAACTGCCTTCAGGTGATGTGGCTGGCAGATCGGCACAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATCCTGAGCTCTATACGGCTGCCAAGCACTGTGCCAAGACCCACCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATCCTGAGCTCTATACGGCTGCCAAGCACTGTGCCAAGACCCACCTGGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGCTGCAGAATACAGAGGAATTTCTCCACTTGCCCCACCGCTTACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CAGCTGCAGAATACAGAGGAATTTCTCCACTTGCCCCACCGCTTACTCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGATATCATCTCGG         ATGGAGTTCCGTGTTCTCAGAACCCAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGATATCATCTCGGGTA...CAGATGGAGTTCCGTGTTCTCAGAACCCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CAGAGGCAATAGAAGCCTGGATCAACTTTAATAAAGAGGAAAGAGAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102403 CAGAGGCAATAGAAGCCTGGATCAACTTTAATAAAGAGGAAAGAGAGGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 TTTGCAGAGTCACTCAGGACAAGCTTGAAG         GAAATTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 102453 TTTGCAGAGTCACTCAGGACAAGCTTGAAGGTA...TAGGAAATTGGGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GAATGTGCACATTTACCTGATTGGGAAAGAGTCATCTCGTACCCACTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104296 GAATGTGCACATTTACCTGATTGGGAAAGAGTCATCTCGTACCCACTCGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 TGGCTGTGTCCTTGCACTGTGCAGAAGATGACTCCATCAGTGTAAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104346 TGGCTGTGTCCTTGCACTGTGCAGAAGATGACTCCATCAGTGTAAGTGGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CAAAACAGTTTGTGCCACCAGATCACTGCGGCCTGCAAGCATGGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104396 CAAAACAGTTTGTGCCACCAGATCACTGCGGCCTGCAAGCATGGTGGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CTTGTATGTGGTGGGAGGGTCCATCCCACGGCGCATGTGGAAGTGCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104446 CTTGTATGTGGTGGGAGGGTCCATCCCACGGCGCATGTGGAAGTGCAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATGCCACCGTTGACTGGGAGTGGTGTGCTCCTTTGCCTCGGGACCGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104496 ATGCCACCGTTGACTGGGAGTGGTGTGCTCCTTTGCCTCGGGACCGGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CAGCACACCCTGGTGTCTGTGCCCGGGAAAGATGCCATATATTCACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104546 CAGCACACCCTGGTGTCTGTGCCCGGGAAAGATGCCATATATTCACTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TGGCAAGACACTGCAAGATACCCTCTCCAACGCAGTCATTTATTATCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104596 TGGCAAGACACTGCAAGATACCCTCTCCAACGCAGTCATTTATTATCGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TAGGTGATAATGTGTGGACAGAGACAACTCAGCTAGAGGTGGCTGTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104646 TAGGTGATAATGTGTGGACAGAGACAACTCAGCTAGAGGTGGCTGTGTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GGGGCTGCTGGTGCCAACCTCAACGGGATCATCTACTTACTAGGGGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104696 GGGGCTGCTGGTGCCAACCTCAACGGGATCATCTACTTACTAGGGGGGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GGAGAATGATCTGGACTTCTTTACCAAACCTTCCCGACTCATCCAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104746 GGAGAATGATCTGGACTTCTTTACCAAACCTTCCCGACTCATCCAGTGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 TTGACACAGAGACAGACAAATGCCATGTGAAGCCCTATGTGCTGCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104796 TTGACACAGAGACAGACAAATGCCATGTGAAGCCCTATGTGCTGCCCTTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GCAGGCCGCATGCACGCAGCTGTGCATAAAGATCTGGTGTTCATCGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104846 GCAGGCCGCATGCACGCAGCTGTGCATAAAGATCTGGTGTTCATCGTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TGAAGGGGACTCCCTGGTGTGCTACAATCCCTTGCTAGACAGCTTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104896 TGAAGGGGACTCCCTGGTGTGCTACAATCCCTTGCTAGACAGCTTCACCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 GGCTTTGCCTTCCTGAGGCCTGGAGCTCTGCCCCATCCCTCTGGAAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104946 GGCTTTGCCTTCCTGAGGCCTGGAGCTCTGCCCCATCCCTCTGGAAGATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 GCCAGCTGTAACGGGAGCATCTATGTCTTCCGGGACCGATATAAAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104996 GCCAGCTGTAACGGGAGCATCTATGTCTTCCGGGACCGATATAAAAAGGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GGATGCCAACACCTACAAGCTTGACCCTGCCACTTCAGCCGTAACTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105046 GGATGCCAACACCTACAAGCTTGACCCTGCCACTTCAGCCGTAACTGTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1583 CAAGAGGTATTAAGGTGCTGCTTACCAATTTGCAGTTTGTGTTGGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105096 CAAGAGGTATTAAGGTGCTGCTTACCAATTTGCAGTTTGTGTTGGCC