seq1 = pF1KE4134.tfa, 1617 bp
seq2 = pF1KE4134/gi568815592r_30085879.tfa (gi568815592r:30085879_30299103), 213225 bp

>pF1KE4134 1617
>gi568815592r:30085879_30299103 (Chr6)

(complement)

1-438  (100001-100438)   100% ->
439-534  (100580-100675)   98% ->
535-765  (102358-102588)   100% ->
766-788  (109069-109091)   100% ->
789-904  (109571-109686)   100% ->
905-937  (109905-109937)   100% ->
938-1617  (112546-113225)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCACGTCAGCCCCACTACGGAGCCTGGAAGAGGAGGTGACCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCACGTCAGCCCCACTACGGAGCCTGGAAGAGGAGGTGACCTGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCTGTCTTGATTACCTGCGGGACCCTGTGACCATTGACTGTGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCTGTCTTGATTACCTGCGGGACCCTGTGACCATTGACTGTGGCCACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTCTGCCGCAGCTGCACCACAGACGTCCGCCCCATCTCAGGGAGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTCTGCCGCAGCTGCACCACAGACGTCCGCCCCATCTCAGGGAGCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCGTCTGCCCACTCTGCAAGAAGCCTTTTAAGAAGGAGAACATCCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCGTCTGCCCACTCTGCAAGAAGCCTTTTAAGAAGGAGAACATCCGACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGTGTGGCAACTGGCCAGCCTGGTGGAGAACATTGAGCGGCTGAAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGTGTGGCAACTGGCCAGCCTGGTGGAGAACATTGAGCGGCTGAAGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAAGGGCAGGCAGCCGGGAGAGGTGACCCGGGAGCAGCAGGATGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAAGGGCAGGCAGCCGGGAGAGGTGACCCGGGAGCAGCAGGATGCAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGTGCGAGCGACACCGAGAGAAGCTGCACTACTACTGTGAGGACGACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGTGCGAGCGACACCGAGAGAAGCTGCACTACTACTGTGAGGACGACGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAAGCTGCTGTGCGTGATGTGCCGGGAGTCCCGGGAGCACAGGCCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAAGCTGCTGTGCGTGATGTGCCGGGAGTCCCGGGAGCACAGGCCCCACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGGCCGTCCTCATGGAGAAGGCCGCCCAGCCCCACAGG         GAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100401 CGGCCGTCCTCATGGAGAAGGCCGCCCAGCCCCACAGGGTA...CAGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAAATCCTGAACCACCTGAGTACCCTAAGGAGAGACAGAGACAAAATTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 100583 AAAATCCTGAACCACCTGAGTACCCTAAGGAGGGACAGAGACAAAATTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGGCTTCCAGGCAAAGGGAGAAGCTGATATCCTGGCCGCGCTG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100633 GGGCTTCCAGGCAAAGGGAGAAGCTGATATCCTGGCCGCGCTGGTA...C

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    535   AAGAAGCTCCAGGACCAGAGGCAGTACATTGTGGCTGAGTTTGAGCAG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102356 AGAAGAAGCTCCAGGACCAGAGGCAGTACATTGTGGCTGAGTTTGAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGTCATCAGTTCCTGAGGGAGCGGGAGGAACACCTGCTGGAACAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102406 GGTCATCAGTTCCTGAGGGAGCGGGAGGAACACCTGCTGGAACAGCTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GAAGCTGGAGCAGGAGCTCACGGAGGGCAGGGAGAAGTTCAAGAGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102456 GAAGCTGGAGCAGGAGCTCACGGAGGGCAGGGAGAAGTTCAAGAGCCGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GCGTCGGGGAGCTTGCCCGGCTGGCCCTGGTCATCTCCGAACTGGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102506 GCGTCGGGGAGCTTGCCCGGCTGGCCCTGGTCATCTCCGAACTGGAGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AAGGCGCAGCAGCCAGCTGCAGAGCTCATGCAG         GACACGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 102556 AAGGCGCAGCAGCCAGCTGCAGAGCTCATGCAGGTG...TAGGACACGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AGACTTCCTAAACAG         GTATCCACGGAAGAAGTTCTGGGTTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 109077 AGACTTCCTAAACAGGTA...TAGGTATCCACGGAAGAAGTTCTGGGTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GGAAACCCATTGCTCGAGTGGTTAAAAAAAAGACCGGAGAATTCTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109597 GGAAACCCATTGCTCGAGTGGTTAAAAAAAAGACCGGAGAATTCTCAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAACTCCTCTCTCTGCAACGAGGCCTGAGGGAATTCCAGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 109647 AAACTCCTCTCTCTGCAACGAGGCCTGAGGGAATTCCAGGGTA...CAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAAGCTGCTGAGAGACTTGGAATATAAGACAG         TGAGCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 109906 GAAGCTGCTGAGAGACTTGGAATATAAGACAGGTG...CAGTGAGCGTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCCTGGACCCACAGTCGGCCAGTGGGTACCTGCAGCTGTCAGAGGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112555 CCCTGGACCCACAGTCGGCCAGTGGGTACCTGCAGCTGTCAGAGGACTGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AAGTGCGTGACCTACACCAGCCTGTACAAGAGTGCCTACCTGCACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112605 AAGTGCGTGACCTACACCAGCCTGTACAAGAGTGCCTACCTGCACCCCCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 GCAGTTTGACTGTGAGCCTGGGGTGCTGGGCAGCAAGGGCTTCACCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 112655 GCAGTTTGACTGTGAGCCTGGGGTGCTAGGCAGCAAGGGCTTCACCTGGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCAAGGTCTACTGGGAAGTGGAAGTGGAGAGGGAGGGCTGGTCTGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112705 GCAAGGTCTACTGGGAAGTGGAAGTGGAGAGGGAGGGCTGGTCTGAGGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GAAGAAGAGGGGGATGAGGAGGAAGAGGGAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112755 GAAGAAGAGGGGGATGAGGAGGAAGAGGGAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GGAGGCCGGCTATGGGGATGGATATGACGACTGGGAAACGGACGAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112805 GGAGGCCGGCTATGGGGATGGATATGACGACTGGGAAACGGACGAAGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 AGGAATCGTTGGGCGATGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112855 AGGAATCGTTGGGCGATGAAGAGGAAGAAGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GTTCTGGAAAGCTGCATGGTGGGGGTGGCTAGAGACTCTGTGAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112905 GTTCTGGAAAGCTGCATGGTGGGGGTGGCTAGAGACTCTGTGAAGAGGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GGGAGACCTCTCCCTGCGGCCAGAGGATGGCGTGTGGGCGCTGCGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112955 GGGAGACCTCTCCCTGCGGCCAGAGGATGGCGTGTGGGCGCTGCGCCTCT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 CCTCCTCCGGCATCTGGGCCAACACCAGCCCCGAGGCTGAGCTTTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113005 CCTCCTCCGGCATCTGGGCCAACACCAGCCCCGAGGCTGAGCTTTTCCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 GCACTGCGGCCCCGGAGAGTGGGCATCGCCCTGGATTATGAAGGGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113055 GCACTGCGGCCCCGGAGAGTGGGCATCGCCCTGGATTATGAAGGGGGCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CGTGACTTTCACCAACGCAGAGTCACAGGAACTCATCTACACCTTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113105 CGTGACTTTCACCAACGCAGAGTCACAGGAACTCATCTACACCTTCACTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CCACCTTCACCCGGCGCCTGGTCCCCTTCCTGTGGCTCAAGTGGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113155 CCACCTTCACCCGGCGCCTGGTCCCCTTCCTGTGGCTCAAGTGGCCAGGA

   1650     .    :    .    :
   1597 ACACGCCTCCTGCTAAGACCC
        |||||||||||||||||||||
 113205 ACACGCCTCCTGCTAAGACCC