seq1 = pF1KE4133.tfa, 1614 bp
seq2 = pF1KE4133/gi568815584r_22887218.tfa (gi568815584r:22887218_23099023), 211806 bp

>pF1KE4133 1614
>gi568815584r:22887218_23099023 (Chr14)

(complement)

1-597  (100001-100597)   99% ->
598-918  (102756-103076)   100% ->
919-980  (108897-108958)   100% ->
981-1084  (109179-109282)   100% ->
1085-1197  (111009-111121)   100% ->
1198-1614  (111390-111806)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCTTCAGTGCCACCATTCTCTTCTCCCCTCCCAGTGGCAGCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCTTCAGTGCCACCATTCTCTTCTCCCCTCCCAGTGGCAGCGAGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGATGCTGCTGCTGCGCCTGTAAGAGTGAGACTAATGGAGGCAACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGATGCTGCTGCTGCGCCTGTAAGAGTGAGACTAATGGAGGCAACACAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTCCCAGGGTGGGAATCCTCCTCCCAGCACCCCCATCACAGTGACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTCCCAGGGTGGGAATCCTCCTCCCAGCACCCCCATCACAGTGACTGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATGGCTTGGCTGTTCAGAGCTCAGAGCAGCTCCTGCATGTTATCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATGGCTTGGCTGTTCAGAGCTCAGAGCAGCTCCTGCATGTTATCTACCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCGGGTCGATAAGGCAGTGGGTTTGGCTGAAGCTGCTCTGGGTCTTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCGGGTCGATAAGGCAGTGGGTTTGGCTGAAGCTGCTCTGGGTCTTGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGCCAACAATGAGTTGTTAAAACGTCTCCAGGAGGAAGTGGGTGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGCCAACAATGAGTTGTTAAAACGTCTCCAGGAGGAAGTGGGTGACCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGGCAAGGGAAAGTGTCCATCCCTGATGAAGATGGGGAAAGCCGGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGGCAAGGGAAAGTGTCCATCCCTGATGAAGATGGGGAAAGCCGGGCACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAGTTCCCCACCTGAGGAGCCTGGGCCTCTCAAGGAAAGTCCCGGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAGTTCCCCACCTGAGGAGCCTGGGCCTCTCAAGGAAAGTCCCGGGGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCTTTAAGGCTCTGTCTGCCGTGGAAGAGGAGTGTGACAGCGTGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCTTTAAGGCTCTGTCTGCCGTGGAAGAGGAGTGTGACAGCGTGGGCAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCGTGCAGGTGGTGATTGAGGAGCTGCGGCAGCTGGGAGCAGCCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCGTGCAGGTGGTGATTGAGGAGCTGCGGCAGCTGGGAGCAGCCTCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGGCCTGGGCCTTTGGGCTTCCCAGCAACTCAGAGGGACATGCGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGGCCTGGGCCTTTGGGCTTCCCAGCAACTCAGAGGGACATGCGGCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGGGTGCACGCTGGCTGTCAGCGAGGCGGCCCCCCTGCTCAATCCT   
        |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100551 CAGGGTGCACGCTGGCTGCCAGCGAGGCGGCCCCCCTGCTCAATCCTGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    598       CTGGTGGATGATTACGTGGCCTCTGAGGGTGCAGTACAGCGAGT
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ...TAGCTGGTGGATGATTACGTGGCCTCTGAGGGTGCAGTACAGCGAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TCTGGTCCCTGCTTATGCCAAGCAACTCTCACCAGCCACACAACTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102800 TCTGGTCCCTGCTTATGCCAAGCAACTCTCACCAGCCACACAACTGGCAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCCAGCGGGCAACCCCAGAGACAGGACCAGAAAATGGAACCAAGCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102850 TCCAGCGGGCAACCCCAGAGACAGGACCAGAAAATGGAACCAAGCTGCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCACCCCGCCCTGAGGACATGCTCAATGCCGCTGCTGCGCTGGACAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102900 CCACCCCGCCCTGAGGACATGCTCAATGCCGCTGCTGCGCTGGACAGTGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CTTGGAAGAGTCAGGCCCTGGGAGCACTGGGGAGCTGAGACACTCTCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102950 CTTGGAAGAGTCAGGCCCTGGGAGCACTGGGGAGCTGAGACACTCTCTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGCTGACCGTTTCCCCATGCAGGACCAGAGGAAGTGGGCAGAAGAACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103000 GGCTGACCGTTTCCCCATGCAGGACCAGAGGAAGTGGGCAGAAGAACTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 AGGCGCAAGCGGGATCTTGTACTCTCT         AAACTGGTCCACAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103050 AGGCGCAAGCGGGATCTTGTACTCTCTGTG...TAGAAACTGGTCCACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGTGCATAACCACATCACCAATGACAAGAGATTCAATGGGTCTGAAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 108911 TGTGCATAACCACATCACCAATGACAAGAGATTCAATGGGTCTGAAAGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    981        CATCAAGTCCTCTTGGAATATTTCAGTAGTGAAGTTTCTTCTG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108961 A...CAGCATCAAGTCCTCTTGGAATATTTCAGTAGTGAAGTTTCTTCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GAAAAGCTCAAGCAAGAGCTGGTGACCAGTCCCCACAATTACACTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109222 GAAAAGCTCAAGCAAGAGCTGGTGACCAGTCCCCACAATTACACTGATAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GGAGCTAAAAG         GAGCCTGTGTGGCCTACTTCCTTACTAAGA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 109272 GGAGCTAAAAGGTG...CAGGAGCCTGTGTGGCCTACTTCCTTACTAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GGCGTGAGTACCGCAACTCCCTGAACCCCTTTAAAGGCCTGAAGGAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111039 GGCGTGAGTACCGCAACTCCCTGAACCCCTTTAAAGGCCTGAAGGAAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GAGGAGAAGAAACTTCGAAGTCGCCGATATCGG         CTTTTTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 111089 GAGGAGAAGAAACTTCGAAGTCGCCGATATCGGGTA...TAGCTTTTTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 CAACCGATCCAGTATCATGAGGCATTTTGGACCTGAGGACCAACGTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111398 CAACCGATCCAGTATCATGAGGCATTTTGGACCTGAGGACCAACGTCTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GGAATGATGTGACAGAGGAACTGATGTCAGATGAAGAGGACAGTCTTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111448 GGAATGATGTGACAGAGGAACTGATGTCAGATGAAGAGGACAGTCTTAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GAGCCAGGTGTGTGGGTGGCCCGCCCTCCCCGTTTCCGGGCCCAGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111498 GAGCCAGGTGTGTGGGTGGCCCGCCCTCCCCGTTTCCGGGCCCAGCGCCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CACAGAGCTCTGCTACCACCTGGATGCTAACTCTAAGCATGGCACCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111548 CACAGAGCTCTGCTACCACCTGGATGCTAACTCTAAGCATGGCACCAAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CCAACCGTGTGTATGGGCCTCCCTCAGACAGACTGCCTTCTGCTGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111598 CCAACCGTGTGTATGGGCCTCCCTCAGACAGACTGCCTTCTGCTGAAGCC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CAGCTCCTTCCACCAGAACTTTACAATCCTAATTTCCAAGAAGAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111648 CAGCTCCTTCCACCAGAACTTTACAATCCTAATTTCCAAGAAGAGGAAGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TGAGGGAGGGGATGAGAATGCACCTGGCTCCCCATCTTTTGACCAACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111698 TGAGGGAGGGGATGAGAATGCACCTGGCTCCCCATCTTTTGACCAACCCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 ACAAAACCTGCTGTCCTGACTTGAACTCATTCATTGAAATCAAGGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111748 ACAAAACCTGCTGTCCTGACTTGAACTCATTCATTGAAATCAAGGTGGAA

   1650     .
   1606 AAGGATGAA
        |||||||||
 111798 AAGGATGAA