seq1 = pF1KE4126.tfa, 1551 bp
seq2 = pF1KE4126/gi568815581r_75790782.tfa (gi568815581r:75790782_75996937), 206156 bp

>pF1KE4126 1551
>gi568815581r:75790782_75996937 (Chr17)

(complement)

1-414  (100001-100414)   100% ->
415-510  (104088-104183)   100% ->
511-744  (104438-104671)   100% ->
745-919  (104753-104927)   100% ->
920-985  (105060-105125)   100% ->
986-1551  (105591-106156)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCGCAGCTGCTGGAGGAGAAGCTGACCTGCGCCATCTGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCGCAGCTGCTGGAGGAGAAGCTGACCTGCGCCATCTGCCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTACCAGGACCCAGTGACGCTGCCCTGCGGCCACAACTTCTGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCTACCAGGACCCAGTGACGCTGCCCTGCGGCCACAACTTCTGCGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGCATCCGGGACTGGTGGGACCGCTGCGGAAAGGCGTGCCCCGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTGCATCCGGGACTGGTGGGACCGCTGCGGAAAGGCGTGCCCCGAGTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGGAGCCCTTTCCCGACGGCGCCGAGCTGCGCCGCAACGTGGCCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGGAGCCCTTTCCCGACGGCGCCGAGCTGCGCCGCAACGTGGCCCTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGGCGTGCTGGAGGTGGTGCGCGCCGGGCCCGCCCGGGATCCCGGCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGGCGTGCTGGAGGTGGTGCGCGCCGGGCCCGCCCGGGATCCCGGCCCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATCCCGGCCCCGGCCCCGACCCTGCCGCGCGCTGCCCCCGCCACGGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATCCCGGCCCCGGCCCCGACCCTGCCGCGCGCTGCCCCCGCCACGGGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGCTGGAGCTCTTCTGCCGGACCGAGGGCCGCTGTGTGTGCAGCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGCTGGAGCTCTTCTGCCGGACCGAGGGCCGCTGTGTGTGCAGCGTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCGTGCGCGAGTGTCGCCTCCACGAGCGGGCGCTGCTGGATGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCGTGCGCGAGTGTCGCCTCCACGAGCGGGCGCTGCTGGATGCCGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCTCAAGCGCGAG         GCCCAGCTGAGAGCCAGCCTGGAGGTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCCTCAAGCGCGAGGTG...CAGGCCCAGCTGAGAGCCAGCCTGGAGGTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ACCCAGCAGCAGGCCACCCAGGCCGAAGGCCAGCTACTAGAGCTGCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104115 ACCCAGCAGCAGGCCACCCAGGCCGAAGGCCAGCTACTAGAGCTGCGCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCAAAGCAGCCAGATCCAG         AACTCGGCCTGCATCTTGGCCT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 104165 GCAAAGCAGCCAGATCCAGGTA...CAGAACTCGGCCTGCATCTTGGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTGGGTCTCCGGCAAGTTCAGCAGCCTGCTACAGGCCCTGGAAATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104460 CCTGGGTCTCCGGCAAGTTCAGCAGCCTGCTACAGGCCCTGGAAATACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CACACGACAGCACTGAGGAGCATCGAGGTGGCCAAGACGCAGGCGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104510 CACACGACAGCACTGAGGAGCATCGAGGTGGCCAAGACGCAGGCGCTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ACAGGCTCGAGACGAGGAGCAGCGGCTGCGGGTCCATTTGGAGGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104560 ACAGGCTCGAGACGAGGAGCAGCGGCTGCGGGTCCATTTGGAGGCTGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTCGCCATGGCTGCAGGATCCGGGAGCTCCTGGAGCAGGTGGATGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104610 CTCGCCATGGCTGCAGGATCCGGGAGCTCCTGGAGCAGGTGGATGAGCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ACCTTCCTGCAG         GAATCGCAGCTCCTCCAGCCCCCAGGGCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104660 ACCTTCCTGCAGGTG...CAGGAATCGCAGCTCCTCCAGCCCCCAGGGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TCTTGGGCCACTGACCCCTCTGCAGTGGGATGAAGACCAACAGCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104782 TCTTGGGCCACTGACCCCTCTGCAGTGGGATGAAGACCAACAGCTGGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 ACCTGAAGCAGTTGCTAAGCCGGCTGTGTGGCCTCCTCTTGGAAGAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104832 ACCTGAAGCAGTTGCTAAGCCGGCTGTGTGGCCTCCTCTTGGAAGAGGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AGCCACCCTGGGGCACCAGCCAAGCCTGTGGACTTAGCCCCCGTGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 104882 AGCCACCCTGGGGCACCAGCCAAGCCTGTGGACTTAGCCCCCGTGGGTA.

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920      AGGCCCCAGGTCCCCTGGCACCGGTCCCAAGCACAGTTTGTCCAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104932 ..TAGAGGCCCCAGGTCCCCTGGCACCGGTCCCAAGCACAGTTTGTCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGAGGAGGAAACTCTGGCAGA         ATTATCGCAATCTGACCTTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105105 TGAGGAGGAAACTCTGGCAGAGTA...CAGATTATCGCAATCTGACCTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GATCCAGTCAGCGCCAACCGTCACTTCTATCTGTCGCGCCAGGACCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105611 GATCCAGTCAGCGCCAACCGTCACTTCTATCTGTCGCGCCAGGACCAGCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GGTGAAGCACTGTCGTCAGTCCCGGGGCCCAGGCGGGCCCGGCAGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105661 GGTGAAGCACTGTCGTCAGTCCCGGGGCCCAGGCGGGCCCGGCAGCTTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AGCTCTGGCAGGTGCAATGTGCCCAGAGCTTCCAGGCCGGGCACCACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105711 AGCTCTGGCAGGTGCAATGTGCCCAGAGCTTCCAGGCCGGGCACCACTAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TGGGAGGTGCGCGCGTCAGACCACTCGGTGACACTGGGCGTCTCCTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105761 TGGGAGGTGCGCGCGTCAGACCACTCGGTGACACTGGGCGTCTCCTACCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GCAACTGCCACGGTGCAGGCTGGGGCCCCACACAGACAACATTGGCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105811 GCAACTGCCACGGTGCAGGCTGGGGCCCCACACAGACAACATTGGCCGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GACCCTGCTCCTGGGGGCTCTGCGTCCAGGAGGACAGCCTCCAGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105861 GACCCTGCTCCTGGGGGCTCTGCGTCCAGGAGGACAGCCTCCAGGCCTGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CACAACGGGGAAGCCCAGCGCCTCCCAGGGGTGTCAGGGCGGCTCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105911 CACAACGGGGAAGCCCAGCGCCTCCCAGGGGTGTCAGGGCGGCTCCTGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CATGGATTTGGACCTGGCCTCAGGCTGCCTCACCTTCTACAGCCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105961 CATGGATTTGGACCTGGCCTCAGGCTGCCTCACCTTCTACAGCCTGGAGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CCCAGACCCAGCCCCTGTACACCTTCCATGCCCTCTTCAACCAGCCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106011 CCCAGACCCAGCCCCTGTACACCTTCCATGCCCTCTTCAACCAGCCCCTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 ACCCCCGTCTTCTGGCTCCTCGAGGGTAGGACCCTGACCCTGTGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106061 ACCCCCGTCTTCTGGCTCCTCGAGGGTAGGACCCTGACCCTGTGCCATCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1506 GCCAGGGGCTGTGTTCCCTCTGGGGCCCCAGGAAGAGGTGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106111 GCCAGGGGCTGTGTTCCCTCTGGGGCCCCAGGAAGAGGTGCTCAGC