seq1 = pF1KE4118.tfa, 1488 bp
seq2 = pF1KE4118/gi568815579r_55492453.tfa (gi568815579r:55492453_55697865), 205413 bp

>pF1KE4118 1488
>gi568815579r:55492453_55697865 (Chr19)

(complement)

1-294  (100001-100294)   100% ->
295-1488  (104220-105413)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGACGTCCCCGCCCCAACCCCTGCACCAGCACCGCCCGCCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGACGTCCCCGCCCCAACCCCTGCACCAGCACCGCCCGCCGCTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCCCCAGGGTCCCGTTTCACTGCAGTGAATGTGGCAAGAGCTTCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCCCCAGGGTCCCGTTTCACTGCAGTGAATGTGGCAAGAGCTTCCGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCGCTCAGACCTGCGGCGCCACTTTGCCCGGCACACAGCGCTCAAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCGCTCAGACCTGCGGCGCCACTTTGCCCGGCACACAGCGCTCAAGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACGCATGTCCGCGCTGCGGCAAGGGTTTCAAGCACAGCTTCAACCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACGCATGTCCGCGCTGCGGCAAGGGTTTCAAGCACAGCTTCAACCTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAACCACCTGCGCTCGCACACCGGGGAGCGGCCCTACCGCTGCTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAACCACCTGCGCTCGCACACCGGGGAGCGGCCCTACCGCTGCTCTGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCCCAAGGGGTTCCGCGACTCCACCGGCCTGCTGCACCACCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100251 GCCCCAAGGGGTTCCGCGACTCCACCGGCCTGCTGCACCACCAGGTG...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295    GTCGTCCACACTGGTGAGAAACCCTACTGCTGCCTGGTCTGCGAGCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104217 TAGGTCGTCCACACTGGTGAGAAACCCTACTGCTGCCTGGTCTGCGAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCGCTTCTCCTCACGCTCCAGCCTGGGCCGCCACCTCAAGCGCCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104267 CCGCTTCTCCTCACGCTCCAGCCTGGGCCGCCACCTCAAGCGCCAGCACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTGGGGTTCTCCCCTCTCCCCTGCAGCCCGGCCCTGGCCTGCCCGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104317 GTGGGGTTCTCCCCTCTCCCCTGCAGCCCGGCCCTGGCCTGCCCGCCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AGTGCGCCCTGCTCCGTCTGCTGCAATGTGGGGCCCTGCTCGGTGTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104367 AGTGCGCCCTGCTCCGTCTGCTGCAATGTGGGGCCCTGCTCGGTGTGCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGGCTCAGGGGCCGGCGGCGGAGAGGGCCCCGAGGGGGCAGGCGCGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104417 GGGCTCAGGGGCCGGCGGCGGAGAGGGCCCCGAGGGGGCAGGCGCGGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 TGGGCAGCTGGGGGCTGGCAGAGGCGGCAGCTGCGGCCGCGGCCTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104467 TGGGCAGCTGGGGGCTGGCAGAGGCGGCAGCTGCGGCCGCGGCCTCCTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CCCCCATTTGCGTGCGGCGCCTGCGCGCGGCGCTTCGACCACGGCCGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104517 CCCCCATTTGCGTGCGGCGCCTGCGCGCGGCGCTTCGACCACGGCCGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GCTGGCGGCCCACTGGGCGGCGCACACCGACGTGAAGCCCTTCAAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104567 GCTGGCGGCCCACTGGGCGGCGCACACCGACGTGAAGCCCTTCAAGTGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CGCGCTGCGAGCGCGACTTCAACGCGCCCGCGCTGCTGGAGCGGCACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104617 CGCGCTGCGAGCGCGACTTCAACGCGCCCGCGCTGCTGGAGCGGCACAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTGACCCACGACCTGCAGGGCCCGGGCGCGCCCCCAGCGCAAGCCTGGGC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 104667 CTGACGCACGACCTGCAGGGCCCGGGCGCGCCCCCAGCGCAGGCCTGGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 CGCGGGGCCAGGCGCAGGGCCCGAGACGGCGGGCGAAGGCACCGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104717 CGCGGGGCCAGGCGCAGGGCCCGAGACGGCGGGCGAAGGCACCGCTGCGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGGCGGGCGACGCTCCTCTGGCTTCGGACCGCAGGCTGCTCCTGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104767 AGGCGGGCGACGCTCCTCTGGCTTCGGACCGCAGGCTGCTCCTGGGCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 GCGGGGGGCGGCGTGCCCAAGCTCGGGGGGCTGCTCCCCGAGGGCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104817 GCGGGGGGCGGCGTGCCCAAGCTCGGGGGGCTGCTCCCCGAGGGCGGTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GGAGGCGCCTGCACCTGCGGCGGCCGCCGAGCCCTCGGAAGACACCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104867 GGAGGCGCCTGCACCTGCGGCGGCCGCCGAGCCCTCGGAAGACACCCTGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 ACCAGTGCGACTGCGGGACCTTCTTTGCGTCGGCCGCGGCCCTGGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104917 ACCAGTGCGACTGCGGGACCTTCTTTGCGTCGGCCGCGGCCCTGGCCAGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CACCTGGAGGCCCACTCGGGCCCGGCCACCTACGGCTGCGGCCACTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104967 CACCTGGAGGCCCACTCGGGCCCGGCCACCTACGGCTGCGGCCACTGCGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGCTCTGTACGCGGCGCTGGCCGCCTTGGAGGAGCACCGGCGGGTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105017 GGCTCTGTACGCGGCGCTGGCCGCCTTGGAGGAGCACCGGCGGGTCAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 ACGGTGAGGGCGGCGGGGAGGAGGCGGCGGCCGCCGCCCGGGAAAGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 105067 ACGGTGAGGGCGGCGGGGAGGAGGCGGCGACCGCCGCCCGGGAAAGGGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CCGGCGTCCGGGGAACCCCCGTCTGGCTCCGGCCGCGGCAAGAAGATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105117 CCGGCGTCCGGGGAACCCCCGTCTGGCTCCGGCCGCGGCAAGAAGATCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1242 CGGCTGCTCCGAGTGCGAGAAGCTGTTCCGCTCACCGCGAGACCTGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105167 CGGCTGCTCCGAGTGCGAGAAGCTGTTCCGCTCACCGCGAGACCTGGAGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1292 GGCACGTGCTGGTGCACACTGGCGAGAAGCCGTTCCCGTGCCTGGAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105217 GGCACGTGCTGGTGCACACTGGCGAGAAGCCGTTCCCGTGCCTGGAGTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1342 GGCAAGTTCTTCCGCCACGAGTGCTACCTCAAGCGCCACCGGCTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105267 GGCAAGTTCTTCCGCCACGAGTGCTACCTCAAGCGCCACCGGCTGCTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1392 CGGCACCGAGCGGCCCTTCCCTTGCCACATCTGCGGCAAGGGCTTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105317 CGGCACCGAGCGGCCCTTCCCTTGCCACATCTGCGGCAAGGGCTTCATCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1442 CGCTCAGCAACCTCTCCAGGCACCTGAAGCTGCACCGGGGCATGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105367 CGCTCAGCAACCTCTCCAGGCACCTGAAGCTGCACCGGGGCATGGAC