seq1 = pF1KE4117.tfa, 1482 bp
seq2 = pF1KE4117/gi568815588r_97129147.tfa (gi568815588r:97129147_97392627), 263481 bp

>pF1KE4117 1482
>gi568815588r:97129147_97392627 (Chr10)

(complement)

1-56  (100001-100056)   100% ->
57-322  (126503-126768)   100% ->
323-403  (127722-127802)   100% ->
404-613  (128999-129208)   100% ->
614-840  (133000-133226)   99% ->
841-927  (136224-136310)   100% ->
928-993  (146291-146356)   100% ->
994-1185  (148469-148660)   100% ->
1186-1284  (157313-157411)   100% ->
1285-1395  (162754-162864)   100% ->
1396-1474  (163403-163481)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACTGAGGCACAGAGTGAAGGGGAGGTGCCAGCCCGCGAATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACTGAGGCACAGAGTGAAGGGGAGGTGCCAGCCCGCGAATCCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGAG         TGATGCCATCTGCAGTTTTGTGATCTGCAATGATT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGAGGTG...CAGTGATGCCATCTGCAGTTTTGTGATCTGCAATGATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTTCCCTTCGAGGTCAGCCCATTATCTTTAATCCTGACTTTTTTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126538 CTTCCCTTCGAGGTCAGCCCATTATCTTTAATCCTGACTTTTTTGTGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAACTCCGACATGAGAAACCTGAGATTTTCACTGAGTTGGTGGTCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126588 AAACTCCGACATGAGAAACCTGAGATTTTCACTGAGTTGGTGGTCAGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATCACAAGGCTCATCGATTTACCTGGAACTGAGTTGGCTCAGCTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126638 TATCACAAGGCTCATCGATTTACCTGGAACTGAGTTGGCTCAGCTGATGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGAAGTGGACCTTAAGTTGCCTGGCGGGGCTGGCCCAGCATCAGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126688 GGGAAGTGGACCTTAAGTTGCCTGGCGGGGCTGGCCCAGCATCAGGATTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCCGGTCTCTCATGTCTCTCAAGCGAAAGG         AAAAAGGAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 126738 TTCCGGTCTCTCATGTCTCTCAAGCGAAAGGGTA...CAGAAAAAGGAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GATATTTGGGTCCCCACTGACGGAGGAAGGCATTGCCCAGATATACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127732 GATATTTGGGTCCCCACTGACGGAGGAAGGCATTGCCCAGATATACCAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGATTGAGTATCTACACAAAA         ACTTGCGAGTAGAGGGTTTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 127782 TGATTGAGTATCTACACAAAAGTA...CAGACTTGCGAGTAGAGGGTTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTTAGAGTACCGGGTAATAGTGTCCGACAGCAGATTTTAAGGGATGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129019 TTTAGAGTACCGGGTAATAGTGTCCGACAGCAGATTTTAAGGGATGCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAATAATGGAACTGACATTGACTTGGAATCAGGGGAATTTCACTCAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129069 CAATAATGGAACTGACATTGACTTGGAATCAGGGGAATTTCACTCAAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATGTTGCCACTTTGCTGAAGATGTTTCTAGGAGAGTTGCCGGAGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129119 ATGTTGCCACTTTGCTGAAGATGTTTCTAGGAGAGTTGCCGGAGCCTCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CTGACACATAAACACTTCAATGCACACCTCAAAATCGCTG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 129169 CTGACACATAAACACTTCAATGCACACCTCAAAATCGCTGGTG...AAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTGATGCAGTTTGATGATAAAGGAAACAAGACCAATATACCAGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133001 TTTGATGCAGTTTGATGATAAAGGAAACAAGACCAATATACCAGACAAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACCGGCAAATTGAGGCTCTCCAGTTGCTCTTCCTCATTCTCCCTCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133051 ACCGGCAAATTGAGGCTCTCCAGTTGCTCTTCCTCATTCTCCCTCCTCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AATCGTAATTTGCTGAAGTTATTGCTTGATCTCCTATACCAGACAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133101 AATCGTAATTTGCTGAAGTTATTGCTTGATCTCCTATACCAGACAGCAAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAAACAAGACAAGAACAAGATGTCAGCCTATAACCTTGCCCTTATGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133151 GAAACAAGACAAGAACAAGATGTCAGCCTATAACCTTGCCCTTATGTTTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CACCCCACGTCCTGTGGCCAAAAAAT         GTCACTGCAAATGAC
        ||||||| ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 133201 CACCCCATGTCCTGTGGCCAAAAAATGTG...TAGGTCACTGCAAATGAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CTTCAGGAGAATATCACAAAGTTAAACAGTGGGATGGCTTTTATGATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136239 CTTCAGGAGAATATCACAAAGTTAAACAGTGGGATGGCTTTTATGATTAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 ACACTCCCAGAAACTTTTTAAG         GCTCCTGCTTACATTCGGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 136289 ACACTCCCAGAAACTTTTTAAGGTA...CAGGCTCCTGCTTACATTCGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 AGTGTGCGAGATTGCACTATTTGGGATCCAGAACTCAGGCATCAAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 146310 AGTGTGCGAGATTGCACTATTTGGGATCCAGAACTCAGGCATCAAAGGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    994       GATGACCTTGACCTCATAGCTTCATGTCATACTAAGTCCTTTCA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146360 ...TAGGATGACCTTGACCTCATAGCTTCATGTCATACTAAGTCCTTTCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GCTGGCAAAGTCTCAGAAACGGAACCGGGTAGATTCCTGCCCTCACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148513 GCTGGCAAAGTCTCAGAAACGGAACCGGGTAGATTCCTGCCCTCACCAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGGAGACCCAGCACCATACGGAAGAGGCACTGAGAGAGCTGTTTCAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148563 AGGAGACCCAGCACCATACGGAAGAGGCACTGAGAGAGCTGTTTCAACAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTTCATGATATGCCAGAGTCAGCAAAGAAGAAACAACTTATTAGACAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 148613 GTTCATGATATGCCAGAGTCAGCAAAGAAGAAACAACTTATTAGACAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1186        TTTAATAAGCAATCATTGACCCAGACACCAGGGCGAGAACCTT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148663 G...TAGTTTAATAAGCAATCATTGACCCAGACACCAGGGCGAGAACCTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 CTACTTCCCAGGTACAAAAGAGGGCTCGTTCGCGCTCCTTCAGTGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157356 CTACTTCCCAGGTACAAAAGAGGGCTCGTTCGCGCTCCTTCAGTGGGCTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATTAAG         CGGAAGGTCCTGGGAAATCAGATGATGTCAGAAAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157406 ATTAAGGTA...CAGCGGAAGGTCCTGGGAAATCAGATGATGTCAGAAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GAAAAAGAAGAACCCTACTCCAGAATCTGTGGCCATTGGTGAATTGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162789 GAAAAAGAAGAACCCTACTCCAGAATCTGTGGCCATTGGTGAATTGAAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GAACCAGCAAAGAAAATAGGAACTTA         TTATTTTCTGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 162839 GAACCAGCAAAGAAAATAGGAACTTAGTA...CAGTTATTTTCTGGCTCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 CCAGCTGTCACGATGACACCAACAAGATTGAAGTGGTCTGAAGGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 163418 CCAGCTGTCACGATGACACCAACAAGATTGAAGTGGTCTGAAGGGAAGAA

   1550     .    :
   1461 AGAGGGGAAAAAAG
        ||||||||||||||
 163468 AGAGGGGAAAAAAG