seq1 = pF1KE4110.tfa, 1443 bp
seq2 = pF1KE4110/gi568815592r_30053972.tfa (gi568815592r:30053972_30260858), 206887 bp

>pF1KE4110 1443
>gi568815592r:30053972_30260858 (Chr6)

(complement)

1-429  (100001-100429)   100% ->
430-525  (101614-101709)   100% ->
526-756  (102230-102460)   100% ->
757-779  (103468-103490)   100% ->
780-895  (103805-103920)   100% ->
896-928  (105100-105132)   100% ->
929-1443  (106373-106887)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCTGCTGCCTCTGTGACCAGCCTGGCAGATGAAGTCAACTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCTGCTGCCTCTGTGACCAGCCTGGCAGATGAAGTCAACTGCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATCTGTCAGGGTACCCTGAGGGAGCCGGTCACTATCGACTGCGGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATCTGTCAGGGTACCCTGAGGGAGCCGGTCACTATCGACTGCGGCCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGAGGAGTCCCCTACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGAGGAGTCCCCTACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAGCTTCCGGCCCAACTGGCAGCTGGCTAACGTGGTGGAGAACATTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAGCTTCCGGCCCAACTGGCAGCTGGCTAACGTGGTGGAGAACATTGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTGCCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGCACGGAGAGAAGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGCACGGAGAGAAGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTGCGTGGTGTGCCGGGAGGCTGGGGAGCACGCTACCCACACCATGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTGCGTGGTGTGCCGGGAGGCTGGGGAGCACGCTACCCACACCATGCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGG         GAACAAATCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100401 TCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGTA...CAGGAACAAATCCAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGTGTCTTAAATGTCTAAGAAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101626 AAGTGTCTTAAATGTCTAAGAAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGTCCTCCTG         ACTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101676 GTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGTCCTCCTGGTA...CAGACTCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGTCCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102237 TGTCCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TTTCTAGAGGAACAGCAGAGCATCCTCTTAGCACAATTGGAGAGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102287 TTTCTAGAGGAACAGCAGAGCATCCTCTTAGCACAATTGGAGAGCCAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGATTTGCTGGTTGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102337 TGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGATTTGCTGGTTGCTGGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102387 AGATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGGCCAGCAAGGGAGCTCCTGACG         GACATCAGAAGCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 102437 AGGCCAGCAAGGGAGCTCCTGACGGTG...TAGGACATCAGAAGCACTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 AATAAG         ATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103485 AATAAGGTA...TAGATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGTCGCCAGAGCTGGGCCAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103840 TGTCGCCAGAGCTGGGCCAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATGTTTCTGG         AAAAACTATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 103890 CCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATGTTTCTGGGTA...CAGAAAAACTATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTTTGAGTTGGACTATGAGCCAG         CTCACATTTCTCTAGACC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105110 CTTTGAGTTGGACTATGAGCCAGGTA...CAGCTCACATTTCTCTAGACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CTCAGACTTCCCACCCCAAGCTCCTCTTGTCCGAGGACCACCAGCGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106391 CTCAGACTTCCCACCCCAAGCTCCTCTTGTCCGAGGACCACCAGCGAGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCCAGCGTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 106441 CAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCCAACGTTTTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCGGGCCACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106491 CCGGGCCACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CGTGGGTGGTGAGTATAGACCTGGCCCATGGGGGCAGCTGCACCGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106541 CGTGGGTGGTGAGTATAGACCTGGCCCATGGGGGCAGCTGCACCGTGGGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GTGGTGAGCGAGGATGTGCAGCGGAAGGGGGAGCTTCGGCTGCGGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106591 GTGGTGAGCGAGGATGTGCAGCGGAAGGGGGAGCTTCGGCTGCGGCCAGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GGAGGGGGTGTGGGCTGTGAGGCTGGCTTGGGGCTTCGTCTCGGCTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106641 GGAGGGGGTGTGGGCTGTGAGGCTGGCTTGGGGCTTCGTCTCGGCTCTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GCTCCTTCCCCACACGGCTGACCCTGAAGGAGCAGCCCCGGCAGGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106691 GCTCCTTCCCCACACGGCTGACCCTGAAGGAGCAGCCCCGGCAGGTGAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 GTGTCTCTTGACTATGAGGTGGGCTGGGTGACCTTCACCAACGCTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106741 GTGTCTCTTGACTATGAGGTGGGCTGGGTGACCTTCACCAACGCTGTCAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CCGAGAGCCCATCTACACCTTCACTGCCTCCTTCACTAGGAAGGTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106791 CCGAGAGCCCATCTACACCTTCACTGCCTCCTTCACTAGGAAGGTCATTC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1397 CCTTCTTTGGGCTCTGGGGCCGAGGGTCCAGTTTCTCCCTGAGCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106841 CCTTCTTTGGGCTCTGGGGCCGAGGGTCCAGTTTCTCCCTGAGCTCC