seq1 = pF1KE4109.tfa, 1437 bp
seq2 = pF1KE4109/gi568815582r_594278.tfa (gi568815582r:594278_797405), 203128 bp

>pF1KE4109 1437
>gi568815582r:594278_797405 (Chr16)

(complement)

1-633  (100001-100633)   100% ->
634-1142  (101483-101991)   100% ->
1143-1227  (102330-102414)   100% ->
1228-1291  (102709-102772)   100% ->
1292-1437  (102983-103128)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGAGCCCGGGCATCGACGGCGACCCCAAGCCTCCATGCTTGCCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGAGCCCGGGCATCGACGGCGACCCCAAGCCTCCATGCTTGCCTCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAACGGTCTGGTGAAGCTGCCGGGCCAGCCCAACGGCCTGGGTGCGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAACGGTCTGGTGAAGCTGCCGGGCCAGCCCAACGGCCTGGGTGCGGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCATCACCAAGGGCACGCCAGCCACCAAGAACCGCCCCTGCCAGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCATCACCAAGGGCACGCCAGCCACCAAGAACCGCCCCTGCCAGCCACCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCCACCCACCCTCCCACCACCCAGCCTGGCTGCTCCACTGTCCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCCCACCCACCCTCCCACCACCCAGCCTGGCTGCTCCACTGTCCCGGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCCCTGGCTGGGGGCCCGTGCACCCCGGCAGGTGGACCAGCCTCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCCCTGGCTGGGGGCCCGTGCACCCCGGCAGGTGGACCAGCCTCAGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCACCTGGGCACCCAGCGGAGCGGCCGCCGCTGGCCACGGACGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCACCTGGGCACCCAGCGGAGCGGCCGCCGCTGGCCACGGACGAGAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCCTCAATGGGCTCTTCTGGTATTTCTCGGCCTGCGAGAAGTGTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCCTCAATGGGCTCTTCTGGTATTTCTCGGCCTGCGAGAAGTGTGTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCAGGTGTGCAAGGCCTGGCGGCGCGTGCTGTACCAGCCCAAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCAGGTGTGCAAGGCCTGGCGGCGCGTGCTGTACCAGCCCAAGTTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGGCAGGCCTCACGCCGGTGCTGCATGCCAAGGAGCTCTACAACGTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGGCAGGCCTCACGCCGGTGCTGCATGCCAAGGAGCTCTACAACGTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTGGTGGCGAGAAGGAGTTCGTGAACCTGCAGGGTTTTGCCGCCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTGGTGGCGAGAAGGAGTTCGTGAACCTGCAGGGTTTTGCCGCCAGAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCGAGGGCTTCTGCCTGGTTGGCGTCTCCGACCTGGACATCTGTGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCGAGGGCTTCTGCCTGGTTGGCGTCTCCGACCTGGACATCTGTGAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATTGACAACTATGCGCTCTCCAAGAAGGGTGTCAAAGCCATGAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATTGACAACTATGCGCTCTCCAAGAAGGGTGTCAAAGCCATGAGCCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGCGCTCCACCATCACGGACGCAGGCCTCGAG         GTTATGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100601 AAGCGCTCCACCATCACGGACGCAGGCCTCGAGGTG...CAGGTTATGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGAACAGATGCAGGGCGTGGTGCGTCTGGAGCTGTCGGGCTGCAACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101491 TGAACAGATGCAGGGCGTGGTGCGTCTGGAGCTGTCGGGCTGCAACGACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCACCGAGGCCGGGCTGTGGTCCAGCCTGAGCGCGCGCATCACCTCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101541 TCACCGAGGCCGGGCTGTGGTCCAGCCTGAGCGCGCGCATCACCTCGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGCGTGAGTGACTGCATCAACGTGGCCGACGACGCCATCGCGGCCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101591 AGCGTGAGTGACTGCATCAACGTGGCCGACGACGCCATCGCGGCCATCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GCAGCTGCTGCCCAACCTGGCGGAGCTGAGCCTGCAGGCCTACCACGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101641 GCAGCTGCTGCCCAACCTGGCGGAGCTGAGCCTGCAGGCCTACCACGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 CGGACACGGCGCTGGCCTACTTCACGGCGCGCCAGGGCCACAGCACGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101691 CGGACACGGCGCTGGCCTACTTCACGGCGCGCCAGGGCCACAGCACGCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ACGCTGCGCCTGCTCTCCTGCTGGGAGATCACCAACCACGGCGTGGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101741 ACGCTGCGCCTGCTCTCCTGCTGGGAGATCACCAACCACGGCGTGGTCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CGTGGTGCACAGCCTGCCCAACCTCACCGCGCTCAGCCTCTCGGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101791 CGTGGTGCACAGCCTGCCCAACCTCACCGCGCTCAGCCTCTCGGGCTGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CCAAGGTCACCGACGACGGCGTGGAGCTCGTGGCCGAGAACCTGCGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101841 CCAAGGTCACCGACGACGGCGTGGAGCTCGTGGCCGAGAACCTGCGCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CTGCGCAGCCTTGACCTCTCGTGGTGCCCACGCATCACCGACATGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101891 CTGCGCAGCCTTGACCTCTCGTGGTGCCCACGCATCACCGACATGGCGCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 GGAGTACGTGGCCTGCGACCTGCACCGCCTAGAGGAGCTCGTGCTCGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101941 GGAGTACGTGGCCTGCGACCTGCACCGCCTAGAGGAGCTCGTGCTCGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 G         GTGTGTACGCATCACGGACACTGGCCTCAGCTATCTGTCC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101991 GGTG...CAGGTGTGTACGCATCACGGACACTGGCCTCAGCTATCTGTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 ACCATGTCGTCCCTCCGCAGCCTCTACCTGCGATGGTGCTGCCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102370 ACCATGTCGTCCCTCCGCAGCCTCTACCTGCGATGGTGCTGCCAGGTA..

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1228     GTGCAAGACTTCGGGCTGAAGCACCTCCTGGCCCTGGGGAGTTTGC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102420 .CAGGTGCAAGACTTCGGGCTGAAGCACCTCCTGGCCCTGGGGAGTTTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GCCTCCTGTCTCTGGCAG         GCTGCCCGCTGCTCACCACCACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 102755 GCCTCCTGTCTCTGGCAGGTG...CAGGCTGCCCGCTGCTCACCACCACC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 GGGCTGTCGGGCCTGGTGCAGCTGCAGGAGCTGGAGGAGCTGGAGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103006 GGGCTGTCGGGCCTGGTGCAGCTGCAGGAGCTGGAGGAGCTGGAGCTGAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 CAACTGCCCCGGGGCCACCCCCGAGCTCTTCAAGTATTTCTCGCAGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103056 CAACTGCCCCGGGGCCACCCCCGAGCTCTTCAAGTATTTCTCGCAGCACC

   1450     .    :    .    :
   1415 TGCCCCGCTGCCTCGTCATTGAG
        |||||||||||||||||||||||
 103106 TGCCCCGCTGCCTCGTCATTGAG