seq1 = pF1KE4107.tfa, 1434 bp
seq2 = pF1KE4107/gi568815581r_74256660.tfa (gi568815581r:74256660_74461819), 205160 bp

>pF1KE4107 1434
>gi568815581r:74256660_74461819 (Chr17)

(complement)

1-85  (100001-100085)   100% ->
86-362  (101575-101851)   100% ->
363-1434  (104089-105160)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTAGGAGAGGCTACTCCAAGCCTGGGTCCTGGGGCAGCTTCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTAGGAGAGGCTACTCCAAGCCTGGGTCCTGGGGCAGCTTCTGGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATGCTGACCTTGGTGGGCCTGGTCACCCATGCAG         CACAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100051 CATGCTGACCTTGGTGGGCCTGGTCACCCATGCAGGTG...CAGCACAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GAGCCGATGTTGGCGGGGAGGCAGCTGGCACCTCCATCAACCACTCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101581 GAGCCGATGTTGGCGGGGAGGCAGCTGGCACCTCCATCAACCACTCCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCGGTGCTCCAGCGCTTGCAGGAGCTGCTGCGGCAGGGCAACGCCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101631 GCGGTGCTCCAGCGCTTGCAGGAGCTGCTGCGGCAGGGCAACGCCAGCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTGGTTCTGCGGGTGCAGGCTGCGGGCACCGATGAGGTCCGGGTATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101681 TGTGGTTCTGCGGGTGCAGGCTGCGGGCACCGATGAGGTCCGGGTATTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ACGCCCACCGCCTGCTGCTGGGACTGCACAGTGAGCTGTTCCTGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101731 ACGCCCACCGCCTGCTGCTGGGACTGCACAGTGAGCTGTTCCTGGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTAAGTAACCAGAGCGAGGCGGTGCTGCAGGAGCCACAGGACTGCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101781 CTAAGTAACCAGAGCGAGGCGGTGCTGCAGGAGCCACAGGACTGCGCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGTCTTCGACAAGTTCATCAG         GTACCTGTACTGCGGGGAGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 101831 TGTCTTCGACAAGTTCATCAGGTG...CAGGTACCTGTACTGCGGGGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TGACCGTGCTGCTGACCCAGGCCATCCCCCTGCACAGACTGGCCACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104109 TGACCGTGCTGCTGACCCAGGCCATCCCCCTGCACAGACTGGCCACCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TACGGCGTGTCCTCCCTGCAGCGCGGCGTGGCCGACTACATGCGCGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104159 TACGGCGTGTCCTCCCTGCAGCGCGGCGTGGCCGACTACATGCGCGCGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTGGCGGGAGGCGCGGGCCCGGCGGTGGGCTGGTACCACTACGCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104209 CCTGGCGGGAGGCGCGGGCCCGGCGGTGGGCTGGTACCACTACGCGGTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GCACCGGGGACGAGGCCCTGCGCGAGAGCTGCCTGCAGTTCCTGGCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104259 GCACCGGGGACGAGGCCCTGCGCGAGAGCTGCCTGCAGTTCCTGGCCTGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AACCTGTCGGCCGTGGCGGCCAGCACCGAGTGGGGCGCCGTGAGCCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104309 AACCTGTCGGCCGTGGCGGCCAGCACCGAGTGGGGCGCCGTGAGCCCCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GCTGCTCTGGCAGCTCCTGCAACGCTCGGACCTGGTGCTGCAGGATGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104359 GCTGCTCTGGCAGCTCCTGCAACGCTCGGACCTGGTGCTGCAGGATGAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGGAGCTGTTCCACGCGCTGGAGGCCTGGCTGGGTCGCGCGCGGCCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104409 TGGAGCTGTTCCACGCGCTGGAGGCCTGGCTGGGTCGCGCGCGGCCGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CCTGCCGTGGCCGAGCGGGCGCTGCGCGCCATACGCTACCCCATGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104459 CCTGCCGTGGCCGAGCGGGCGCTGCGCGCCATACGCTACCCCATGATCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 ACCGGCACAGCTGTTCCAGCTGCAGGCGCGCTCGGCAGCCCTGGCGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104509 ACCGGCACAGCTGTTCCAGCTGCAGGCGCGCTCGGCAGCCCTGGCGCGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACGGCCCCGCGGTGGCCGACCTCCTGCTGCAGGCCTACCAGTTCCACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104559 ACGGCCCCGCGGTGGCCGACCTCCTGCTGCAGGCCTACCAGTTCCACGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GCGTCGCCGCTGCACTACGCCAAGTTCTTCGACGTCAACGGCAGCGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104609 GCGTCGCCGCTGCACTACGCCAAGTTCTTCGACGTCAACGGCAGCGCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CCTGCCCCGCAACTACCTCGCGCCCGCCTGGGGCGCCCCGTGGGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104659 CCTGCCCCGCAACTACCTCGCGCCCGCCTGGGGCGCCCCGTGGGTCATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ACAACCCGGCCCGCGACGACCGCAGCACCAGCTTCCAGACGCAGCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104709 ACAACCCGGCCCGCGACGACCGCAGCACCAGCTTCCAGACGCAGCTGGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CCGAGTGGCCACGACGCGGGCCGCCGGGTCACCTGGAACGTGCTCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104759 CCGAGTGGCCACGACGCGGGCCGCCGGGTCACCTGGAACGTGCTCTTCTC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 GCCGCGCTGGCTGCCCGTCAGCCTGCGGCCCGTTTACGCGGACGCCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104809 GCCGCGCTGGCTGCCCGTCAGCCTGCGGCCCGTTTACGCGGACGCCGCGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GCACTGCTCTGCCCGCCGCGCGCCCGGAGGACGGCCGACCGCGGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104859 GCACTGCTCTGCCCGCCGCGCGCCCGGAGGACGGCCGACCGCGGCTGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GTGACGCCGGCCAGCAGCGGCGGCGACGCGGCGGGCGTGAGCTTCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104909 GTGACGCCGGCCAGCAGCGGCGGCGACGCGGCGGGCGTGAGCTTCCAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GACGGTGCTGGTGGGGGCGCGCCAGCAGGGCCGCCTGCTGGTCCGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104959 GACGGTGCTGGTGGGGGCGCGCCAGCAGGGCCGCCTGCTGGTCCGCCACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 CCTACAGCTTCCACCAGAGCAGCGAGGAGGCCGGCGACTTCCTGGCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105009 CCTACAGCTTCCACCAGAGCAGCGAGGAGGCCGGCGACTTCCTGGCGCAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 GCCGACCTGCAGCGGCGCAACTCCGAGTACCTGGTTGAGAACGCCCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105059 GCCGACCTGCAGCGGCGCAACTCCGAGTACCTGGTTGAGAACGCCCTGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 CCTGCACCTCATCGTCAAGCCCGTATACCACACCCTTATCCGGACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105109 CCTGCACCTCATCGTCAAGCCCGTATACCACACCCTTATCCGGACCCCCA

   1450 
   1433 AG
        ||
 105159 AG