seq1 = pF1KE4086.tfa, 1347 bp
seq2 = pF1KE4086/gi568815587f_89868504.tfa (gi568815587f:89868504_90073886), 205383 bp

>pF1KE4086 1347
>gi568815587f:89868504_90073886 (Chr11)

(complement)

1-408  (197870-198277)   100% ->
409-504  (198814-198909)   100% ->
505-735  (199608-199838)   100% ->
736-758  (200597-200619)   100% ->
759-856  (201575-201672)   100% ->
857-1347  (202773-203263)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATTCAGACGACCTGCAAGTCTTCCAGAATGAGCTCATTTGCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197870 ATGGATTCAGACGACCTGCAAGTCTTCCAGAATGAGCTCATTTGCTGCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTGCGTGAACTACTTCATAGATCCGGTCACCATTGACTGTGGGCACAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197920 TTGCGTGAACTACTTCATAGATCCGGTCACCATTGACTGTGGGCACAGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTGCAGGCCCTGCCTCTGCCTCTGCTCAGAAGAAGGCAGAGCACCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197970 TTTGCAGGCCCTGCCTCTGCCTCTGCTCAGAAGAAGGCAGAGCACCAATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCTGCCCTTCGTGCAGAAAAACCTCAGAGAAGCCCAACTTCAACACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198020 CGCTGCCCTTCGTGCAGAAAAACCTCAGAGAAGCCCAACTTCAACACCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTGGTACTCAAAAAGCTGTCTTCCCTAGCCAGACAGACCAGACCTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198070 TCTGGTACTCAAAAAGCTGTCTTCCCTAGCCAGACAGACCAGACCTCAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACATCAACAGCTCAGACAATATCTGTGTGCTCCATGAGGAGACTAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198120 ACATCAACAGCTCAGACAATATCTGTGTGCTCCATGAGGAGACTAAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTTCTGTGAGGCTGACAAGAGATTGCTCTGTGGGCCCTGCTCTGAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198170 CTCTTCTGTGAGGCTGACAAGAGATTGCTCTGTGGGCCCTGCTCTGAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ACCAGAGCACATGGCTCACAGCCACAGCCCAATAGGATGGGCTGCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198220 ACCAGAGCACATGGCTCACAGCCACAGCCCAATAGGATGGGCTGCTGAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AATGCAGG         GAGAAACTTATAAAGGAAATGGACTATTTATGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 198270 AATGCAGGGTA...CAGGAGAAACTTATAAAGGAAATGGACTATTTATGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAAATCAATCAAGAGACAAGAAACAATCTAAATCAGGAAACTAGCACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198847 GAAATCAATCAAGAGACAAGAAACAATCTAAATCAGGAAACTAGCACATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TCATTCGTTAAAG         GACTATGTGTCAGTAAGGAAGAGGATAA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 198897 TCATTCGTTAAAGGTA...CAGGACTATGTGTCAGTAAGGAAGAGGATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCACTATTCAATATCAAAAGATGCCTATATTTCTCGATGAGGAGGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199636 TCACTATTCAATATCAAAAGATGCCTATATTTCTCGATGAGGAGGAGCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CGGCATCTGCAGGCACTGGAAAGAGAAGCAGAAGAGCTTTTCCAACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199686 CGGCATCTGCAGGCACTGGAAAGAGAAGCAGAAGAGCTTTTCCAACAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 ACAAGACAGTCAAGTGAGAATGACCCAACATTTAGAAAGGATGAAAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199736 ACAAGACAGTCAAGTGAGAATGACCCAACATTTAGAAAGGATGAAAGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGTACAGAGAGCTGTGGGAGACATGCCACATGCCTGACGTGGTGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199786 TGTACAGAGAGCTGTGGGAGACATGCCACATGCCTGACGTGGTGCTGCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 CAG         GATGTGAGAAATGTATCAGCAAG         GACTGA
        |||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 199836 CAGGTG...CAGGATGTGAGAAATGTATCAGCAAGGTG...CAGGACTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TTTGGCACAGATGCAAAAGCCCCAGCCAGTGAACCCAGAGCTCACTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201581 TTTGGCACAGATGCAAAAGCCCCAGCCAGTGAACCCAGAGCTCACTTCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GGTGCATAACTGGAGTCCTAGACATGCTCAACAACTTCAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 201631 GGTGCATAACTGGAGTCCTAGACATGCTCAACAACTTCAGAGGTA...CA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    857  TGGATAGTGCTCTGAGCACGGAAATGATTCCTTGCTATATAAGCCTTTC
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202772 GTGGATAGTGCTCTGAGCACGGAAATGATTCCTTGCTATATAAGCCTTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGAGGATGTGAGATATGTGATATTTGGAGATGACCATCTCAGTGCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202822 TGAGGATGTGAGATATGTGATATTTGGAGATGACCATCTCAGTGCTCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 CGGATCCCCAGGGAGTGGACAGCTTTGCTGTGTGGGGAGCGCAAGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202872 CGGATCCCCAGGGAGTGGACAGCTTTGCTGTGTGGGGAGCGCAAGCATTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ACCTCCGGCAAGCATTACTGGGAGGTGGATGTGACCCTCTCCTCCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202922 ACCTCCGGCAAGCATTACTGGGAGGTGGATGTGACCCTCTCCTCCAACTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GATTCTGGGAGTCTGTCGAGATTCCAGGACTGCAGATGCCAATTTCGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202972 GATTCTGGGAGTCTGTCGAGATTCCAGGACTGCAGATGCCAATTTCGTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TTGATTCTGATGAAAGATTTTTTTTAATTTCCTCAAAGAGGAGCAATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203022 TTGATTCTGATGAAAGATTTTTTTTAATTTCCTCAAAGAGGAGCAATCAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TATAGTCTCTCCACCAACTCTCCACCTTTAATTCAGTATGTGCAAAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203072 TATAGTCTCTCCACCAACTCTCCACCTTTAATTCAGTATGTGCAAAGGCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TCTGGGTCGAGTTGGGGTGTTTCTGGATTATGATAATGGATCTGTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203122 TCTGGGTCGAGTTGGGGTGTTTCTGGATTATGATAATGGATCTGTGAGTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TTTTTGATGTTTCTAAAGGTTCTCTTATCTATGGTTTTCCTCCTTCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203172 TTTTTGATGTTTCTAAAGGTTCTCTTATCTATGGTTTTCCTCCTTCCTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TTCTCTTCCCCTCTGAGGCCTTTCTTTTGCTTTGGTTGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203222 TTCTCTTCCCCTCTGAGGCCTTTCTTTTGCTTTGGTTGTACA