seq1 = pF1KE4073.tfa, 1146 bp
seq2 = pF1KE4073/gi568815579r_55988026.tfa (gi568815579r:55988026_56203217), 215192 bp

>pF1KE4073 1146
>gi568815579r:55988026_56203217 (Chr19)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-1146  (114126-115192)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGCGGGAAGAAGCCTGGTCTCCGGGGCCGCTGGATTCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTGCGGGAAGAAGCCTGGTCTCCGGGGCCGCTGGATTCTGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGCAGATGGCCAGTCACGAGAACCCAG         TGGACATCCTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 CCAGCAGATGGCCAGTCACGAGAACCCAGGTG...CAGTGGACATCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCATGGATGATGACGACGTCCCCAGCTGGCCTCCCACCAAGCTGTCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114138 TCATGGATGATGACGACGTCCCCAGCTGGCCTCCCACCAAGCTGTCCCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCCCAGTCTGCGCCCCCAGCCGGCCCGCCTCCCCGGCCGCGGCCGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114188 CCCCAGTCTGCGCCCCCAGCCGGCCCGCCTCCCCGGCCGCGGCCGCCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCCTACATCTGCAACGAGTGTGGCAAGAGCTTTAGCCACTGGTCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114238 CCCCTACATCTGCAACGAGTGTGGCAAGAGCTTTAGCCACTGGTCCAAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGACGCGGCACCAGCGCACGCACACCGGCGAGCGGCCCAACGCCTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114288 TGACGCGGCACCAGCGCACGCACACCGGCGAGCGGCCCAACGCCTGCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACTGCGGCAAGACCTTCTCGCAGAGCTCGCACCTGGTGCAGCACCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114338 GACTGCGGCAAGACCTTCTCGCAGAGCTCGCACCTGGTGCAGCACCGGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACGCCTGCTTGGAGTGCGGCAAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114388 CATCCACACGGGCGAGAAGCCCTACGCCTGCTTGGAGTGCGGCAAGCGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCAGCTGGAGCTCCAACCTCATGCAGCACCAGCGCATCCACACGGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114438 TCAGCTGGAGCTCCAACCTCATGCAGCACCAGCGCATCCACACGGGCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 AAGCCCTACACCTGCCCCGACTGCGGCCGCAGCTTCACTCAGAGCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114488 AAGCCCTACACCTGCCCCGACTGCGGCCGCAGCTTCACTCAGAGCAAGAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCTGGCCAAGCACCGGCGCTCGCACAGCGGCCTCAAGCCCTTCGTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114538 CCTGGCCAAGCACCGGCGCTCGCACAGCGGCCTCAAGCCCTTCGTGTGCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CGCGCTGCGGCCGCGGCTTCAGCCAGCCCAAGAGCCTCGCGCGTCACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114588 CGCGCTGCGGCCGCGGCTTCAGCCAGCCCAAGAGCCTCGCGCGTCACCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGGCTGCACCCGGAGCTGTCGGGGCCTGGCGTGGCGGCCAAGGTGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114638 CGGCTGCACCCGGAGCTGTCGGGGCCTGGCGTGGCGGCCAAGGTGCTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGCTAGCGTCCGGCGGGCCAAGGGGCCCGAAGAGGCGGTGGCGGCGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114688 GGCTAGCGTCCGGCGGGCCAAGGGGCCCGAAGAGGCGGTGGCGGCGGACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GCGAGATCGCCATCCCCGTGGGCGATGGCGAGGGCATCATCGTGGTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114738 GCGAGATCGCCATCCCCGTGGGCGATGGCGAGGGCATCATCGTGGTGGGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCGCCGGGCGAGGGGGCCGCGGCCGCGGCAGCCATGGCGGGCGCGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114788 GCGCCGGGCGAGGGGGCCGCGGCCGCGGCAGCCATGGCGGGCGCGGGGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AAAGGCCGCGGGGCCCCGGTCGCGGCGCGCCCCGGCCCCCAAGCCGTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114838 AAAGGCCGCGGGGCCCCGGTCGCGGCGCGCCCCGGCCCCCAAGCCGTACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TGTGTCTGGAGTGCGGGAAGGGCTTCGGGCACGGGGCCGGGCTCCTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114888 TGTGTCTGGAGTGCGGGAAGGGCTTCGGGCACGGGGCCGGGCTCCTGGCG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CACCAGCGGGCCCAGCACGGGGACGGGCTCGGGGCGGCGGGGGGCGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114938 CACCAGCGGGCCCAGCACGGGGACGGGCTCGGGGCGGCGGGGGGCGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 GCCGGCCCACATCTGCGTGGAGTGCGGGGAGGGCTTCGTGCAGGGCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114988 GCCGGCCCACATCTGCGTGGAGTGCGGGGAGGGCTTCGTGCAGGGCGCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 CGCTCCGGAGACACAAGAAGATCCACGCGGTGGGCGCGCCCTCGGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115038 CGCTCCGGAGACACAAGAAGATCCACGCGGTGGGCGCGCCCTCGGTCTGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 AGCAGCTGCGGACAGAGCTACTACCGCGCGGGCGGGGAGGAGGAGGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115088 AGCAGCTGCGGACAGAGCTACTACCGCGCGGGCGGGGAGGAGGAGGACGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1092 CGACGACGAGGCCGCGGGCGGGCGGTGCCCCGAGTGCCGCGGTGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115138 CGACGACGAGGCCGCGGGCGGGCGGTGCCCCGAGTGCCGCGGTGGGGAGG

   1150     .
   1142 GCCGG
        |||||
 115188 GCCGG