seq1 = pF1KE4042.tfa, 651 bp
seq2 = pF1KE4042/gi568815591f_140307647.tfa (gi568815591f:140307647_140526147), 218501 bp

>pF1KE4042 651
>gi568815591f:140307647_140526147 (Chr7)

1-201  (100001-100201)   100% ->
202-385  (104228-104411)   100% ->
386-651  (118236-118501)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACTTCTCCAGCTCAGCCAGGGCAGCAGATGAGAACTTTGACTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCACTTCTCCAGCTCAGCCAGGGCAGCAGATGAGAACTTTGACTATTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCAAGATTATCCTCATTGGGGATTCCAATGTGGGGAAGACGTGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCAAGATTATCCTCATTGGGGATTCCAATGTGGGGAAGACGTGTGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCAGCATTTCAAGTCTGGAGTCTACACTGAGACACAGCAGAACACGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCAGCATTTCAAGTCTGGAGTCTACACTGAGACACAGCAGAACACGATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAGTGGACTTTACCGTGCGTTCCCTTGATATTGACGGCAAAAAAGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGAGTGGACTTTACCGTGCGTTCCCTTGATATTGACGGCAAAAAAGTGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 G         ATGCAGGTGTGGGACACAGCTGGCCAGGAGCGCTTCCGCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTC...CAGATGCAGGTGTGGGACACAGCTGGCCAGGAGCGCTTCCGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCATCACCCAAAGCTACTACCGCAGTGCCCACGCAGCCATCATCGCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104268 CCATCACCCAAAGCTACTACCGCAGTGCCCACGCAGCCATCATCGCCTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACCTCACCCGGCGGTCCACGTTCGAGTCCATCCCTCACTGGATTCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104318 GACCTCACCCGGCGGTCCACGTTCGAGTCCATCCCTCACTGGATTCATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GATAGAGAAATATGGAGCTGCAAATGTGGTCATTATGCTGATTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 104368 GATAGAGAAATATGGAGCTGCAAATGTGGTCATTATGCTGATTGGTA...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    386    GAAATAAATGTGACCTCTGGGAAAAGCGGCACGTCCTGTTCGAGGAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118233 CAGGAAATAAATGTGACCTCTGGGAAAAGCGGCACGTCCTGTTCGAGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCTGCACACTGGCTGAGAAGCACGGCCTCCTGGCCGTTTTGGAGACATC
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 118283 GCCTGCACACTGGCTGAGAAGTACGGCCTCCTGGCCGTTTTGGAGACATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGCCAAGGAGTCAAAGAACATAGAAGAAGTCTTCGTGCTCATGGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118333 TGCCAAGGAGTCAAAGAACATAGAAGAAGTCTTCGTGCTCATGGCCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGCTGATCGCGCGCAACAGCCTGCACCTATATGGGGAGAGTGCCCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118383 AGCTGATCGCGCGCAACAGCCTGCACCTATATGGGGAGAGTGCCCTGAAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGCCTCCCCCTGGACTCCAGCCCCGTTCTTATGGCCCAGGGTCCAAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118433 GGCCTCCCCCTGGACTCCAGCCCCGTTCTTATGGCCCAGGGTCCAAGTGA

    650     .    :    .
    633 AAAGACCCACTGCACTTGC
        |||||||||||||||||||
 118483 AAAGACCCACTGCACTTGC