seq1 = pF1KE4024.tfa, 681 bp
seq2 = pF1KE4024/gi568815597r_19714421.tfa (gi568815597r:19714421_19915101), 200681 bp

>pF1KE4024 681
>gi568815597r:19714421_19915101 (Chr1)

(complement)

1-681  (100001-100681)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTGCACCAAGACCCTGCAACAGTCCCAGCCCATCTCCGCAGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTGCACCAAGACCCTGCAACAGTCCCAGCCCATCTCCGCAGGAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCACAACCACCACCGCTGTGGCCCCTGCTGGGGGTCATTCTGGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCACAACCACCACCGCTGTGGCCCCTGCTGGGGGTCATTCTGGCTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGAATGTGACCTGGAGTGTCTGGTGTGCCGGGAGCCCTACAGCTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGAATGTGACCTGGAGTGTCTGGTGTGCCGGGAGCCCTACAGCTGTCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGTTGCCCAAGCTGCTGGCCTGCCAGCATGCCTTCTGCGCCATCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGTTGCCCAAGCTGCTGGCCTGCCAGCATGCCTTCTGCGCCATCTGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAGCTCCTGCTGTGCGTGCAGGACAACACCTGGTCCATCACCTGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAGCTCCTGCTGTGCGTGCAGGACAACACCTGGTCCATCACCTGCCCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGTGCCGCAAGGTCACCGCCGTCCCCGGGGGCCTCATCTGCAGCCTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGTGCCGCAAGGTCACCGCCGTCCCCGGGGGCCTCATCTGCAGCCTGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACCATGAGGCGGTGGTGGGGCAGCTGGCCCAGCCATGCACAGAGGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACCATGAGGCGGTGGTGGGGCAGCTGGCCCAGCCATGCACAGAGGTATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTCTGTCCTCAGGGGCTGGTGGATCCTGCTGACTTGGCAGCAGGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTCTGTCCTCAGGGGCTGGTGGATCCTGCTGACTTGGCAGCAGGACACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCAGCTTGGTGGGAGAGGATGGACAGGATGAAGTAAGTGCAAACCACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCAGCTTGGTGGGAGAGGATGGACAGGATGAAGTAAGTGCAAACCACGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCAGCCCGGCGCCTGGCCGCGCACCTACTCCTGCTGGCCTTGCTCATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAGCCCGGCGCCTGGCCGCGCACCTACTCCTGCTGGCCTTGCTCATTAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTCATCGGGCCCTTCATCTACCCGGGTGTCTTACGATGGGTGCTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTCATCGGGCCCTTCATCTACCCGGGTGTCTTACGATGGGTGCTCACCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATCATCGCCCTGGCCCTGCTGATGTCCACCCTCTTCTGCTGTCTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATCATCGCCCTGGCCCTGCTGATGTCCACCCTCTTCTGCTGTCTCCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AGCACCCGGGGCAGCTGCTGGCCCTCCTCCAGGACTCTCTTCTGCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AGCACCCGGGGCAGCTGCTGGCCCTCCTCCAGGACTCTCTTCTGCAGAGA

    650     .    :    .    :    .    :
    651 GCAGAAACACAGCCACATCTCTTCCATTGCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCAGAAACACAGCCACATCTCTTCCATTGCC