seq1 = pF1KE3995.tfa, 849 bp
seq2 = pF1KE3995/gi568815579r_38925414.tfa (gi568815579r:38925414_39132227), 206814 bp

>pF1KE3995 849
>gi568815579r:38925414_39132227 (Chr19)

(complement)

1-364  (100001-100364)   100% ->
365-476  (100908-101019)   100% ->
477-572  (101104-101199)   100% ->
573-708  (105223-105358)   100% ->
709-849  (106674-106814)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGCCTCGGTCTCCAGGGGCCGGGCCGCCCGGGTCCCCGCGCCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCGCCTCGGTCTCCAGGGGCCGGGCCGCCCGGGTCCCCGCGCCGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCGGAACCCGAAGAGGCGCTGGACCTGAGCCAACTACCCCCAGAGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCGGAACCCGAAGAGGCGCTGGACCTGAGCCAACTACCCCCAGAGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTCTGGTGGTGCTGAGCCACGTCCCCCCGCGCACGCTGCTCGGGCGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTCTGGTGGTGCTGAGCCACGTCCCCCCGCGCACGCTGCTCGGGCGCTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCCAAGTGTGCCGGGGCTGGCGAGCCCTGGTGGACGGCCAGGCCCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCCAAGTGTGCCGGGGCTGGCGAGCCCTGGTGGACGGCCAGGCCCTGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGCTGATCCTGGCCCGCGACCACGGCGCCACCGGCCGCGCGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGCTGATCCTGGCCCGCGACCACGGCGCCACCGGCCGCGCGCTGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTCGCCCGCAGCTGCCAGTCTCCCGCCCGTAACGCCAGGCCTTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTCGCCCGCAGCTGCCAGTCTCCCGCCCGTAACGCCAGGCCTTGCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGGCCGCTTCTGCGCGCGCAGACCCATCGGACGCAACCTTATTCGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGGCCGCTTCTGCGCGCGCAGACCCATCGGACGCAACCTTATTCGCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCCTGCGGCCAAG         AAGGCCTCCGAAAGTGGATGGTGCAAC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCCTGCGGCCAAGGTG...CAGAAGGCCTCCGAAAGTGGATGGTGCAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACGGTGGGGACGGCTGGGTGGTGGAGGAAAACAGGACAACCGTGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100935 ACGGTGGGGACGGCTGGGTGGTGGAGGAAAACAGGACAACCGTGCCTGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCCCTTCTCAGACGTGCTTCGTGACTTCATTCAG         CTGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100985 GCCCCTTCTCAGACGTGCTTCGTGACTTCATTCAGGTG...CAGCTGGTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTGCAAGAAGCAGGTCTTGGACCTAGAGGAGGAGGGTCTGTGGCCAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101110 TTGCAAGAAGCAGGTCTTGGACCTAGAGGAGGAGGGTCTGTGGCCAGAAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCTGGATAGTGGCAGGATTGAGATTTGTGTCTCTGACTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 101160 TGCTGGATAGTGGCAGGATTGAGATTTGTGTCTCTGACTGGTG...CAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TGGGGAGCCCGACACGACAGCGGCTGTATGTACAGACTCCTCGTCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105224 TGGGGAGCCCGACACGACAGCGGCTGTATGTACAGACTCCTCGTCCAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCTAGACGCCAACCAGACTGTTCTAGATAAATTCTCTGCTGTGCCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105274 TCTAGACGCCAACCAGACTGTTCTAGATAAATTCTCTGCTGTGCCTGATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCATCCCGCAGTGGAACAACAATGCCTGCCTTCAC         GTCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 105324 CCATCCCGCAGTGGAACAACAATGCCTGCCTTCACGTG...CAGGTCACC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CACGTGTTCTCCAACATCAAGATGGGCGTCCGCTTTGTGTCTTTCGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106680 CACGTGTTCTCCAACATCAAGATGGGCGTCCGCTTTGTGTCTTTCGAACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCGGGGCCAGGACACACAGTTCTGGGCTGGCCACTATGGAGCCCGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106730 CCGGGGCCAGGACACACAGTTCTGGGCTGGCCACTATGGAGCCCGTGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .
    815 CCAACTCCAGTGTGATCGTGCGAGTCCGTCTGTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106780 CCAACTCCAGTGTGATCGTGCGAGTCCGTCTGTCC