seq1 = pF1KE3990.tfa, 624 bp
seq2 = pF1KE3990/gi568815584r_64848668.tfa (gi568815584r:64848668_65072076), 223409 bp

>pF1KE3990 624
>gi568815584r:64848668_65072076 (Chr14)

(complement)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-185  (119506-119566)   100% ->
186-246  (120414-120474)   100% ->
247-455  (120926-121134)   100% ->
456-545  (121663-121752)   100% ->
546-611  (123344-123409)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGAAGCAGTACGATGTGCTGTTCCGGCTGCTGCTGATCGGGGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGAAGCAGTACGATGTGCTGTTCCGGCTGCTGCTGATCGGGGACTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGGTGGGCAAGACCTGCCTGCTGTGCCGCTTCACCGACAACGAGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGGTGGGCAAGACCTGCCTGCTGTGCCGCTTCACCGACAACGAGTTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTCCTCGCACATCTCCACCATCG         GTGTTGACTTTAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 ACTCCTCGCACATCTCCACCATCGGTA...CAGGTGTTGACTTTAAGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGACCATAGAGGTAGACGGCATCAAAGTGCGGATACAGATCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 119523 AAGACCATAGAGGTAGACGGCATCAAAGTGCGGATACAGATCTGGTG...

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    186    GGACACTGCAGGGCAGGAGAGATACCAGACCATCACAAAGCAGTACT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120411 CAGGGACACTGCAGGGCAGGAGAGATACCAGACCATCACAAAGCAGTACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATCGGCGGGCCCAG         GGGATATTTTTGGTCTATGACATTAGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 120461 ATCGGCGGGCCCAGGTA...CAGGGGATATTTTTGGTCTATGACATTAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGCGAGCGCTCTTACCAGCACATCATGAAGTGGGTCAGTGACGTGGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120953 AGCGAGCGCTCTTACCAGCACATCATGAAGTGGGTCAGTGACGTGGATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGTAGGAGATGCCACCTCACTGCCGGGGTGTGGAGAGGGTGCCTCACCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121003 GGTAGGAGATGCCACCTCACTGCCGGGGTGTGGAGAGGGTGCCTCACCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGAAGGCAAGGCGAGGGCCAGATGGGAAGGCAAATGCTTCCAGGAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121053 GGAAGGCAAGGCGAGGGCCAGATGGGAAGGCAAATGCTTCCAGGAAGCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGCCTTCCACAGCCCTGGATGAAGACCTCTGG         TACGCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 121103 TGCCTTCCACAGCCCTGGATGAAGACCTCTGGGTG...TAGTACGCACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GAAGGCGTCCAGAAGATCCTTATTGGGAATAAGGCTGATGAGGAGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121672 GAAGGCGTCCAGAAGATCCTTATTGGGAATAAGGCTGATGAGGAGCAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACGGCAGGTGGGAAGAGAGCAAGGGCAGCAG         CTGGCGAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 121722 ACGGCAGGTGGGAAGAGAGCAAGGGCAGCAGGTA...CAGCTGGCGAAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AGTATGGCATGGACTTCTATGAAACAAGTGCCTGCACCAACCTCAACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123354 AGTATGGCATGGACTTCTATGAAACAAGTGCCTGCACCAACCTCAACATT

    650     .
    606 AAAGAG
        ||||||
 123404 AAAGAG