seq1 = pF1KE3981.tfa, 771 bp
seq2 = pF1KE3981/gi568815580r_26355746.tfa (gi568815580r:26355746_26601235), 245490 bp

>pF1KE3981 771
>gi568815580r:26355746_26601235 (Chr18)

(complement)

1-164  (100001-100164)   99% ->
165-309  (124577-124721)   100% ->
310-615  (141311-141616)   100% ->
616-771  (145335-145490)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCAAGACCTCTGATCACTAGATCCCCTGCATCTCCACTGAACAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCAAGACCTCTGATCACTAGATCCCCTGCATCTCCACTGAACAACCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGCATCCCTACTCCAGCACAACTCACAAAATCCAATGCACCTGTCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 100051 AGGCATCCCTACTCCAGCACAACTCACAAAATCCAATGCGCCTGTCCACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGATGTGGGCGGCCACATGTACACCAGCAGCCTGGCCACCCTCACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGATGTGGGCGGCCACATGTACACCAGCAGCCTGGCCACCCTCACCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TACCCTGAATCCAG         AATCGGAAGACTTTTTGATGGTACAGA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100151 TACCCTGAATCCAGGTA...CAGAATCGGAAGACTTTTTGATGGTACAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCCATTGTTTTGGACAGTCTCAAACAGCACTATTTCATTGACAGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124604 GCCCATTGTTTTGGACAGTCTCAAACAGCACTATTTCATTGACAGAGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GACAGATGTTCAGATATATCTTGAATTTTCTACGAACATCCAAACTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124654 GACAGATGTTCAGATATATCTTGAATTTTCTACGAACATCCAAACTCCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATTCCTGATGATTTCAAG         GACTACACTTTGTTATATGAAGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 124704 ATTCCTGATGATTTCAAGGTG...CAGGACTACACTTTGTTATATGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGCAAAATATTTTCAGCTTCAGCCCATGTTGTTGGAGATGGAAAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141334 GGCAAAATATTTTCAGCTTCAGCCCATGTTGTTGGAGATGGAAAGATGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCAGGACAGAGAAACTGGTCGATTTTCAAGGCCCTGTGAGTGCCTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141384 AGCAGGACAGAGAAACTGGTCGATTTTCAAGGCCCTGTGAGTGCCTCGTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTGCGTGTGGCCCCAGACCTCGGAGAAAGGATCACGCTAAGCGGTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141434 GTGCGTGTGGCCCCAGACCTCGGAGAAAGGATCACGCTAAGCGGTGACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATCCTTGATAGAAGAAGTATTTCCAGAGATCGGCGACGTGATGTGTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141484 ATCCTTGATAGAAGAAGTATTTCCAGAGATCGGCGACGTGATGTGTAACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTGTCAATGCAGGCTGGAATCACGACTCGACGCACGTCATCAGGTTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141534 CTGTCAATGCAGGCTGGAATCACGACTCGACGCACGTCATCAGGTTTCCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTAAATGGCTACTGTCACCTCAACTCAGTCCAG         GTCCTCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 141584 CTAAATGGCTACTGTCACCTCAACTCAGTCCAGGTA...CAGGTCCTCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAGGTTGCAGCAAAGAGGATTTGAAATCGTGGGCTCCTGTGGGGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145343 GAGGTTGCAGCAAAGAGGATTTGAAATCGTGGGCTCCTGTGGGGGAGGAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TAGACTCGTCCCAGTTCAGCGAATACGTCCTTCGGCGGGAACTGAGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145393 TAGACTCGTCCCAGTTCAGCGAATACGTCCTTCGGCGGGAACTGAGGCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    724 ACGCCCCGTGTACCCTCCGTCATCCGGATAAAGCAAGAGCCTCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145443 ACGCCCCGTGTACCCTCCGTCATCCGGATAAAGCAAGAGCCTCTGGAC