seq1 = pF1KE3973.tfa, 1302 bp
seq2 = pF1KE3973/gi568815580r_73973464.tfa (gi568815580r:73973464_74235865), 262402 bp

>pF1KE3973 1302
>gi568815580r:73973464_74235865 (Chr18)

(complement)

1-104  (100001-100104)   100% ->
105-347  (105208-105450)   100% ->
348-557  (106252-106461)   100% ->
558-684  (109765-109891)   100% ->
685-767  (111295-111377)   100% ->
768-910  (112356-112498)   100% ->
911-1035  (153815-153939)   100% ->
1036-1302  (162136-162402)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTTCAGAAATCTTGCTGAAGATATTTTCCTACTTGGATGCTGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTTCAGAAATCTTGCTGAAGATATTTTCCTACTTGGATGCTGTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTCTGTGTACTGGATGTGTGAGCAGGCGCTTTTATCATCTAGCCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTTCTGTGTACTGGATGTGTGAGCAGGCGCTTTTATCATCTAGCCAATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAA         TTTTATTTGGATCGGAATCTACTCAACTGCTTTTTCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAAGTA...CAGTTTTATTTGGATCGGAATCTACTCAACTGCTTTTTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTGCAAGATCAAATTGGAAATTTAATTCAGTAGAGAAGATAGCTATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105245 CCTGCAAGATCAAATTGGAAATTTAATTCAGTAGAGAAGATAGCTATGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TATGAGCTTTCTGTCAGTTCAGGATAAAGAAGCTGGTTATTGGAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105295 TATGAGCTTTCTGTCAGTTCAGGATAAAGAAGCTGGTTATTGGAAGAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AATATATCACAAAACAAATAGCATCTGTAAAAGCCGCACTAGCTGACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105345 AATATATCACAAAACAAATAGCATCTGTAAAAGCCGCACTAGCTGACATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTCAAACCTGTCAACCCTTACACAGGCCTTCCAGTTAAGACCAAAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105395 CTCAAACCTGTCAACCCTTACACAGGCCTTCCAGTTAAGACCAAAGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CCTCAG         AATATTTGGTTTAGGTTGGGCAATTATACTGAAAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105445 CCTCAGGTA...CAGAATATTTGGTTTAGGTTGGGCAATTATACTGAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAAAAGGTGGAAAAGAATATATCATGGAGCATGTTGATCTTTCCATAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106287 AAAAAGGTGGAAAAGAATATATCATGGAGCATGTTGATCTTTCCATAAAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACACATCAGTTACTGTTATATGGTATGGCAAAAAATGGCCATGCCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106337 GACACATCAGTTACTGTTATATGGTATGGCAAAAAATGGCCATGCCTAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ATCATTGTCAACCTTAGATTTATGTGGCATGACACCAGTTTTTACCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106387 ATCATTGTCAACCTTAGATTTATGTGGCATGACACCAGTTTTTACCGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GGTATAAAACTCCCACCAAACATAG         ACTCCGATGGCATTCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 106437 GGTATAAAACTCCCACCAAACATAGGTA...AAGACTCCGATGGCATTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTAATTGCAAAGTACAATCTGAGTCATTTGACCATATCTACCATGATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109781 TTAATTGCAAAGTACAATCTGAGTCATTTGACCATATCTACCATGATTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTGTGACAGACTCATTCGGATCTTCTGCCTGCACCCTGGCCTCCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109831 CTGTGACAGACTCATTCGGATCTTCTGCCTGCACCCTGGCCTCCTGGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GAGTGTGGAAG         AAGGAGGAAGAACTGGCTTTTGTTATGGCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 109881 GAGTGTGGAAGGTA...CAGAAGGAGGAAGAACTGGCTTTTGTTATGGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AATCTTCATTTTCATCACCTTGTGGAGAGGAGCACATTAGGCTCGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111325 AATCTTCATTTTCATCACCTTGTGGAGAGGAGCACATTAGGCTCGGCTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TAT         CCCCTATGAACTGCCTCCACATAGCCCCTTTTTGGATG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111375 TATGTA...CAGCCCCTATGAACTGCCTCCACATAGCCCCTTTTTGGATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATAGCCCCGAGTATGGACTGCACGGCTACCAACTCCATGTTGATCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112394 ATAGCCCCGAGTATGGACTGCACGGCTACCAACTCCATGTTGATCTGCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 AGCGGTGGGGTTTTCTACCTATGTGGTACATTTCGCAATCTCTTCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112444 AGCGGTGGGGTTTTCTACCTATGTGGTACATTTCGCAATCTCTTCACCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAGAG         GAAATATTGAAAATGGACATGTGAAGCTCATTGTTA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112494 GAGAGGTG...CAGGAAATATTGAAAATGGACATGTGAAGCTCATTGTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TACATTTAAAAAATAACAGAGAACACCTACCTCTTATTGGAAAAGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153851 TACATTTAAAAAATAACAGAGAACACCTACCTCTTATTGGAAAAGTTGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTCTCGTGGAAAACTGATATTTTTGATGGCTGTATAAAG         AG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 153901 CTCTCGTGGAAAACTGATATTTTTGATGGCTGTATAAAGGTA...CAGAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TTGTTCCATGATGGACGTAACTCTTTTGGATGAACATGGGAAACCCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162138 TTGTTCCATGATGGACGTAACTCTTTTGGATGAACATGGGAAACCCTTTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GGTGTTTCAGTTCCCCGGTGTGCCTGAGATCGCCTGCCACACCCTCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162188 GGTGTTTCAGTTCCCCGGTGTGCCTGAGATCGCCTGCCACACCCTCTGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AGCTCTAGCTTCTTGGGACAGACATACAACGTGGACTACGTTGATGCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162238 AGCTCTAGCTTCTTGGGACAGACATACAACGTGGACTACGTTGATGCGGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGGAAGAGTGCACGTGGAGCTGGTGTGGATCAGAGAGACCGAAGAATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162288 AGGAAGAGTGCACGTGGAGCTGGTGTGGATCAGAGAGACCGAAGAATACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TTATTGTCAACCTGGTCCTTTATCTTAGTATCGCAAAAATCAACCATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 162338 TTATTGTCAACCTGGTCCTTTATCTTAGTATCGCAAAAATCAACCATTGG

   1350     .    :    .
   1288 TTTGGGACTGAATAT
        |||||||||||||||
 162388 TTTGGGACTGAATAT