seq1 = pF1KE3955.tfa, 2265 bp
seq2 = pF1KE3955/gi568815591f_100987313.tfa (gi568815591f:100987313_101189577), 202265 bp

>pF1KE3955 2265
>gi568815591f:100987313_101189577 (Chr7)

1-2265  (100001-102265)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTTCCCACGGGTCCTCGCCCTCCCTCCTGGAGGCCCTGAGCAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTTCCCACGGGTCCTCGCCCTCCCTCCTGGAGGCCCTGAGCAGCGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCTGGCCTGTAAAATCTGCCTGGAGCAGCTGCGGGCACCCAAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCTGGCCTGTAAAATCTGCCTGGAGCAGCTGCGGGCACCCAAGACAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGCCCTGCCTGCATACCTACTGCCAAGACTGCCTGGCACAGCTGGCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGCCCTGCCTGCATACCTACTGCCAAGACTGCCTGGCACAGCTGGCGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGGCCGCGTCCGCTGCCCCGAGTGCCGCGAGACAGTGCCTGTGCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCGGCCGCGTCCGCTGCCCCGAGTGCCGCGAGACAGTGCCTGTGCCGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGAGGGTGTGGCCTCCTTCAAGACCAACTTCTTCGTCAATGGGCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGAGGGTGTGGCCTCCTTCAAGACCAACTTCTTCGTCAATGGGCTGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTGGTGAAGGCCCGGGCCTGTGGAGACCTGCGTGCCGGGAAGCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTGGTGAAGGCCCGGGCCTGTGGAGACCTGCGTGCCGGGAAGCCAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGTGCCCTGTGTCCCCTGGTGGGTGGCACCAGCACCGGGGGGCCGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TGTGCCCTGTGTCCCCTGGTGGGTGGCACCAGCACCGGGGGGCCGGCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCCGGTGCCTGGACTGTGCCGATGACTTGTGCCAGGCCTGTGCCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCCGGTGCCTGGACTGTGCCGATGACTTGTGCCAGGCCTGTGCCGACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGCACCGCTGCACCCGCCAGACCCACACCCACCGCGTGGTGGACCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGCACCGCTGCACCCGCCAGACCCACACCCACCGCGTGGTGGACCTGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCTACAGGGCCGGGTGGTATGATGAGGAGGCCCGGGAGCGCCAAGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGCTACAGGGCCGGGTGGTATGATGAGGAGGCCCGGGAGCGCCAAGCGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCAGTGTCCCCAGCACCCCGGGGAGGCACTGCGCTTCCTGTGCCAGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCAGTGTCCCCAGCACCCCGGGGAGGCACTGCGCTTCCTGTGCCAGCCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTCACAGTTGCTGTGCAGAGAGTGCCGCCTAGACCCCCACCTGGACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTCACAGTTGCTGTGCAGAGAGTGCCGCCTAGACCCCCACCTGGACCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCCTGCCTGCCTCTGGCTGAAGCTGTGCGTGCCCGGAGGCCGGGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCCTGCCTGCCTCTGGCTGAAGCTGTGCGTGCCCGGAGGCCGGGCCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGGACTGCTGGCCGGTGTGGACAATAACCTGGTGGAGCTGGAGGCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGGACTGCTGGCCGGTGTGGACAATAACCTGGTGGAGCTGGAGGCAGCGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAGGGTGGAGAAGGAGGCGCTAGCCCGGCTGCGGGAGCAGGCGGCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAGGGTGGAGAAGGAGGCGCTAGCCCGGCTGCGGGAGCAGGCGGCCCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTGGGGACTCAGGTGGAGGAGGCGGCTGAGGGCGTCCTCCGGGCCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTGGGGACTCAGGTGGAGGAGGCGGCTGAGGGCGTCCTCCGGGCCCTGCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCCCAGAAGCAGGAGGTGCTGGGGCAGCTACGAGCCCACGTGGAGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCCCAGAAGCAGGAGGTGCTGGGGCAGCTACGAGCCCACGTGGAGGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGAAGAAGCTGCTCGGGAGAGGCTGGCGGAGCTTGAGGGCCGGGAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCGAAGAAGCTGCTCGGGAGAGGCTGGCGGAGCTTGAGGGCCGGGAGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTGGCCAGGGCGGCAGCCGCCTTCGCCCGCCGGGTACTCAGCCTGGGGCG
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTGGCCAGGGCCGCAGCCGCCTTCGCCCGCCGGGTACTCAGCCTGGGGCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGAGGCCGAGATCCTCTCCCTGGAAGGGGCTATCGCACAGCGGCTCAGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100951 AGAGGCCGAGATCCTCTCCCTGGAAGGGGCGATCGCACAGCGGCTCAGGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGCTGCAGGGCTGCCCCTGGGCACCAGGCCCGGCCCCCTGCCTGCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGCTGCAGGGCTGCCCCTGGGCACCAGGCCCGGCCCCCTGCCTGCTCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAGCTGGAGCTCCATCCTGGGCTCCTGGACAAGAACTGCCACCTTCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAGCTGGAGCTCCATCCTGGGCTCCTGGACAAGAACTGCCACCTTCTTCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GCTGTCCTTTGAGGAGCAGCAGCCCCAGAAGGATGGTGGGAAAGACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GCTGTCCTTTGAGGAGCAGCAGCCCCAGAAGGATGGTGGGAAAGACGGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 CTGGTACCCAGGGAGGTGAGGAGAGCCAGAGCCGGAGGGAGGATGAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTGGTACCCAGGGAGGTGAGGAGAGCCAGAGCCGGAGGGAGGATGAGCCG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AAGACTGAGAGACAGGGTGGAGTCCAGCCCCAGGCCGGAGATGGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 101201 AAGACTGAGAGACAGGGTGGAGTCCAGCCCCAGGCTGGAGATGGAGCCCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GACCCCAAAAGAGGAAAAAGCCCAGACAACCCGAGAAGAGGGAGCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GACCCCAAAAGAGGAAAAAGCCCAGACAACCCGAGAAGAGGGAGCCCAGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 CCTTGGAGGAGGACAGGGCCCAGACACCCCACGAGGATGGAGGACCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 CCTTGGAGGAGGACAGGGCCCAGACACCCCACGAGGATGGAGGACCCCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CCCCACAGGGGTGGCAGACCCAACAAGAAGAAAAAGTTCAAAGGCAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101351 CCCCACAGGGGTGGCAGACCCAACAAGAAGAAAAAGTTCAAAGGCAGGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CAAGTCAATTTCCCGGGAGCCCAGCCCAGCCCTGGGGCCGAATCTGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101401 CAAGTCAATTTCCCGGGAGCCCAGCCCAGCCCTGGGGCCGAATCTGGACG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1451 GCTCTGGCCTCCTCCCCAGACCCATCTTTTACTGCAGTTTCCCCACGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101451 GCTCTGGCCTCCTCCCCAGACCCATCTTTTACTGCAGTTTCCCCACGCGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1501 ATGCCTGGAGACAAGCGGTCCCCCCGGATCACCGGGCTCTGTCCCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101501 ATGCCTGGAGACAAGCGGTCCCCCCGGATCACCGGGCTCTGTCCCTTCGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1551 TCCCCGGGAGATCCTGGTGGCGGATGAGCAGAACCGGGCACTGAAACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101551 TCCCCGGGAGATCCTGGTGGCGGATGAGCAGAACCGGGCACTGAAACGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1601 TCTCCCTCAACGGCGACTACAAGGGCACCGTGCCGGTCCCTGAGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101601 TCTCCCTCAACGGCGACTACAAGGGCACCGTGCCGGTCCCTGAGGGCTGC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1651 TCCCCTTGCAGCGTGGCCGCCCTGCAGAGCGCGGTGGCCTTCTCCGCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101651 TCCCCTTGCAGCGTGGCCGCCCTGCAGAGCGCGGTGGCCTTCTCCGCTAG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1701 CGCACGGCTCTATCTCATCAACCCCAACGGCGAAGTGCAGTGGCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101701 CGCACGGCTCTATCTCATCAACCCCAACGGCGAAGTGCAGTGGCGCAGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1751 CCCTGAGCCTCTCCCAGGCCAGCCACGCGGTGGCGGCACTGCCTAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101751 CCCTGAGCCTCTCCCAGGCCAGCCACGCGGTGGCGGCACTGCCTAGCGGG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1801 GACCGCGTGGCTGTCAGCGTGGCGGGCCACGTGGAGGTGTACAATATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101801 GACCGCGTGGCTGTCAGCGTGGCGGGCCACGTGGAGGTGTACAATATGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1851 AGGCAGCCTGGCCACCCGGTTCATTCCTGGAGGCAAGGCCAGCCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101851 AGGCAGCCTGGCCACCCGGTTCATTCCTGGAGGCAAGGCCAGCCGGGGCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1901 TGCGGGCGCTGGTGTTTCTGACCACCAGCCCCCAGGGGCATTTCGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101901 TGCGGGCGCTGGTGTTTCTGACCACCAGCCCCCAGGGGCATTTCGTGGGG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1951 TCGGACTGGCAGCAGAATAGTGTGGTAATCTGTGATGGGCTGGGCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101951 TCGGACTGGCAGCAGAATAGTGTGGTAATCTGTGATGGGCTGGGCCAGGT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2001 GGTTGGGGAGTACAAGGGGCCAGGCCTGCATGGCTGCCAGCCGGGCTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102001 GGTTGGGGAGTACAAGGGGCCAGGCCTGCATGGCTGCCAGCCGGGCTCCG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2051 TGTCTGTGGATAAGAAGGGCTACATCTTTCTGACCCTTCGAGAAGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102051 TGTCTGTGGATAAGAAGGGCTACATCTTTCTGACCCTTCGAGAAGTCAAC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101 AAGGTGGTGATCCTGGACCCGAAGGGGTCCCTCCTTGGAGACTTCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102101 AAGGTGGTGATCCTGGACCCGAAGGGGTCCCTCCTTGGAGACTTCCTGAC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2151 AGCCTACCACGGCCTGGAAAAGCCCCGGGTTACCACCATGGTGGATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102151 AGCCTACCACGGCCTGGAAAAGCCCCGGGTTACCACCATGGTGGATGGCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2201 GGTACCTGGTCGTGTCCCTCAGTAACGGGACCATCCACATCTTTCGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102201 GGTACCTGGTCGTGTCCCTCAGTAACGGGACCATCCACATCTTTCGGGTC

   2250     .    :    .
   2251 CGTTCTCCGGACAGT
        |||||||||||||||
 102251 CGTTCTCCGGACAGT