seq1 = pF1KE3940.tfa, 444 bp
seq2 = pF1KE3940/gi568815591f_141642167.tfa (gi568815591f:141642167_141850351), 208185 bp

>pF1KE3940 444
>gi568815591f:141642167_141850351 (Chr7)

1-24  (97001-97024)   100% ->
25-85  (100003-100063)   100% ->
86-226  (101395-101535)   100% ->
227-314  (101736-101823)   100% ->
315-403  (103330-103418)   100% ->
404-444  (108145-108185)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTCGAAGACCTGTATTACAG         GTACTTCGTCAGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  97001 ATGTTTCGAAGACCTGTATTACAGGTA...TAGGTACTTCGTCAGTTTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AAGACATGAGTCCGAAACAACTACCAGTTTGGTTCTTGAAAGAT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100020 AAGACATGAGTCCGAAACAACTACCAGTTTGGTTCTTGAAAGATGTA...

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     86    CCCTGAATCGTGTGCACTTACTTGGGCGAGTGGGTCAGGACCCTGTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101392 CAGCCCTGAATCGTGTGCACTTACTTGGGCGAGTGGGTCAGGACCCTGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTGAGACAGGTGGAAGGAAAAAATCCAGTCACAATATTTTCTCTAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101442 TTGAGACAGGTGGAAGGAAAAAATCCAGTCACAATATTTTCTCTAGCAAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TAATGAGATGTGGCGATCAGGGGATAGTGAAGTTTACCAACTGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101492 TAATGAGATGTGGCGATCAGGGGATAGTGAAGTTTACCAACTGGGTG...

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    227    GTGATGTCAGTCAAAAGACAACATGGCACAGAATATCAGTATTCCGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101733 TAGGTGATGTCAGTCAAAAGACAACATGGCACAGAATATCAGTATTCCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CCAGGCCTCAGAGACGTGGCATATCAATATGTGAAAAAGGG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101783 CCAGGCCTCAGAGACGTGGCATATCAATATGTGAAAAAGGGGTA...CAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GTCTCGAATTTATTTGGAAGGGAAAATAGACTATGGTGAATACATGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103330 GTCTCGAATTTATTTGGAAGGGAAAATAGACTATGGTGAATACATGGATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAAATAATGTGAGGCGACAAGCAACAACAATCATAGCTG         AT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 103380 AAAATAATGTGAGGCGACAAGCAACAACAATCATAGCTGGTA...CAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .
    406 AATATTATATTTCTGAGTGACCAGACGAAAGAGAAGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108147 AATATTATATTTCTGAGTGACCAGACGAAAGAGAAGGAG