seq1 = pF1KE3937.tfa, 597 bp
seq2 = pF1KE3937/gi568815586r_15009113.tfa (gi568815586r:15009113_15317489), 308377 bp

>pF1KE3937 597
>gi568815586r:15009113_15317489 (Chr12)

(complement)

1-61  (100001-100061)   100% ->
62-118  (196371-196427)   100% ->
119-192  (206073-206146)   100% ->
193-597  (207973-208377)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTAAAAGTGCGGAGGTCAAACTGGCAATATTTGGGAGAGCAGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTAAAAGTGCGGAGGTCAAACTGGCAATATTTGGGAGAGCAGGCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCAAGTCAG         CTCTTGTAGTGAGATTTCTGACCAAACGGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCAAGTCAGGTA...CAGCTCTTGTAGTGAGATTTCTGACCAAACGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCATCTGGGAATATGATCCCACCCTCG         AATCAACCTACCGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 196401 TCATCTGGGAATATGATCCCACCCTCGGTA...TAGAATCAACCTACCGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CACCAAGCAACCATCGATGATGAAGTTGTTTCCATGGAGATACTAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206087 CACCAAGCAACCATCGATGATGAAGTTGTTTCCATGGAGATACTAGACAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGCTGGTCAG         GAAGATACCATTCAGAGGGAGGGGCACATGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 206137 TGCTGGTCAGGTG...CAGGAAGATACCATTCAGAGGGAGGGGCACATGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GATGGGGGGAAGGCTTTGTGCTGGTCTACGACATTACTGACCGAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208004 GATGGGGGGAAGGCTTTGTGCTGGTCTACGACATTACTGACCGAGGAAGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TTTGAGGAAGTGCTGCCACTTAAGAACATCCTAGATGAGATCAAAAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208054 TTTGAGGAAGTGCTGCCACTTAAGAACATCCTAGATGAGATCAAAAAGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAAGAATGTGACTCTCATCTTGGTTGGAAACAAAGCTGACTTGGACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208104 CAAGAATGTGACTCTCATCTTGGTTGGAAACAAAGCTGACTTGGACCACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCAGGCAGGTTAGCACAGAAGAAGGAGAGAAGCTGGCCACAGAATTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208154 CCAGGCAGGTTAGCACAGAAGAAGGAGAGAAGCTGGCCACAGAATTGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGTGCTTTTTACGAGTGCTCTGCCTGCACTGGAGAAGGGAACATCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208204 TGTGCTTTTTACGAGTGCTCTGCCTGCACTGGAGAAGGGAACATCACAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATATTCTATGAATTGTGTCGAGAGGTGCGTCGCCGGAGGATGGTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208254 GATATTCTATGAATTGTGTCGAGAGGTGCGTCGCCGGAGGATGGTGCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCAAGACGAGGCGACGCAGCTCCACCACGCATGTCAAGCAAGCCATTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208304 GCAAGACGAGGCGACGCAGCTCCACCACGCATGTCAAGCAAGCCATTAAC

    600     .    :    .    :
    574 AAGATGCTCACCAAAATCAGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||
 208354 AAGATGCTCACCAAAATCAGTAGT