seq1 = pF1KE3927.tfa, 1305 bp
seq2 = pF1KE3927/gi568815591r_104026851.tfa (gi568815591r:104026851_104307904), 281054 bp

>pF1KE3927 1305
>gi568815591r:104026851_104307904 (Chr7)

(complement)

1-72  (100001-100072)   100% ->
73-165  (103671-103763)   100% ->
166-366  (106947-107147)   99% ->
367-441  (110106-110180)   100% ->
442-553  (112651-112762)   100% ->
554-684  (119524-119654)   100% ->
685-733  (123734-123782)   100% ->
734-824  (123872-123962)   100% ->
825-877  (139380-139432)   100% ->
878-990  (141021-141133)   100% ->
991-1038  (142623-142670)   100% ->
1039-1149  (146723-146833)   100% ->
1150-1262  (171012-171124)   100% ->
1263-1305  (181012-181054)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCACTTGGAAAACGTGGTGCTTTGTCGCGAGTCTCAAGTGTCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCACTTGGAAAACGTGGTGCTTTGTCGCGAGTCTCAAGTGTCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGCAGTCCTTGTTTGGAGAG         AGACATCATTTCAGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 100051 CTTGCAGTCCTTGTTTGGAGAGGTA...TAGAGACATCATTTCAGCTTTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CATCCATTTTTATTTATGGACATACTGCTAGTGGAAAGACCTATGTAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103690 CATCCATTTTTATTTATGGACATACTGCTAGTGGAAAGACCTATGTAACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CAAACGTTGTTGAAAACTTTAGAG         CTCCCACATGTGTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103740 CAAACGTTGTTGAAAACTTTAGAGGTA...CAGCTCCCACATGTGTTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GAATTGTGTTGAATGCTTTACATTGAGGCTGCTTTTGGAACAAATTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106964 GAATTGTGTTGAATGCTTTACATTGAGGCTGCTTTTGGAACAAATTTTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAAATTGAATCATCTTAGTTCTTCAGAGGATGGATGTTCTACTGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107014 ACAAATTGAATCATCTTAGTTCTTCAGAGGATGGATGTTCTACTGAAATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACCTGTGAAACATTTAATGACTTTGTTCGCTTGTTCAAACAAGTAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 107064 ACCTGTGAAACATTTAATGACTTTGTTCGCTTGTTTAAACAAGTAACCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCTGAAAATCTTAAAGATCAGACTGTATATATT         GTTCTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107114 AGCTGAAAATCTTAAAGATCAGACTGTATATATTGTA...AAGGTTCTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAAAGCAGAGTATCTAAGAGATATGGAAGCAAATCTTTTGCCTGGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110113 ATAAAGCAGAGTATCTAAGAGATATGGAAGCAAATCTTTTGCCTGGATTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CTTAGATTACAAGAATTG         GCTGACAGAAATGTGACTGTTCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 110163 CTTAGATTACAAGAATTGGTA...CAGGCTGACAGAAATGTGACTGTTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CTTTCTCAGTGAAATTGTTTGGGAAAAGTTTCGTCCAAATACTGGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112674 CTTTCTCAGTGAAATTGTTTGGGAAAAGTTTCGTCCAAATACTGGATGCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTGAGCCGTTTGTCTTATATTTCCCTGATTACAGCATAG         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 112724 TTGAGCCGTTTGTCTTATATTTCCCTGATTACAGCATAGGTA...CAGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AACCTTCAAAAGATCCTGTCCCATGATCATCCTCCAGAGTATTCAGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119526 AACCTTCAAAAGATCCTGTCCCATGATCATCCTCCAGAGTATTCAGCTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTTCTATGCTGCCTACATTAACATTCTTCTTGGAGTTTTCTACACTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119576 TTTCTATGCTGCCTACATTAACATTCTTCTTGGAGTTTTCTACACTGTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GTCGAGATTTGAAAGAGCTCAGACATCTG         GCAGTACTTAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 119626 GTCGAGATTTGAAAGAGCTCAGACATCTGGTA...CAGGCAGTACTTAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TTTCCTAAATATTGTGAACCCGTGGTTAAAGGAGAAG         CAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 123746 TTTCCTAAATATTGTGAACCCGTGGTTAAAGGAGAAGGTA...TAGCAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGAACGTGATACTCGCAAACTGTGGAGAAATATTGAACCTCATTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123876 TGAACGTGATACTCGCAAACTGTGGAGAAATATTGAACCTCATTTGAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AAGCTATGCAGACTGTTTATCTCAGGGAAATATCAAG         TTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 123926 AAGCTATGCAGACTGTTTATCTCAGGGAAATATCAAGGTA...CAGTTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 CAGTGGGAAAAGCTACAGAAAGATGACACAGATCCGGGGCAACTGAAAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 139384 CAGTGGGAAAAGCTACAGAAAGATGACACAGATCCGGGGCAACTGAAAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    878         GCCTCTCAGCGCATACTCATGTGGAACTTCCATATTACTCTA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139434 TA...TAGGCCTCTCAGCGCATACTCATGTGGAACTTCCATATTACTCTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 AGTTCATTCTAATTGCTGCATACCTTGCTTCATACAATCCAGCAAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141063 AGTTCATTCTAATTGCTGCATACCTTGCTTCATACAATCCAGCAAGAACT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GACAAGAGGTTTTTTCTTAAG         CATCATGGAAAAATCAAGAA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 141113 GACAAGAGGTTTTTTCTTAAGGTA...CAGCATCATGGAAAAATCAAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 AACCAACTTTCTAAAAAAACACGAAAAG         ACAAGCAATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 142643 AACCAACTTTCTAAAAAAACACGAAAAGGTA...CAGACAAGCAATCATC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1052 TCCTTGGGCCAAAACCATTTCCACTAGACAGATTATTAGCAATATTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146736 TCCTTGGGCCAAAACCATTTCCACTAGACAGATTATTAGCAATATTATAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1102 AGTATCGTGGACAGCAGAGTTGCTCCAACAGCAAATATTTTTTCCCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 146786 AGTATCGTGGACAGCAGAGTTGCTCCAACAGCAAATATTTTTTCCCAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1150        ATTACCTCTCTAGTGACCCTTCAGCTGTTAACCCTGGTTGGCC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146836 A...TAGATTACCTCTCTAGTGACCCTTCAGCTGTTAACCCTGGTTGGCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 ATGACGATCAGCTTGATGGACCAAAATACAAATGCACAGTGTCTCTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171055 ATGACGATCAGCTTGATGGACCAAAATACAAATGCACAGTGTCTCTAGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 TTCATCAGAGCTATTGCAAG         GACGGTGAACTTTGACATAAT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 171105 TTCATCAGAGCTATTGCAAGGTA...TAGGACGGTGAACTTTGACATAAT

   1400     .    :    .    :
   1284 AAAATACTTGTATGATTTCTTG
        ||||||||||||||||||||||
 181033 AAAATACTTGTATGATTTCTTG