seq1 = pF1KE3926.tfa, 1653 bp
seq2 = pF1KE3926/gi568815588f_102544618.tfa (gi568815588f:102544618_102757351), 212734 bp

>pF1KE3926 1653
>gi568815588f:102544618_102757351 (Chr10)

1-570  (100001-100570)   100% ->
571-666  (110036-110131)   100% ->
667-900  (110463-110696)   100% ->
901-932  (111489-111520)   100% ->
933-1048  (111653-111768)   100% ->
1049-1653  (112130-112734)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGAATTGGAAGAACTGCTTCGAGGAGGAGCTCATCTGCCCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGAATTGGAAGAACTGCTTCGAGGAGGAGCTCATCTGCCCTAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCCTGCACGTTTTCGTGGAGCCAGTGCAGCTGCCGTGCAAACACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCCTGCACGTTTTCGTGGAGCCAGTGCAGCTGCCGTGCAAACACAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTGCCGGGGCTGCATCGGCGAGGCGTGGGCCAAGGACAGCGGCCTCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTGCCGGGGCTGCATCGGCGAGGCGTGGGCCAAGGACAGCGGCCTCGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGCTGCCCAGAGTGCAACCAGGCCTACAACCAGAAGCCGGGCCTGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGCTGCCCAGAGTGCAACCAGGCCTACAACCAGAAGCCGGGCCTGGAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAACCTGAAGCTCACCAACATCGTGGAGAAGTTCAATGCCCTGCACGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAACCTGAAGCTCACCAACATCGTGGAGAAGTTCAATGCCCTGCACGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGAAGCCGCCGGCGGCGCTGCACTGCGTGTTCTGCCGCCGCGGCCCCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGAAGCCGCCGGCGGCGCTGCACTGCGTGTTCTGCCGCCGCGGCCCCCCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCCCGCGCAGAAGGTCTGCCTGCGCTGCGAGGCGCCCTGCTGCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGCCCGCGCAGAAGGTCTGCCTGCGCTGCGAGGCGCCCTGCTGCCAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCACGTGCAGACGCACCTGCAGCAGCCCTCCACCGCCCGCGGGCACCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCACGTGCAGACGCACCTGCAGCAGCCCTCCACCGCCCGCGGGCACCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGTGGAGGCGGACGACGTGCGGGCCTGGAGCTGCCCGCAGCACAACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGTGGAGGCGGACGACGTGCGGGCCTGGAGCTGCCCGCAGCACAACGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TACCGCCTCTACCACTGCGAGGCCGAGCAGGTGGCCGTGTGCCAGTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TACCGCCTCTACCACTGCGAGGCCGAGCAGGTGGCCGTGTGCCAGTACTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCTACTACAGCGGCGCGCATCAGGGACACTCGGTGTGCGACGTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGCTACTACAGCGGCGCGCATCAGGGACACTCGGTGTGCGACGTGGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCGAAGGAATGAAATCCGG         AAGATGCTCATGAAGCAGCAG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100551 TCCGAAGGAATGAAATCCGGGCA...CAGAAGATGCTCATGAAGCAGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GACCGGCTGGAGGAGCGAGAGCAGGACATTGAGGACCAGCTGTACAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110057 GACCGGCTGGAGGAGCGAGAGCAGGACATTGAGGACCAGCTGTACAAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CGAGTCAGACAAGCGCCTGGTGGAG         GAGAAAGTGAACCAAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 110107 CGAGTCAGACAAGCGCCTGGTGGAGGTA...CAGGAGAAAGTGAACCAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 TGAAGGAGGAAGTTCGGCTGCAGTACGAGAAGCTGCACCAGCTGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110479 TGAAGGAGGAAGTTCGGCTGCAGTACGAGAAGCTGCACCAGCTGCTGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GAGGACCTGCGGCAGACAGTGGAGGTCCTAGACAAGGCCCAGGCCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110529 GAGGACCTGCGGCAGACAGTGGAGGTCCTAGACAAGGCCCAGGCCAAGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CTGCAGCGAGAACGCAGCGCAGGCGCTGCACCTCGGGGAGCGCATGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110579 CTGCAGCGAGAACGCAGCGCAGGCGCTGCACCTCGGGGAGCGCATGCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AGGCCAAGAAGCTGCTGGGCTCCCTGCAGCTGCTCTTTGATAAGACGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110629 AGGCCAAGAAGCTGCTGGGCTCCCTGCAGCTGCTCTTTGATAAGACGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GATGTCAGCTTCATGAAG         AACACCAAGTCTGTGAAAATCCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 110679 GATGTCAGCTTCATGAAGGTG...CAGAACACCAAGTCTGTGAAAATCCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GATGGACAG         GACCCAGACCTGCACGAGCAGCAGCCTTTCCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111512 GATGGACAGGTA...CAGGACCCAGACCTGCACGAGCAGCAGCCTTTCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CCACTAAGATCGGCCACCTGAACTCCAAGCTCTTCCTGAACGAAGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111685 CCACTAAGATCGGCCACCTGAACTCCAAGCTCTTCCTGAACGAAGTGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 AAGAAGGAGAAGCAGCTGCGGAAAATGCTAGAAG         GCCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 111735 AAGAAGGAGAAGCAGCTGCGGAAAATGCTAGAAGGTG...CAGGCCCCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CAGCACGCCGGTGCCCTTCCTGCAGAGTGTCCCCCTGTACCCTTGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112137 CAGCACGCCGGTGCCCTTCCTGCAGAGTGTCCCCCTGTACCCTTGCGGCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 TGAGCAGCTCTGGGGCGGAAAAGCGCAAGCACTCAACGGCCTTCCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112187 TGAGCAGCTCTGGGGCGGAAAAGCGCAAGCACTCAACGGCCTTCCCAGAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GCCAGTTTCCTAGAGACGTCGTCGGGCCCTGTGGGCGGCCAGTACGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112237 GCCAGTTTCCTAGAGACGTCGTCGGGCCCTGTGGGCGGCCAGTACGGGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GGCGGGCACAGCCAGCGGTGAGGGCCAGTCTGGGCAGCCCCTGGGGCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112287 GGCGGGCACAGCCAGCGGTGAGGGCCAGTCTGGGCAGCCCCTGGGGCCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 GCAGCTCCACGCAGCACTTGGTGGCCCTGCCGGGCGGCGCCCAACCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112337 GCAGCTCCACGCAGCACTTGGTGGCCCTGCCGGGCGGCGCCCAACCAGTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CACTCAAGCCCCGTGTTCCCCCCATCGCAGTATCCCAATGGCTCCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112387 CACTCAAGCCCCGTGTTCCCCCCATCGCAGTATCCCAATGGCTCCGCCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CCAGCAGCCCATGCTCCCCCAGTATGGCGGCCGCAAGATTCTCGTCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112437 CCAGCAGCCCATGCTCCCCCAGTATGGCGGCCGCAAGATTCTCGTCTGTT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CTGTGGACAACTGTTACTGTTCTTCCGTGGCCAACCATGGCGGCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112487 CTGTGGACAACTGTTACTGTTCTTCCGTGGCCAACCATGGCGGCCACCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 CCCTACCCCCGCTCCGGCCACTTTCCCTGGACAGTGCCCTCGCAGGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112537 CCCTACCCCCGCTCCGGCCACTTTCCCTGGACAGTGCCCTCGCAGGAGTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CTCACACCCGCTCCCGCCCACACCCTCCGTCCCCCAGTCCCTTCCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112587 CTCACACCCGCTCCCGCCCACACCCTCCGTCCCCCAGTCCCTTCCCAGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1556 TGGCGGTCAGAGACTGGCTTGACGCCTCCCAGCAGCCCGGCCACCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112637 TGGCGGTCAGAGACTGGCTTGACGCCTCCCAGCAGCCCGGCCACCAGGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1606 TTCTACAGGGTGTATGGGCAGCCGTCCACCAAACACTACGTGACGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112687 TTCTACAGGGTGTATGGGCAGCCGTCCACCAAACACTACGTGACGAGC