seq1 = pF1KE3924.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KE3924/gi568815597r_2305769.tfa (gi568815597r:2305769_2512502), 206734 bp

>pF1KE3924 1038
>gi568815597r:2305769_2512502 (Chr1)

(complement)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-193  (102052-102132)   100% ->
194-600  (103645-104051)   99% ->
601-836  (105548-105783)   100% ->
837-972  (105884-106019)   100% ->
973-1038  (106669-106734)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCCCGGCCGCCGCCAGCCCCCCGGAGGTGATCCGCGCGGCGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCCCGGCCGCCGCCAGCCCCCCGGAGGTGATCCGCGCGGCGCAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACGAGTACTACCGCGGTGGGCTGCGGAGCGCGGCGGGCGGCGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACGAGTACTACCGCGGTGGGCTGCGGAGCGCGGCGGGCGGCGCCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGCCTGGCGG         GTGCGAGGAAGTGGCTGGAGTGGAGGAAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACAGCCTGGCGGGTG...CAGGTGCGAGGAAGTGGCTGGAGTGGAGGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGTTGAGCTGCTCTCAGATGTGGCCTACTTTGGCCTCACCACACTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102081 GAGGTTGAGCTGCTCTCAGATGTGGCCTACTTTGGCCTCACCACACTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AG         GCTACCAGACCCTGGGGGAGGAGTACGTCAGCATCATCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102131 AGGTA...CAGGCTACCAGACCCTGGGGGAGGAGTACGTCAGCATCATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGTGGACCCATCGCGGATACATGTGCCCTCCTCGCTGCGCCGTGGCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103684 AGGTGGACCCATCGCGGATACATGTGCCCTCCTCGCTGCGCCGTGGCGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGTGACGCTGCATGCCGTCCTGCCCTACCTGCTGGACAAGGCCCTGCT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103734 CTGGTGACACTGCATGCCGTCCTGCCCTACCTGCTGGACAAGGCCCTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCCCCTGGAGCAGGAGCTGCAGGCTGACCCCGACAGTGGGCGACCCTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103784 CCCCCTGGAGCAGGAGCTGCAGGCTGACCCCGACAGTGGGCGACCCTTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGGGAGCCTGGGGCCAGGTGGGCGTGGCTGCTCAGGGGCGCGGCGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103834 AGGGGAGCCTGGGGCCAGGTGGGCGTGGCTGCTCAGGGGCGCGGCGCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGCGTCACCACACGGCCACCCTGACTGAGCAGCAGAGGAGGGCGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103884 ATGCGTCACCACACGGCCACCCTGACTGAGCAGCAGAGGAGGGCGCTGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCGGGCGGTCTTCGTCCTCAGACAGGGCCTCGCCTGCCTCCAGCGGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103934 GCGGGCGGTCTTCGTCCTCAGACAGGGCCTCGCCTGCCTCCAGCGGCTAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATGTTGCCTGGTTTTACATCCACGGTGTCTTCTACCACCTGGCCAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103984 ATGTTGCCTGGTTTTACATCCACGGTGTCTTCTACCACCTGGCCAAGAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCACGGGGATCACGTAC         CAGGCGCTGAGGCCAGATCCCCT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 104034 CTCACGGGGATCACGTACGTA...CAGCAGGCGCTGAGGCCAGATCCCCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAGGGTCCTGATGAGTGTGGCGCCATCTGCCTTACAGCTCCGTGTCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105571 CAGGGTCCTGATGAGTGTGGCGCCATCTGCCTTACAGCTCCGTGTCCGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCCTGCCCGGAGAGGACCTGAGGGCCCGTGTTAGCTACAGGCTGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105621 GCCTGCCCGGAGAGGACCTGAGGGCCCGTGTTAGCTACAGGCTGCTGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GTCATCTCACTGCTGCACCTGGTGCTGTCCATGGGGCTGCAGCTGTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105671 GTCATCTCACTGCTGCACCTGGTGCTGTCCATGGGGCTGCAGCTGTACGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TTTCAGGCAGCGGCAGCGAGCCAGGAAGGAGTGGAGGCTGCACCGCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105721 TTTCAGGCAGCGGCAGCGAGCCAGGAAGGAGTGGAGGCTGCACCGCGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 TGTCTCACCGCAG         GGCCTCCTTGGAGGAGAGAGCCGTTTCC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 105771 TGTCTCACCGCAGGTG...CAGGGCCTCCTTGGAGGAGAGAGCCGTTTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGAAACCCCCTGTGCACCCTGTGCCTGGAGGAGCGCAGGCACCCAACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105912 AGAAACCCCCTGTGCACCCTGTGCCTGGAGGAGCGCAGGCACCCAACAGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CACGCCCTGCGGCCACCTGTTCTGCTGGGAGTGCATCACCGCGTGGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105962 CACGCCCTGCGGCCACCTGTTCTGCTGGGAGTGCATCACCGCGTGGTGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 GCAGCAAG         GCGGAGTGTCCCCTCTGCCGGGAGAAGTTCCCT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 106012 GCAGCAAGGTG...CAGGCGGAGTGTCCCCTCTGCCGGGAGAAGTTCCCT

   1050     .    :    .    :    .    :
   1006 CCCCAGAAGCTCATCTACCTTCGGCACTACCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 106702 CCCCAGAAGCTCATCTACCTTCGGCACTACCGC