seq1 = pF1KE3923.tfa, 1341 bp
seq2 = pF1KE3923/gi568815592r_152871166.tfa (gi568815592r:152871166_153082959), 211794 bp

>pF1KE3923 1341
>gi568815592r:152871166_153082959 (Chr6)

(complement)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-818  (107339-108053)   99% ->
819-909  (109824-109914)   100% ->
910-1092  (110506-110688)   100% ->
1093-1341  (111546-111794)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCGGCGCCCCTGCAGCTGCGCCCTACGGCCACCCCGCTGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCGGCGCCCCTGCAGCTGCGCCCTACGGCCACCCCGCTGCTCCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCGCCAGCCCCAGCGCAGTGACAGCCGCCGGGCGCCCTCGACCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCGCCAGCCCCAGCGCAGTGACAGCCGCCGGGCGCCCTCGACCCTCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATA         GTTGTAAAGAAGAAAGTTCTACCCTTTCTGTCAAAATG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATAGTG...TAGGTTGTAAAGAAGAAAGTTCTACCCTTTCTGTCAAAATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGTGTGATTTTAATTGTAACCATGTTCATTCCGGACTTAAACTGGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107377 AAGTGTGATTTTAATTGTAACCATGTTCATTCCGGACTTAAACTGGTAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCTGATGACATTGGAAGACTAGTTTCCTACACCCCTGCATATTTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107427 ACCTGATGACATTGGAAGACTAGTTTCCTACACCCCTGCATATTTGGAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTTCCTGTAAAGACTGCATTAAAGACTATGAAAGGCTGTCATGTATTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107477 GTTCCTGTAAAGACTGCATTAAAGACTATGAAAGGCTGTCATGTATTGGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCACCGATTGTGAGCCCTAGGATTGTAGAACTTGAAACTGAAAGCAAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 107527 TCACCGATTGTGAGCCCTAGGATTGTACAACTTGAAACTGAAAGCAAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTTGCATAACAAGGAAAATCAACATGTGCAACAGACACTTAATAGTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107577 CTTGCATAACAAGGAAAATCAACATGTGCAACAGACACTTAATAGTACAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATGAAATAGAAGCACTAGAGACCAGTAGACTTTATGAAGACAGTGGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107627 ATGAAATAGAAGCACTAGAGACCAGTAGACTTTATGAAGACAGTGGCTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCCTCATTTTCTCTACAAAGTGGCCTCAGTGAACATGAAGAAGGTAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107677 TCCTCATTTTCTCTACAAAGTGGCCTCAGTGAACATGAAGAAGGTAGCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CCTGGAGGAGAATTTCGGTGACAGTCTACAATCCTGCCTGCTACAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107727 CCTGGAGGAGAATTTCGGTGACAGTCTACAATCCTGCCTGCTACAAATAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AAAGCCCAGACCAATATCCCAACAAAAACTTGCTGCCAGTTCTTCATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107777 AAAGCCCAGACCAATATCCCAACAAAAACTTGCTGCCAGTTCTTCATTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GAAAAAGTGGTTTGTTCAACATTAAAAAAGAATGCAAAACGAAATCCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107827 GAAAAAGTGGTTTGTTCAACATTAAAAAAGAATGCAAAACGAAATCCTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AGTAGATCGGGAGATGCTGAAGGAAATTATAGCCAGAGGAAATTTTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107877 AGTAGATCGGGAGATGCTGAAGGAAATTATAGCCAGAGGAAATTTTAGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGCAGAATATAATTGGCAGAAAAATGGGCCTAGAATGTGTAGATATTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107927 TGCAGAATATAATTGGCAGAAAAATGGGCCTAGAATGTGTAGATATTCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AGCGAACTCTTTCGAAGGGGACTCAGACATGTCTTAGCAACTATTTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107977 AGCGAACTCTTTCGAAGGGGACTCAGACATGTCTTAGCAACTATTTTAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 ACAACTCAGTGACATGGACTTAATCAA         TGTGTCTAAAGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108027 ACAACTCAGTGACATGGACTTAATCAAGTA...CAGTGTGTCTAAAGTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GCACAACTTGGAAGAAGATCCTAGAAGATGATAAGGGGGCATTCCAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109838 GCACAACTTGGAAGAAGATCCTAGAAGATGATAAGGGGGCATTCCAGTTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TACAGTAAAGCAATACAAAGAGTTACC         GAAAACAACAATAA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 109888 TACAGTAAAGCAATACAAAGAGTTACCGTA...TAGGAAAACAACAATAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 ATTTTCACCTCATGCTTCAACCAGAGAATATGTTATGTTCAGAACCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110520 ATTTTCACCTCATGCTTCAACCAGAGAATATGTTATGTTCAGAACCCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TGGCTTCTGTTCAGAAATCAGCAGCCCAGACTTCTCTCAAAAAAGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110570 TGGCTTCTGTTCAGAAATCAGCAGCCCAGACTTCTCTCAAAAAAGATGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CAAACCAAGTTATCCAATCAAGGTGATCAGAAAGGTTCTACTTATAGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110620 CAAACCAAGTTATCCAATCAAGGTGATCAGAAAGGTTCTACTTATAGTCG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 ACACAATGAATTCTCTGAG         GTTGCCAAGACATTGAAAAAGA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 110670 ACACAATGAATTCTCTGAGGTA...TAGGTTGCCAAGACATTGAAAAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 ACGAAAGCCTCAAAGCCTGTATTCGCTGTAATTCACCTGCAAAATATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111568 ACGAAAGCCTCAAAGCCTGTATTCGCTGTAATTCACCTGCAAAATATGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TGCTATTTACAACGGGCAACCTGCAAACGAGAAGGCTGTGGATTTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111618 TGCTATTTACAACGGGCAACCTGCAAACGAGAAGGCTGTGGATTTGATTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TTGTACGAAGTGTCTCTGTAATTATCATACTACTAAAGACTGTTCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111668 TTGTACGAAGTGTCTCTGTAATTATCATACTACTAAAGACTGTTCAGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GCAAGCTCCTCAAAGCCAGTTGTAAAATAGGTCCCCTGCCTGGTACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111718 GCAAGCTCCTCAAAGCCAGTTGTAAAATAGGTCCCCTGCCTGGTACAAAG

   1350     .    :    .    :    .
   1315 AAAAGCAAAAAGAATTTACGAAGATTG
        |||||||||||||||||||||||||||
 111768 AAAAGCAAAAAGAATTTACGAAGATTG