seq1 = pF1KE3917.tfa, 834 bp
seq2 = pF1KE3917/gi568815579r_38842611.tfa (gi568815579r:38842611_39050319), 207709 bp

>pF1KE3917 834
>gi568815579r:38842611_39050319 (Chr19)

(complement)

1-349  (100001-100349)   99% ->
350-461  (101642-101753)   100% ->
462-557  (103753-103848)   100% ->
558-693  (105216-105351)   100% ->
694-834  (107569-107709)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGCCCGGCTATCGCGGCGACGGCTGCCGGCGGACCCGTCCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100001 ATGGGCGCCCGGCTATCGCGGCGACGGCTGCCGGCGGACCCATCCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGACGCGCTGCCCCCGGAGCTGCTGGTGCAGGTGCTGAGCCACGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGGACGCGCTGCCCCCGGAGCTGCTGGTGCAGGTGCTGAGCCACGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCACGCTCCTTGGTCACGCGATGCCGCCCAGTGTGCCGCGCCTGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCACGCTCCTTGGTCACGCGATGCCGCCCAGTGTGCCGCGCCTGGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACATAGTGGACGGGCCCACTGTGTGGCTGCTGCAGCTGGCCCGCGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACATAGTGGACGGGCCCACTGTGTGGCTGCTGCAGCTGGCCCGCGACCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCGCCGAGGGCCGCGCACTCTACGCAGTGGCTCAACGCTGCCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CAGCGCCGAGGGCCGCGCACTCTACGCAGTGGCTCAACGCTGCCTGCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAACGAAGACAAGGAGGAGTTCCCGCTGTGCGCCCTGGCGCGCTACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAACGAAGACAAGGAGGAGTTCCCGCTGTGCGCCCTGGCGCGCTACTGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGCGCGCGCCCTTCGGCCGCAATCTCATCTTCAACTCCTGCGGAGAGC 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100301 CTGCGCGCGCCCTTCGGCCGCAATCTCATCTTCAACTCCTGCGGAGAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    350         AGGGCTTCAGAGGCTGGGAGGTGGAGCATGGCGGGAACGGCT
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TG...CAGAGGGCTTCAGAGGCTGGGAGGTGGAGCATGGCGGGAACGGCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GGGCCATAGAAAAGAACCTAACACCGGTGCCTGGGGCTCCTTCGCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101684 GGGCCATAGAAAAGAACCTAACACCGGTGCCTGGGGCTCCTTCGCAGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGCTTCGTGACCTCTTTCGA         ATGGTGCTCCAAGAGGCAGCT
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101734 TGCTTCGTGACCTCTTTCGAGTG...CAGATGGTGCTCCAAGAGGCAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGTGGACCTGGTGATGGAAGGGGTGTGGCAGGAGCTGCTGGACAGCGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103774 TGTGGACCTGGTGATGGAAGGGGTGTGGCAGGAGCTGCTGGACAGCGCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGATTGAGATCTGTGTGGCTGACTG         GTGGGGCGCTCGAGAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 103824 AGATTGAGATCTGTGTGGCTGACTGGTG...CAGGTGGGGCGCTCGAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACTGCGGCTGCGTCTACCAGCTCCGGGTCCGCCTTCTGGATGTGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105232 AACTGCGGCTGCGTCTACCAGCTCCGGGTCCGCCTTCTGGATGTGTATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAAGGAAGTGGTCAAGTTCTCAGCCTCACCTGACCCGGTCCTTCAGTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105282 AAAGGAAGTGGTCAAGTTCTCAGCCTCACCTGACCCGGTCCTTCAGTGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTGAGAGGGGCTGCCGACAG         GTCTCCCACGTCTTCACCAAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105332 CTGAGAGGGGCTGCCGACAGGTG...CAGGTCTCCCACGTCTTCACCAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 TTTGGCAAGGGCATCCGCTACGTATCTTTTGAGCAGTACGGGAGAGACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107590 TTTGGCAAGGGCATCCGCTACGTATCTTTTGAGCAGTACGGGAGAGACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GAGTTCCTGGGTGGGGCACTACGGCGCCCTTGTGACCCACTCCAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
 107640 GAGTTCCTGGGTGGGGCACTATGGCGCCCTTGTGACCCACTCCAGTGTGA

    850     .    :    .    :
    815 GGGTCAGGATCCGTCTGTCC
        ||||||||||||||||||||
 107690 GGGTCAGGATCCGTCTGTCC