seq1 = pF1KE3909.tfa, 888 bp
seq2 = pF1KE3909/gi568815590r_94150313.tfa (gi568815590r:94150313_94360503), 210191 bp

>pF1KE3909 888
>gi568815590r:94150313_94360503 (Chr8)

(complement)

1-331  (100001-100331)   100% ->
332-408  (107392-107468)   100% ->
409-613  (108281-108485)   100% ->
614-888  (109917-110191)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTCTGAATAATGTCACCATGCGCCAGGGCACTGTGGGCATGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTCTGAATAATGTCACCATGCGCCAGGGCACTGTGGGCATGCAGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGCAGCAGCGCTGGAGCATCCCAGCTGATGGCAGGCATCTGATGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAGCAGCAGCGCTGGAGCATCCCAGCTGATGGCAGGCATCTGATGGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGAAAGAGCCCCACCAGTACAGCCACCGCAACCGCCATTCTGCTACCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGAAAGAGCCCCACCAGTACAGCCACCGCAACCGCCATTCTGCTACCCCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGACCACTGCCGCCGAAGCTGGTCCTCTGACTCCACAGACTCAGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGACCACTGCCGCCGAAGCTGGTCCTCTGACTCCACAGACTCAGTCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCTCTGAGTCAGGGAACACCTACTACCGAGTGGTGCTCATAGGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCTCTGAGTCAGGGAACACCTACTACCGAGTGGTGCTCATAGGGGAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGGGGTGGGCAAGTCCACTCTGGCCAACATCTTTGCAGGTGTGCATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGGGGTGGGCAAGTCCACTCTGGCCAACATCTTTGCAGGTGTGCATGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCATGGACAGCGACTGCGAGGTGCTGGGAG         AAGATACATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100301 AGCATGGACAGCGACTGCGAGGTGCTGGGAGGTA...TAGAAGATACATA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGAACGAACCCTGATGGTTGATGGGGAAAGTGCAACGATTATACTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107402 TGAACGAACCCTGATGGTTGATGGGGAAAGTGCAACGATTATACTCCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ATATGTGGGAAAATAAG         GGGGAAAATGAATGGCTCCATGAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 107452 ATATGTGGGAAAATAAGGTA...TAGGGGGAAAATGAATGGCTCCATGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CACTGCATGCAGGTCGGGGACGCATACCTGATTGTCTACTCAATCACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108305 CACTGCATGCAGGTCGGGGACGCATACCTGATTGTCTACTCAATCACAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCGAGCGAGCTTCGAGAAGGCATCTGAGCTGCGAATCCAGCTCCGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108355 CCGAGCGAGCTTCGAGAAGGCATCTGAGCTGCGAATCCAGCTCCGCAGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCCGGCAGACAGAGGACATTCCCATAATTTTGGTTGGCAACAAAAGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108405 CCCGGCAGACAGAGGACATTCCCATAATTTTGGTTGGCAACAAAAGTGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TTAGTGCGGTGCCGAGAAGTGTCTGTATCAG         AAGGGAGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 108455 TTAGTGCGGTGCCGAGAAGTGTCTGTATCAGGTA...CAGAAGGGAGAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTGTGCAGTGGTGTTTGACTGCAAGTTCATCGAGACCTCTGCAGCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109927 CTGTGCAGTGGTGTTTGACTGCAAGTTCATCGAGACCTCTGCAGCTGTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGCACAACGTGAAGGAGCTGTTTGAGGGCATTGTGCGACAGGTGCGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109977 AGCACAACGTGAAGGAGCTGTTTGAGGGCATTGTGCGACAGGTGCGCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CGGCGGGACAGCAAGGAGAAGAATGAACGGCGGCTGGCCTACCAGAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110027 CGGCGGGACAGCAAGGAGAAGAATGAACGGCGGCTGGCCTACCAGAAAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GAAGGAGAGCATGCCCAGGAAAGCCAGGCGCTTCTGGGGCAAGATCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110077 GAAGGAGAGCATGCCCAGGAAAGCCAGGCGCTTCTGGGGCAAGATCGTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CCAAAAACAACAAGAATATGGCCTTCAAGCTCAAGTCCAAATCCTGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110127 CCAAAAACAACAAGAATATGGCCTTCAAGCTCAAGTCCAAATCCTGCCAT

    900     .    :    .
    874 GACCTCTCTGTACTC
        |||||||||||||||
 110177 GACCTCTCTGTACTC