seq1 = pF1KE3888.tfa, 912 bp
seq2 = pF1KE3888/gi568815582r_20759889.tfa (gi568815582r:20759889_20962538), 202650 bp

>pF1KE3888 912
>gi568815582r:20759889_20962538 (Chr16)

(complement)

1-431  (100001-100431)   100% ->
432-912  (102170-102650)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCAGTGTGTCACCAAGTGTAAGAATCCCTCATCGACCCTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCAGTGTGTCACCAAGTGTAAGAATCCCTCATCGACCCTGGGCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAAAATGGAGACCGTGAGCCCAGCAACAAGTCACATAGCAGGAGGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAAAATGGAGACCGTGAGCCCAGCAACAAGTCACATAGCAGGAGGGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGGCCACCGTGAGGAGCAGGTACCACCCTGTGGCAAGCCAGGTGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGGCCACCGTGAGGAGCAGGTACCACCCTGTGGCAAGCCAGGTGGAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCCTCGTCAACGGGACCAAGAAGGCCGAGGCTGCCACTGAGGCCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCCTCGTCAACGGGACCAAGAAGGCCGAGGCTGCCACTGAGGCCTGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGCCAACGTCCTCGGGAGATGCTGGGAGGGAGTCCAAGTCCAATGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGCCAACGTCCTCGGGAGATGCTGGGAGGGAGTCCAAGTCCAATGCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGGAGTCTTCCTTGCAAAGATTGGAAGAACTGTTCAGGCGCTACAAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGGAGTCTTCCTTGCAAAGATTGGAAGAACTGTTCAGGCGCTACAAGGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGCGGGAAGATGCAATTTTGGAGGAAGGCATGGAGCGCTTTTGCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGCGGGAAGATGCAATTTTGGAGGAAGGCATGGAGCGCTTTTGCAATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGTGTGTTGACCCCACAGAATTTCGAGTGCTGCTCTTGGCTTGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCTGTGTGTTGACCCCACAGAATTTCGAGTGCTGCTCTTGGCTTGGAAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCAGGCTGCAACCATGTGCAAATTCACCAG         GAAGGAGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100401 TCCAGGCTGCAACCATGTGCAAATTCACCAGGTT...CAGGAAGGAGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TTTGATGGCTGCAAAGCAATAAGTGCAGACAGCATTGACGGAATCTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102180 TTTGATGGCTGCAAAGCAATAAGTGCAGACAGCATTGACGGAATCTGTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACGGTTCCCTAGCCTCTTAACAGAAGCCAAACAAGAGGATAAATTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102230 ACGGTTCCCTAGCCTCTTAACAGAAGCCAAACAAGAGGATAAATTCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATCTCTACCGGTTTACATTTCAGTTTGGCCTGGACTCTGAAGAAGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102280 ATCTCTACCGGTTTACATTTCAGTTTGGCCTGGACTCTGAAGAAGGGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CGGTCACTGCATCGGGAAATAGCCATTGCCCTGTGGAAACTAGTCTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102330 CGGTCACTGCATCGGGAAATAGCCATTGCCCTGTGGAAACTAGTCTTTAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCAGAACAATCCTCCGGTATTGGACCAATGGCTAAACTTCCTAACAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102380 CCAGAACAATCCTCCGGTATTGGACCAATGGCTAAACTTCCTAACAGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ACCCCTCGGGGATCAAGGGCATCTCCCGGGACACTTGGAACATGTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102430 ACCCCTCGGGGATCAAGGGCATCTCCCGGGACACTTGGAACATGTTCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 AACTTCACTCAGGTGATTGGCCCTGACCTCAGCAACTACAGTGAAGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102480 AACTTCACTCAGGTGATTGGCCCTGACCTCAGCAACTACAGTGAAGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GGCCTGGCCAAGTCTCTTTGACACCTTTGTGGAGTGGGAAATGGAGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102530 GGCCTGGCCAAGTCTCTTTGACACCTTTGTGGAGTGGGAAATGGAGCGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGAAAAGAGAAGGGGAAGGGAGAGGTGCACTCAGCTCAGGGCCTGAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102580 GGAAAAGAGAAGGGGAAGGGAGAGGTGCACTCAGCTCAGGGCCTGAGGGC

    900     .    :    .    :
    892 TTGTGTCCCGAGGAGCAGACT
        |||||||||||||||||||||
 102630 TTGTGTCCCGAGGAGCAGACT