seq1 = pF1KE3876.tfa, 1833 bp
seq2 = pF1KE3876/gi568815596r_37169559.tfa (gi568815596r:37169559_37416524), 246966 bp

>pF1KE3876 1833
>gi568815596r:37169559_37416524 (Chr2)

(complement)

1-288  (100001-100288)   100% ->
289-427  (123254-123392)   99% ->
428-559  (125526-125657)   100% ->
560-717  (127012-127169)   100% ->
718-910  (130156-130348)   100% ->
911-988  (133906-133983)   100% ->
989-1172  (136596-136779)   100% ->
1173-1296  (138536-138659)   100% ->
1297-1374  (140681-140758)   100% ->
1375-1651  (141828-142104)   99% ->
1652-1704  (144093-144145)   100% ->
1705-1833  (146838-146966)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCTGCAAATAATTCCCCTCCATCAGCCCAGAAGTCTGTATTACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCTGCAAATAATTCCCCTCCATCAGCCCAGAAGTCTGTATTACCCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCTATTCCTGCTGTGCTTCCAGCTGCTTCTCCGTGTTCAAGTCCTAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCTATTCCTGCTGTGCTTCCAGCTGCTTCTCCGTGTTCAAGTCCTAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGGACTCTCTGCCCGACTCTCTAATGGAAGCTTCAGTGCACCATCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGGACTCTCTGCCCGACTCTCTAATGGAAGCTTCAGTGCACCATCACTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACCAACTCCAGAGGCTCAGTGCATACAGTTTCATTTCTACTGCAAATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACCAACTCCAGAGGCTCAGTGCATACAGTTTCATTTCTACTGCAAATTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCACACGGGAGAGTGTTACCATTGAAGCCCAGGAACTGTCTTTATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCACACGGGAGAGTGTTACCATTGAAGCCCAGGAACTGTCTTTATCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGTCAAGGATCTTGTGTGCTCCATAGTTTATCAAAAG         TTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 100251 CTGTCAAGGATCTTGTGTGCTCCATAGTTTATCAAAAGGTA...CAGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCAGAGTGTGGATTCTTTGGCATGTATGACAAAATTCTTCTCTTTCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123257 CCAGAGTGTGGATTCTTTGGCATGTATGACAAAATTCTTCTCTTTCGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGACATGAACTCAGAAAACATTTTGCAGCTGATTACCTCAACAGATGAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 123307 TGACATGAACTCAGAAAACATTTTGCAGCTGATTACCTCAGCAGATGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TACATGAAGGAGACCTAGTGGAAGTGGTTCTTTCAG         CTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 123357 TACATGAAGGAGACCTAGTGGAAGTGGTTCTTTCAGGTA...AAGCTTTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCACAGTAGAAGACTTCCAGATTCGTCCACATACTCTCTATGTACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125531 GCCACAGTAGAAGACTTCCAGATTCGTCCACATACTCTCTATGTACATTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TTACAAAGCTCCTACTTTCTGTGATTACTGTGGTGAGATGCTCTGGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125581 TTACAAAGCTCCTACTTTCTGTGATTACTGTGGTGAGATGCTCTGGGGAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGGTACGTCAAGGACTGAAATGTGAAG         GCTGTGGATTAAAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 125631 TGGTACGTCAAGGACTGAAATGTGAAGGTG...TAGGCTGTGGATTAAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACCATAAACGATGTGCCTTCAAGATTCCAAATAACTGTAGTGGAGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127026 TACCATAAACGATGTGCCTTCAAGATTCCAAATAACTGTAGTGGAGTAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AAAGAGACGTCTGTCAAATGTATCTTTACCAGGACCCGGCCTCTCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127076 AAAGAGACGTCTGTCAAATGTATCTTTACCAGGACCCGGCCTCTCAGTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAAGACCCCTACAGCCTGAATATGTAGCCCTTCCCAGTGAAGAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 127126 CAAGACCCCTACAGCCTGAATATGTAGCCCTTCCCAGTGAAGAGGTA...

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    718    TCACATGTCCACCAGGAACCAAGTAAGAGAATTCCTTCTTGGAGTGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130153 TAGTCACATGTCCACCAGGAACCAAGTAAGAGAATTCCTTCTTGGAGTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 TCGCCCAATCTGGATGGAAAAGATGGTAATGTGCAGAGTGAAAGTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130203 TCGCCCAATCTGGATGGAAAAGATGGTAATGTGCAGAGTGAAAGTTCCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACACATTTGCTGTTCACTCTTACACCCGTCCCACGATATGTCAGTACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130253 ACACATTTGCTGTTCACTCTTACACCCGTCCCACGATATGTCAGTACTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AAGCGGTTACTGAAAGGCCTCTTTCGCCAAGGAATGCAGTGTAAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 130303 AAGCGGTTACTGAAAGGCCTCTTTCGCCAAGGAATGCAGTGTAAAGGTA.

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911      ATTGCAAATTCAACTGCCATAAACGCTGTGCATCAAAAGTACCAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130353 ..TAGATTGCAAATTCAACTGCCATAAACGCTGTGCATCAAAAGTACCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 GAGACTGCCTTGGAGAGGTTACTTTCAATGGAG         AACCTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 133951 GAGACTGCCTTGGAGAGGTTACTTTCAATGGAGGTA...CAGAACCTTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AGTCTGGGAACAGATACAGATATACCAATGGATATTGACAATAATGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136604 AGTCTGGGAACAGATACAGATATACCAATGGATATTGACAATAATGACAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 AAATAGTGATAGTAGTCGGGGTTTGGATGACACAGAAGAGCCATCACCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136654 AAATAGTGATAGTAGTCGGGGTTTGGATGACACAGAAGAGCCATCACCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CAGAAGATAAGATGTTCTTCTTGGATCCATCTGATCTCGATGTGGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136704 CAGAAGATAAGATGTTCTTCTTGGATCCATCTGATCTCGATGTGGAAAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1147 GATGAAGAAGCCGTTAAAACAATCAG         TCCATCAACAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 136754 GATGAAGAAGCCGTTAAAACAATCAGGTA...TAGTCCATCAACAAGCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TAATATTCCGCTAATGAGGGTTGTACAATCCATCAAGCACACAAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138551 TAATATTCCGCTAATGAGGGTTGTACAATCCATCAAGCACACAAAGAGGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AGAGCAGCACAATGGTGAAGGAAGGGTGGATGGTCCATTACACCAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138601 AGAGCAGCACAATGGTGAAGGAAGGGTGGATGGTCCATTACACCAGCAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 GATAACCTG         AGAAAGAGGCATTATTGGAGACTTGACAGCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 138651 GATAACCTGGTC...TAGAGAAAGAGGCATTATTGGAGACTTGACAGCAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 ATGTCTAACATTATTTCAGAATGAATCTGGATCAAAGTATTATAAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 140713 ATGTCTAACATTATTTCAGAATGAATCTGGATCAAAGTATTATAAGGTA.

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1375      GAAATTCCACTTTCAGAAATTCTCCGCATATCTTCACCACGAGAT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140763 ..CAGGAAATTCCACTTTCAGAAATTCTCCGCATATCTTCACCACGAGAT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TTCACAAACATTTCACAAGGCAGCAATCCACACTGTTTTGAAATCATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141873 TTCACAAACATTTCACAAGGCAGCAATCCACACTGTTTTGAAATCATTAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 TGATACTATGGTATACTTCGTTGGTGAGAACAATGGGGACAGCTCTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141923 TGATACTATGGTATACTTCGTTGGTGAGAACAATGGGGACAGCTCTCATA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 ATCCTGTTCTTGCTGCCACTGGAGTTGGACTTGATGTAGCACAGAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141973 ATCCTGTTCTTGCTGCCACTGGAGTTGGACTTGATGTAGCACAGAGCTGG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 GAAAAAGCAATTCGCCAAGCCCTCATGCCTGTTACTCCTCAAGCAAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 142023 GAAAAAGCAATTCGCCAAGCCCTCATGCCTGTTACTCCTCAAGCAAGTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 TTGCACTTCTCCAGGGCGAGGGAAAGATCACA         AAGATTTGT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 142073 TTGCACTTCTCCAGGGCAAGGGAAAGATCACAGTA...CAGAAGATTTGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CTACAAGTATCTCTGTATCTAATTGTCAGATTCAGGAGAATGTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 144102 CTACAAGTATCTCTGTATCTAATTGTCAGATTCAGGAGAATGTGGTA...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1705    GATATCAGTACTGTTTACCAGATCTTTGCAGATGAGGTGCTTGGTTC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146835 CAGGATATCAGTACTGTTTACCAGATCTTTGCAGATGAGGTGCTTGGTTC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 AGGCCAGTTTGGCATCGTTTATGGAGGTAAGCAACTACAGCCGTTTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146885 AGGCCAGTTTGGCATCGTTTATGGAGGTAAGCAACTACAGCCGTTTGCAT

   1900     .    :    .    :    .    :
   1802 ATTGTACACATTATTTTAAAAACTGGAAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 146935 ATTGTACACATTATTTTAAAAACTGGAAAATG