seq1 = pF1KE3815.tfa, 1455 bp
seq2 = pF1KE3815/gi568815588f_133681635.tfa (gi568815588f:133681635_133743146), 61512 bp

>pF1KE3815 1455
>gi568815588f:133681635_133743146 (Chr10)

1-1455  (1851-3299)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGGGTGGAGCCTGCCTGCCTGTGGGCCTTTACAAGGGCGGCTGGC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
   1851 ATGAAGGGGTGGAGCCTGCCTGCCCGTGGGCCTTTACAAGGGCGGCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCTGGCTGGCTGTCCGGGCAGGCCTCCTGGCTGCACCTGCCGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1901 TGGCTGGCTGGCTGTCCGGGCAGGCCTCCTGGCTGCACCTGCCGCAGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACAGTCCGGCTGAGGTGCACGGGAGCCCGCCGGCCTCTCTCTGCCCGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1951 ACAGTCCGGCTGAGGTGCACGGGAGCCCGCCGGCCTCTCTCTGCCCGCGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCGTCCGTGAAATTCCGGCCGGGGCTCACCGCGATGGCCCTCCCGACACC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2001 CCGTCCGTGAAATTGCGGCCGGGGCTCACCGCGATGGCCCTCCCGACACC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCGGACAGCACCCTCCCCGCGGAAGCCCGGGGACGAGGACGGCGACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2051 TTCGGACAGCACCCTCCCCGCGGAAGCCCGGGGACGAGGACGGCGACGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GACTCGTTTGGACCCCGAGCCAAAGCGAGGCCCTGCGAGCCTGCTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2101 GACTCGTTTGGACCCCGAGCCAAAGCGAGGCCCTGCGAGCCTGCTTTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CGGAACCCGTACCCGGGCATCGCCACCAGAGAACGGCTGGCCCAGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2151 CGGAACCCGTACCCGGGCATCGCCACCAGAGAACGGCTGGCCCAGGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGGCATTCCGGAGCCCAGGGTCCAGATTTGGTTTCAGAATGAGAGGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2201 CGGCATTCCGGAGCCCAGGGTCCAGATTTGGTTTCAGAATGAGAGGTCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCCAGCTGAGGCAGCACCGGCGGGAATCTCGGCCCTGGCCCGGGAGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2251 GCCAGCTGAGGCAGCACCGGCGGGAATCTCGGCCCTGGCCCGGGAGACGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGCCCGCCAGAAGGCCGGCGAAAGCGGACCGCCGTCACCGGATCCCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2301 GGCCCGCCAGAAGGCCGGCGAAAGCGGACCGCCGTCACCGGATCCCAGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGCCCTGCTCCTCCGAGCCTTTGAGAAGGATCGCTTTCCAGGCATCGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2351 CGCCCTGCTCCTCCGAGCCTTTGAGAAGGATCGCTTTCCAGGCATCGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCGGGAGGAGCTGGCCAGAGAGACGGGCCTCCCGGAGTCCAGGATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2401 CCCGGGAGGAGCTGGCCAGAGAGACGGGCCTCCCGGAGTCCAGGATTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATCTGGTTTCAGAATCGAAGGGCCAGGCACCCGGGACAGGGTGGCAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2451 ATCTGGTTTCAGAATCGAAGGGCCAGGCACCCGGGACAGGGTGGCAGGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCCCGCGCAGGCAGGCGGCCTGTGCAGCGCGGCCCCCGGCGGGGGTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2501 GCCCGCGCAGGCAGGCGGCCTGTGCAGCGCGGCCCCCGGCGGGGGTCACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGCTCCCTCGTGGGTCGCCTTCGCCCACACCGGCGCGTGGGGAACGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2551 CTGCTCCCTCGTGGGTCGCCTTCGCCCACACCGGCGCGTGGGGAACGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTCCCGCACCCCACGTGCCCTGCGCGCCTGGGGCTCTCCCACAGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2601 CTTCCCGCACCCCACGTGCCCTGCGCGCCTGGGGCTCTCCCACAGGGGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTCGTGAGCCAGGCAGCGAGGGCCGCCCCCGCGCTGCAGCCCAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2651 TTTCGTGAGCCAGGCAGCGAGGGCCGCCCCCGCGCTGCAGCCCAGCCAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCGCGCCGGCAGAGGGGATCTCCCAACCTGCCCCGGCGCGCGGGGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2701 CCGCGCCGGCAGAGGGGATCTCCCAACCTGCCCCGGCGCGCGGGGATTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCTACGCCGCCCCGGCTCCTCCGGACGGGGCGCTCTCCCACCCTCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2751 GCCTACGCCGCCCCGGCTCCTCCGGACGGGGCGCTCTCCCACCCTCAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TCCTCGGTGGCCTCCGCACCCGGGCAAAAGCCGGGAGGACCGGGACCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2801 TCCTCGGTGGCCTCCGCACCCGGGCAAAAGCCGGGAGGACCGGGACCCGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGCGCGACGGCCTGCCGGGCCCCTGCGCGGTGGCACAGCCTGGGCCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2851 AGCGCGACGGCCTGCCGGGCCCCTGCGCGGTGGCACAGCCTGGGCCCGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAAGCGGGGCCGCAGGGCCAAGGGGTGCTTGCGCCACCCACGTCCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2901 CAAGCGGGGCCGCAGGGCCAAGGGGTGCTTGCGCCACCCACGTCCCAGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GAGTCCGTGGTGGGGCTGGGGCCGGGGTCCCCAGGTCGCCGGGGCGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2951 GAGTCCGTGGTGGGGCTGGGGCCGGGGTCCCCAGGTCGCCGGGGCGGCGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GGGAACCCCAAGCCGGGGCAGCTCCACCTCCCCAGCCCGCGCCCCCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3001 GGGAACCCCAAGCCGGGGCAGCTCCACCTCCCCAGCCCGCGCCCCCGGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GCCTCCGCCTCCGCGCGGCAGGGGCAGATGCAAGGCATCCCGGCGCCCTC
        ||||||||------||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3051 GCCTCCGC      GCGGCAGGGGCAGATGCAAGGCATCCCGGCGCCCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 CCAGGCGCTCCAGGAGCCGGCGCCCTGGTCTGCACTCCCCTGCGGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3095 CCAGGCGCTCCAGGAGCCGGCGCCCTGGTCTGCACTCCCCTGCGGCCTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TGCTGGATGAGCTCCTGGCGAGCCCGGAGTTTCTGCAGCAGGCGCAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3145 TGCTGGATGAGCTCCTGGCGAGCCCGGAGTTTCTGCAGCAGGCGCAACCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1351 CTCCTAGAAACGGAGGCCCCGGGGGAGCTGGAGGCCTCGGAAGAGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3195 CTCCTAGAAACGGAGGCCCCGGGGGAGCTGGAGGCCTCGGAAGAGGCCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1401 CTCGCTGGAAGCACCCCTCAGCGAGGAAGAATACCGGGCTCTGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   3245 CTCGCTGGAAGCACCCCTCAGCGAGGAAGAATACCGGGCTCTGCTGGAGG

   1450     .
   1451 AGCTT
        |||||
   3295 AGCTT