seq1 = pF1KE3803.tfa, 303 bp
seq2 = pF1KE3803/gi568815590f_109236127.tfa (gi568815590f:109236127_109443478), 207352 bp

>pF1KE3803 303
>gi568815590f:109236127_109443478 (Chr8)

1-83  (99994-100078)   95% ->
84-154  (103194-103264)   100% ->
155-229  (104363-104437)   100% ->
230-303  (107279-107352)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATG  GTGGTTAGCAAGATGAACAAAGATGCGCAGATGAGAGCAGCGATT
        |||--  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99994 ATGTCCAGGTTAGCAAGATGAACAAAGATGCGCAGATGAGAGCAGCGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     49 AACCAAAAGTTGATAGAAACTGGAGAAAGAGAACG         CCTCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100044 AACCAAAAGTTGATAGAAACTGGAGAAAGAGAACGGTA...CAGCCTCAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     90 AGAGTTGCTGAGAGCTAAATTAATTGAATGTGGCTGGAAGGATCAGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103200 AGAGTTGCTGAGAGCTAAATTAATTGAATGTGGCTGGAAGGATCAGTTGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    140 AGGCACACTGTAAAG         AGGTAATTAAAGAAAAAGGACTAGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103250 AGGCACACTGTAAAGGTA...AAGAGGTAATTAAAGAAAAAGGACTAGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    181 CACGTTACTGTTGATGACTTGGTGGCTGAAATCACTCCAAAAGGCAGAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 104389 CACGTTACTGTTGATGACTTGGTGGCTGAAATCACTCCAAAAGGCAGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    230         CCCTGGTACCTGACAGTGTAAAGAAGGAGCTCCTACAAAGAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104439 TA...CAGCCCTGGTACCTGACAGTGTAAAGAAGGAGCTCCTACAAAGAA

    300     .    :    .    :    .    :
    272 TAAGAACATTCCTTGCTCAGCATGCCAGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 107321 TAAGAACATTCCTTGCTCAGCATGCCAGCCTT