seq1 = pF1KE3802.tfa, 222 bp
seq2 = pF1KE3802/gi568815595r_134378593.tfa (gi568815595r:134378593_134582904), 204312 bp

>pF1KE3802 222
>gi568815595r:134378593_134582904 (Chr3)

(complement)

1-99  (100001-100099)   100% ->
100-222  (104190-104312)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAGTGAGGTTCAGAGAGATGGAAGGATCTTGGATTTGATTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAGTGAGGTTCAGAGAGATGGAAGGATCTTGGATTTGATTGATGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGCTTGGCGAGAAGACAAGCTGCCTTATGAGGATGTCGCAATACCACTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 100051 TGCTTGGCGAGAAGACAAGCTGCCTTATGAGGATGTCGCAATACCACTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    100         AATGAGCTTCCTGAACCTGAACAAGACAATGGTGGCACCACA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TA...CAGAATGAGCTTCCTGAACCTGAACAAGACAATGGTGGCACCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAATCTGTCAAAGAACAAGAAATGAAGTGGACAGACTTAGCCTTACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104232 GAATCTGTCAAAGAACAAGAAATGAAGTGGACAGACTTAGCCTTACAGTA

    200     .    :    .    :    .    :
    192 CCTCCATGAGAATGTTCCCCCCATTGGAAAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 104282 CCTCCATGAGAATGTTCCCCCCATTGGAAAC