Result of SIM4 for
pF1KE3768
seq1 = pF1KE3768.tfa, 2862 bp
seq2 = pF1KE3768/gi568815579f_40092032.tfa (gi568815579f:40092032_40315289), 223258 bp
>pF1KE3768 2862
>gi568815579f:40092032_40315289 (Chr19)
1-682 (100001-100682) 99% ->
683-863 (106344-106524) 100% ->
864-1012 (112454-112602) 100% ->
1013-1188 (113090-113265) 100% ->
1189-1435 (113880-114126) 100% ->
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1553-1724 (120774-120945) 100% ->
1725-1837 (121045-121157) 99% ->
1838-2542 (121486-122190) 99% ->
2543-2862 (122939-123258) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGAGGAGGAGGAGGGGGCGGTGGCCAAGGAGTGGGGCACGACCCCCGC
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100001 ATGGAGGAGGAGGAGGGGGCGGTGGCCAAGGAGTGGGGCACGACCCCCGC
50 . : . : . : . : . :
51 GGGGCCCGTCTGGACCGCGGTGTTCGACTACGAGGCGGCGGGCGACGAGG
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100051 GGGGCCCGTCTGGACCGCGGTGTTCGACTACGAGGCGGCGGGCGACGAGG
100 . : . : . : . : . :
101 AGCTGACCCTGCGGAGGGGCGATCGTGTCCAGGTGCTTTCCCAAGACTGT
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100101 AGCTGACCCTGCGGAGGGGCGATCGCGTCCAGGTGCTTTCCCAAGACTGT
150 . : . : . : . : . :
151 GCGGTGTCCGGCGACGAGGGCTGGTGGACCGGGCAGCTCCCCAGCGGCCG
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100151 GCGGTGTCCGGCGACGAGGGCTGGTGGACCGGGCAGCTCCCCAGCGGCCG
200 . : . : . : . : . :
201 CGTGGGCGTCTTCCCCAGCAACTACGTGGCCCCCGGCGCCCCCGCTGCAC
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100201 CGTGGGCGTCTTCCCCAGCAACTACGTGGCCCCCGGCGCCCCCGCTGCAC
250 . : . : . : . : . :
251 CCGCGGGCCTCCAGCTGCCCCAGGAGATCCCCTTCCACGAGCTGCAGCTA
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100251 CCGCGGGCCTCCAGCTGCCCCAGGAGATCCCCTTCCACGAGCTGCAGCTA
300 . : . : . : . : . :
301 GAGGAGATCATCGGTGTGGGGGGCTTTGGCAAGGTCTATCGGGCCCTGTG
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100301 GAGGAGATCATCGGTGTGGGGGGCTTTGGCAAGGTCTATCGGGCCCTGTG
350 . : . : . : . : . :
351 GCGTGGCGAGGAGGTGGCAGTCAAGGCCGCCCGGCTGGACCCTGAGAAGG
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100351 GCGTGGCGAGGAGGTGGCAGTCAAGGCCGCCCGGCTGGACCCTGAGAAGG
400 . : . : . : . : . :
401 ACCCGGCAGTGACAGCGGAGCAGGTGTGCCAGGAAGCCCGGCTCTTTGGA
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100401 ACCCGGCAGTGACAGCGGAGCAGGTGTGCCAGGAAGCCCGGCTCTTTGGA
450 . : . : . : . : . :
451 GCCCTGCAGCACCCCAACATAATTGCCCTTAGGGGCGCCTGCCTCAACCC
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100451 GCCCTGCAGCACCCCAACATAATTGCCCTTAGGGGCGCCTGCCTCAACCC
500 . : . : . : . : . :
501 CCCACACCTCTGCCTAGTGATGGAGTATGCCCGGGGTGGTGCACTGAGCA
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100501 CCCACACCTCTGCCTAGTGATGGAGTATGCCCGGGGTGGTGCACTGAGCA
550 . : . : . : . : . :
551 GGGTGCTGGCAGGTCGCCGGGTGCCACCTCACGTGCTGGTCAACTGGGCT
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100551 GGGTGCTGGCAGGTCGCCGGGTGCCACCTCACGTGCTGGTCAACTGGGCT
600 . : . : . : . : . :
601 GTGCAGGTGGCCCGGGGCATGAACTACCTACACAATGATGCCCCTGTGCC
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100601 GTGCAGGTGGCCCGGGGCATGAACTACCTACACAATGATGCCCCTGTGCC
650 . : . : . : . : . :
651 CATCATCCACCGGGACCTCAAGTCCATCAACA TCCTGATCC
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100651 CATCATCCACCGGGACCTCAAGTCCATCAACAGTA...CAGTCCTGATCC
700 . : . : . : . : . :
692 TGGAGGCCATCGAGAACCACAACCTCGCAGACACGGTGCTCAAGATCACG
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106353 TGGAGGCCATCGAGAACCACAACCTCGCAGACACGGTGCTCAAGATCACG
750 . : . : . : . : . :
742 GACTTCGGCCTCGCCCGCGAGTGGCACAAGACCACCAAGATGAGCGCTGC
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106403 GACTTCGGCCTCGCCCGCGAGTGGCACAAGACCACCAAGATGAGCGCTGC
800 . : . : . : . : . :
792 GGGGACCTACGCCTGGATGGCGCCGGAGGTTATCCGTCTCTCCCTCTTCT
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106453 GGGGACCTACGCCTGGATGGCGCCGGAGGTTATCCGTCTCTCCCTCTTCT
850 . : . : . : . : . :
842 CCAAAAGCAGTGATGTCTGGAG CTTCGGGGTGCTGCTGTGG
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106503 CCAAAAGCAGTGATGTCTGGAGGTG...CAGCTTCGGGGTGCTGCTGTGG
900 . : . : . : . : . :
883 GAGCTGCTGACGGGGGAGGTCCCCTACCGTGAGATCGACGCCTTGGCCGT
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112473 GAGCTGCTGACGGGGGAGGTCCCCTACCGTGAGATCGACGCCTTGGCCGT
950 . : . : . : . : . :
933 GGCGTATGGCGTGGCTATGAATAAGCTGACGCTGCCCATTCCCTCCACGT
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112523 GGCGTATGGCGTGGCTATGAATAAGCTGACGCTGCCCATTCCCTCCACGT
1000 . : . : . : . : . :
983 GCCCCGAGCCCTTTGCCCGCCTCCTGGAGG AATGCTGGGAC
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112573 GCCCCGAGCCCTTTGCCCGCCTCCTGGAGGGTG...CAGAATGCTGGGAC
1050 . : . : . : . : . :
1024 CCAGACCCCCACGGGCGGCCAGATTTCGGTAGCATCTTGAAGCGGCTTGA
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113101 CCAGACCCCCACGGGCGGCCAGATTTCGGTAGCATCTTGAAGCGGCTTGA
1100 . : . : . : . : . :
1074 AGTCATCGAACAGTCAGCCCTGTTCCAGATGCCACTGGAGTCCTTCCACT
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113151 AGTCATCGAACAGTCAGCCCTGTTCCAGATGCCACTGGAGTCCTTCCACT
1150 . : . : . : . : . :
1124 CGCTGCAGGAAGACTGGAAGCTGGAGATTCAGCACATGTTTGATGACCTT
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113201 CGCTGCAGGAAGACTGGAAGCTGGAGATTCAGCACATGTTTGATGACCTT
1200 . : . : . : . : . :
1174 CGGACCAAGGAGAAG GAGCTTCGGAGCCGTGAGGAGGAGCT
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113251 CGGACCAAGGAGAAGGTG...CAGGAGCTTCGGAGCCGTGAGGAGGAGCT
1250 . : . : . : . : . :
1215 GCTGCGGGCGGCACAGGAGCAGCGCTTCCAGGAGGAGCAGCTGCGGCGGC
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113906 GCTGCGGGCGGCACAGGAGCAGCGCTTCCAGGAGGAGCAGCTGCGGCGGC
1300 . : . : . : . : . :
1265 GGGAGCAGGAGCTGGCAGAACGTGAGATGGACATCGTGGAACGGGAGCTG
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113956 GGGAGCAGGAGCTGGCAGAACGTGAGATGGACATCGTGGAACGGGAGCTG
1350 . : . : . : . : . :
1315 CACCTGCTCATGTGCCAGCTGAGCCAGGAGAAGCCCCGGGTCCGCAAGCG
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114006 CACCTGCTCATGTGCCAGCTGAGCCAGGAGAAGCCCCGGGTCCGCAAGCG
1400 . : . : . : . : . :
1365 CAAGGGCAACTTCAAGCGCAGCCGCCTGCTCAAGCTGCGGGAAGGCGGCA
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114056 CAAGGGCAACTTCAAGCGCAGCCGCCTGCTCAAGCTGCGGGAAGGCGGCA
1450 . : . : . : . : . :
1415 GCCACATCAGCCTGCCCTCTG GCTTTGAGCATAAGATCACA
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114106 GCCACATCAGCCTGCCCTCTGGTA...CAGGCTTTGAGCATAAGATCACA
1500 . : . : . : . : . :
1456 GTCCAGGCCTCTCCAACTCTGGATAAGCGGAAAGGATCCGATGGGGCCAG
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117092 GTCCAGGCCTCTCCAACTCTGGATAAGCGGAAAGGATCCGATGGGGCCAG
1550 . : . : . : . : . :
1506 CCCCCCTGCAAGCCCCAGCATCATCCCCCGGCTGAGGGCCATTCGCC
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117142 CCCCCCTGCAAGCCCCAGCATCATCCCCCGGCTGAGGGCCATTCGCCGTG
1600 . : . : . : . : . :
1553 TGACTCCCGTGGACTGTGGTGGCAGCAGCAGTGGCAGCAGCAGT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
117192 ...CAGTGACTCCCGTGGACTGTGGTGGCAGCAGCAGTGGCAGCAGCAGT
1650 . : . : . : . : . :
1597 GGAGGAAGTGGGACATGGAGCCGCGGTGGGCCCCCAAAGAAGGAAGAACT
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120818 GGAGGAAGTGGGACATGGAGCCGCGGTGGGCCCCCAAAGAAGGAAGAACT
1700 . : . : . : . : . :
1647 GGTCGGGGGCAAGAAGAAGGGACGAACGTGGGGGCCCAGCTCCACCCTGC
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120868 GGTCGGGGGCAAGAAGAAGGGACGAACGTGGGGGCCCAGCTCCACCCTGC
1750 . : . : . : . : . :
1697 AGAAGGAGCGGGTGGGAGGAGAGGAGAG GCTGAAGGGGCTG
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120918 AGAAGGAGCGGGTGGGAGGAGAGGAGAGGTG...CAGGCTGAAGGGGCTG
1800 . : . : . : . : . :
1738 GGGGAAGGAAGCAAACAGTGGTCATCAAGTGCCCCCAACCTGGGCAAGTC
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121058 GGGGAAGGAAGCAAACAGTGGTCATCAAGTGCCCCCAACCTGGGCAAGTC
1850 . : . : . : . : . :
1788 CCCCAAACACACACCCATCGCCCCTGGCTTCGCCAGCCTCAATGAGATGG
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121108 CCCCAAACACACACCCATCGCCCCTGGCTTTGCCAGCCTCAATGAGATGG
1900 . : . : . : . : . :
1838 AGGAGTTCGCGGAGGCAGAGGATGGAGGCAGCAGCGTGCCC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121158 GTA...CAGAGGAGTTCGCGGAGGCAGAGGATGGAGGCAGCAGCGTGCCC
1950 . : . : . : . : . :
1879 CCTTCCCCCTACTCGACCCCGTCCTACCTCTCAGTGCCACTGCCTGCCGA
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121527 CCTTCCCCCTACTCGACCCCGTCCTACCTCTCAGTGCCACTGCCTGCCGA
2000 . : . : . : . : . :
1929 GCCCTCCCCGGGGGCGCGGGCGCCGTGGGAGCCGACGCCGTCCGCGCCCC
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121577 GCCCTCCCCGGGGGCGCGGGCGCCGTGGGAGCCGACGCCGTCCGCGCCCC
2050 . : . : . : . : . :
1979 CCGCTCGGTGGGGACACGGCGCCCGGCGGCGCTGCGACCTGGCGCTGCTA
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121627 CCGCTCGGTGGGGACACGGCGCCCGGCGGCGCTGCGACCTGGCGCTGCTA
2100 . : . : . : . : . :
2029 GGCTGCGCCACGCTGCTGGGGGCTGTGGGCCTGGGCGCCGACGTGGCCGA
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121677 GGCTGCGCCACGCTGCTGGGGGCTGTGGGCCTGGGCGCCGACGTGGCCGA
2150 . : . : . : . : . :
2079 GGCGCGCGCGGCCGACGGTGAGGAGCAGCGGCGCTGGCTCGACGGCCTCT
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121727 GGCGCGCGCGGCCGACGGTGAGGAGCAGCGGCGCTGGCTCGACGGCCTCT
2200 . : . : . : . : . :
2129 TCTTTCCCCGCGCCGGCCGCTTCCCGCGGGGCCTCAGCCCACCCGCGCGT
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121777 TCTTTCCCCGCGCCGGCCGCTTCCCGCGGGGCCTCAGCCCACCCGCGCGT
2250 . : . : . : . : . :
2179 CCCCACGGCCGCCGCGAAGACGTGGGCCCCGGCCTGGGCCTGGCGCCCTC
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121827 CCCCACGGCCGCCGCGAAGACGTGGGCCCCGGCCTGGGCCTGGCGCCCTC
2300 . : . : . : . : . :
2229 GGCCACCCTCGTGTCGCTGTCGTCCGTGTCCGACTGCAACTCCACGCGTT
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121877 GGCCACCCTCGTGTCGCTGTCGTCCGTGTCCGACTGCAACTCCACGCGTT
2350 . : . : . : . : . :
2279 CACTGCTGCGCTCTGACAGTGACGAGGCCGCACCGGCCGCGCCCTCCCCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121927 CACTGCTGCGCTCTGACAGTGACGAGGCCGCACCGGCCGCGCCCTCCCCA
2400 . : . : . : . : . :
2329 CCACCCTCCCCGCCCGCGCCCACACCCACGCCCTCGCCCAGCACCAACCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121977 CCACCCTCCCCGCCCGCGCCCACACCCACGCCCTCGCCCAGCACCAACCC
2450 . : . : . : . : . :
2379 CCTGGTGGACCTGGAGCTGGAGAGCTTCAAGAAGGACCCCCGCCAGTCGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122027 CCTGGTGGACCTGGAGCTGGAGAGCTTCAAGAAGGACCCCCGCCAGTCGC
2500 . : . : . : . : . :
2429 TCACGCCCACCCACGTCACGGCTGCATGCGCTGTGAGCCGCGGGCACCGG
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122077 TCACGCCCACCCACGTCACGGCTGCATGCGCTGTGAGCCGCGGGCACCGG
2550 . : . : . : . : . :
2479 CGGACGCCATCGGATGGGGCGCTGGGGCAGCGGGGGCCGCCCGAGCCCGC
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
122127 CGGACGCCATCGGACGGGGCGCTGGGGCAGCGGGGGCCGCCCGAGCCCGC
2600 . : . : . : . : . :
2529 GGGCCATGGCCCTG GCCCTCGTGACCTTCTGGACTTCCCCC
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122177 GGGCCATGGCCCTGGTG...CAGGCCCTCGTGACCTTCTGGACTTCCCCC
2650 . : . : . : . : . :
2570 GCCTGCCCGACCCCCAGGCCCTGTTCCCAGCCCGCCGCCGGCCCCCTGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122966 GCCTGCCCGACCCCCAGGCCCTGTTCCCAGCCCGCCGCCGGCCCCCTGAG
2700 . : . : . : . : . :
2620 TTCCCAGGCCGCCCCACCACCCTGACCTTTGCCCCGAGACCTCGGCCGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123016 TTCCCAGGCCGCCCCACCACCCTGACCTTTGCCCCGAGACCTCGGCCGGC
2750 . : . : . : . : . :
2670 TGCCAGTCGCCCCCGCTTGGACCCCTGGAAACTGGTCTCCTTCGGCCGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123066 TGCCAGTCGCCCCCGCTTGGACCCCTGGAAACTGGTCTCCTTCGGCCGGA
2800 . : . : . : . : . :
2720 CACTCACCATCTCGCCTCCCAGCAGGCCAGACACTCCGGAGAGCCCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123116 CACTCACCATCTCGCCTCCCAGCAGGCCAGACACTCCGGAGAGCCCTGGG
2850 . : . : . : . : . :
2770 CCCCCCAGCGTGCAGCCCACACTGCTGGACATGGACATGGAGGGGCAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123166 CCCCCCAGCGTGCAGCCCACACTGCTGGACATGGACATGGAGGGGCAGAA
2900 . : . : . : . :
2820 CCAAGACAGCACAGTGCCCCTGTGCGGGGCCCACGGCTCCCAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
123216 CCAAGACAGCACAGTGCCCCTGTGCGGGGCCCACGGCTCCCAC