seq1 = pF1KE3758.tfa, 1293 bp
seq2 = pF1KE3758/gi568815597r_205516549.tfa (gi568815597r:205516549_205723882), 207334 bp

>pF1KE3758 1293
>gi568815597r:205516549_205723882 (Chr1)

(complement)

1-207  (100001-100207)   100% ->
208-1080  (103045-103917)   99% ->
1081-1197  (104810-104926)   100% ->
1198-1293  (107239-107334)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACAGTGCTATCACCCTGTGGCAGTTCCTTCTTCAGCTCCTGCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACAGTGCTATCACCCTGTGGCAGTTCCTTCTTCAGCTCCTGCAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCCTCAGAACAAGCACATGATCTGTTGGACCTCTAATGATGGGCAGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCCTCAGAACAAGCACATGATCTGTTGGACCTCTAATGATGGGCAGTTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCTTTTGCAGGCAGAAGAGGTGGCTCGTCTCTGGGGGATTCGCAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCTTTTGCAGGCAGAAGAGGTGGCTCGTCTCTGGGGGATTCGCAAGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGCCTAACATGAATTATGACAAACTCAGCCGAGCCCTCAGATACTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGCCTAACATGAATTATGACAAACTCAGCCGAGCCCTCAGATACTATTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTAAAG         AATATCATCAAAAAAGTGAATGGTCAGAAGTTTG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTAAAGGTA...CAGAATATCATCAAAAAAGTGAATGGTCAGAAGTTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGTACAAGTTTGTCTCTTATCCAGAGATTTTGAACATGGATCCAATGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103079 TGTACAAGTTTGTCTCTTATCCAGAGATTTTGAACATGGATCCAATGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTGGGCAGGATTGAGGGTGACTGTGAAAGTTTGAACTTCAGTGAAGTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
 103129 GTGGGCAGGATTGAGGGTGACTGTGAAAGTTTAAACTTCAGTGAAGTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGCAGTTCCAAAGATGTGGAGAATGGAGGGAAAGATAAACCACCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103179 CAGCAGTTCCAAAGATGTGGAGAATGGAGGGAAAGATAAACCACCTCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTGGTGCCAAGACCTCTAGCCGCAATGACTACATACACTCTGGCTTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103229 CTGGTGCCAAGACCTCTAGCCGCAATGACTACATACACTCTGGCTTATAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TCTTCATTTACTCTCAACTCTTTGAACTCCTCCAATGTAAAGCTTTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103279 TCTTCATTTACTCTCAACTCTTTGAACTCCTCCAATGTAAAGCTTTTCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ATTGATAAAGACTGAGAATCCAGCCGAGAAACTGGCAGAGAAAAAATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103329 ATTGATAAAGACTGAGAATCCAGCCGAGAAACTGGCAGAGAAAAAATCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTCAGGAGCCCACACCATCTGTCATCAAATTTGTCACGACACCTTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103379 CTCAGGAGCCCACACCATCTGTCATCAAATTTGTCACGACACCTTCCAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AAGCCACCGGTTGAACCTGTTGCTGCCACCATTTCAATTGGCCCAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103429 AAGCCACCGGTTGAACCTGTTGCTGCCACCATTTCAATTGGCCCAAGTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TTCTCCATCTTCAGAAGAAACTATCCAAGCTTTGGAGACATTGGTTTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103479 TTCTCCATCTTCAGAAGAAACTATCCAAGCTTTGGAGACATTGGTTTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 CAAAACTGCCTTCCCTGGAAGCCCCAACCTCTGCCTCTAACGTAATGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103529 CAAAACTGCCTTCCCTGGAAGCCCCAACCTCTGCCTCTAACGTAATGACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCTTTTGCCACCACACCACCCATTTCGTCCATACCCCCTTTGCAGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103579 GCTTTTGCCACCACACCACCCATTTCGTCCATACCCCCTTTGCAGGAACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCCCAGAACACCTTCACCACCACTGAGTTCTCACCCAGACATCGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103629 TCCCAGAACACCTTCACCACCACTGAGTTCTCACCCAGACATCGACACAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 ACATTGATTCAGTGGCTTCTCAGCCAATGGAACTTCCAGAGAATTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103679 ACATTGATTCAGTGGCTTCTCAGCCAATGGAACTTCCAGAGAATTTGTCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 CTGGAGCCTAAAGACCAGGATTCAGTCTTGCTAGAAAAGGACAAAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103729 CTGGAGCCTAAAGACCAGGATTCAGTCTTGCTAGAAAAGGACAAAGTAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 TAATTCATCAAGATCCAAGAAACCCAAAGGGTTAGAACTGGCACCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103779 TAATTCATCAAGATCCAAGAAACCCAAAGGGTTAGAACTGGCACCCACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 TTGTGATCACGAGCAGTGATCCAAGCCCACTGGGAATACTGAGCCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103829 TTGTGATCACGAGCAGTGATCCAAGCCCACTGGGAATACTGAGCCCATCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1042 CTCCCTACAGCTTCTCTTACACCAGCATTTTTTTCACAG         AC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 103879 CTCCCTACAGCTTCTCTTACACCAGCATTTTTTTCACAGGTA...CAGAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 ACCCATCATACTGACTCCAAGCCCCTTGCTCTCCAGTATCCACTTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104812 ACCCATCATACTGACTCCAAGCCCCTTGCTCTCCAGTATCCACTTCTGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 GTACTCTCAGTCCTGTTGCTCCCCTAAGTCCAGCCAGACTGCAAGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104862 GTACTCTCAGTCCTGTTGCTCCCCTAAGTCCAGCCAGACTGCAAGGTGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 AACACACTTTTCCAG         TTTCCTTCTGTACTGAACAGTCATGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 104912 AACACACTTTTCCAGGTA...CAGTTTCCTTCTGTACTGAACAGTCATGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 GCCATTCACTCTGTCTGGGCTGGATGGACCTTCCACCCCTGGCCCATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107265 GCCATTCACTCTGTCTGGGCTGGATGGACCTTCCACCCCTGGCCCATTTT

   1300     .    :    .    :
   1274 CCCCAGACCTACAGAAGACA
        ||||||||||||||||||||
 107315 CCCCAGACCTACAGAAGACA