seq1 = pF1KE3757.tfa, 1185 bp
seq2 = pF1KE3757/gi568815592r_18021422.tfa (gi568815592r:18021422_18222606), 201185 bp

>pF1KE3757 1185
>gi568815592r:18021422_18222606 (Chr6)

(complement)

1-1185  (100001-101185)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCCGAAGCCTCGGAGAGCGGGCCAGCGCTGCATGAGCTCATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCCGAAGCCTCGGAGAGCGGGCCAGCGCTGCATGAGCTCATGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGAGGCGGAGATCAGCCTGCTCGAGTGCAAGGTGTGCTTTGAGAAGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGAGGCGGAGATCAGCCTGCTCGAGTGCAAGGTGTGCTTTGAGAAGTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCACCGGCAGCAGCGGCGCCCGCGCAACCTGTCCTGCGGCCACGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCACCGGCAGCAGCGGCGCCCGCGCAACCTGTCCTGCGGCCACGTGGTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCCTGGCCTGCGTGGCCGCCCTGGCGCACCCGCGCACTCTGGCCCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCCTGGCCTGCGTGGCCGCCCTGGCGCACCCGCGCACTCTGGCCCTCGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGCCCATTCTGCAGGCGAGCTTGCCGGGGCTGCGACACCAGCGACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTGCCCATTCTGCAGGCGAGCTTGCCGGGGCTGCGACACCAGCGACTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCCGGTGCTGCACCTCATAGAGCTCCTGGGCTCAGCGCTTCGCCAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCCGGTGCTGCACCTCATAGAGCTCCTGGGCTCAGCGCTTCGCCAGTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCGGCCGCCCATCGCGCCGCCCCCAGCGCCCCCGGAGCCCTCACCTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCGGCCGCCCATCGCGCCGCCCCCAGCGCCCCCGGAGCCCTCACCTGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCACACCTTCGGCGGCTGGGGGACCCTGGTCAACCCCACCGGACTGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCACACCTTCGGCGGCTGGGGGACCCTGGTCAACCCCACCGGACTGGCGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTTGTCCCAAGACGGGGCGTGTCGTGGTGGTGCACGACGGCAGGAGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTTGTCCCAAGACGGGGCGTGTCGTGGTGGTGCACGACGGCAGGAGGCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCAAGATTTTTGACTCAGGGGGAGGATGCGCGCATCAGTTTGGAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCAAGATTTTTGACTCAGGGGGAGGATGCGCGCATCAGTTTGGAGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGGGACGCTGCCCAAGACATTAGGTACCCTGTGGATGTCACCATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGGGACGCTGCCCAAGACATTAGGTACCCTGTGGATGTCACCATCACCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACGACTGCCATGTGGTTGTCACTGACGCCGGCGATCGTTCCATCAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100551 ACGACTGCCATGTGGTTGTCACTGACGCCGGCGATCGCTCCATCAAAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTGATTTTTTTGGCCAGATCAAGCTTGTCATTGGAGGCCAATTCTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTGATTTTTTTGGCCAGATCAAGCTTGTCATTGGAGGCCAATTCTCCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACCTTGGGGTGTGGAGACCACCCCTCAGAATGGGATTGTGGTAACTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ACCTTGGGGTGTGGAGACCACCCCTCAGAATGGGATTGTGGTAACTGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CGGAGGCAGGGTCCCTGCACCTCCTGGACGTCGACTTCGCGGAAGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CGGAGGCAGGGTCCCTGCACCTCCTGGACGTCGACTTCGCGGAAGGGGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTCGGAGAACTGAAAGGTTGCAAGCTCATCTGTGCAATCCCCGAGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTTCGGAGAACTGAAAGGTTGCAAGCTCATCTGTGCAATCCCCGAGGGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGCAGTGTCTTGGCTCACCGGGGCCATTGCGGTCCTGGAGCACCCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGCAGTGTCTTGGCTCACCGGGGCCATTGCGGTCCTGGAGCACCCCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCCTGGGGACTGGGGTTTGCAGCACCAGGGTGAAAGTGTTTAGCTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCCTGGGGACTGGGGTTTGCAGCACCAGGGTGAAAGTGTTTAGCTCAAGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATGCAGCTTGTCGGCCAAGTGGATACCTTTGGGCTGAGCCTCTACTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATGCAGCTTGTCGGCCAAGTGGATACCTTTGGGCTGAGCCTCTACTTTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTCCAAAATAACTGCCTCCGCTGTGACCTTTGATCACCAGGGAAATGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTCCAAAATAACTGCCTCCGCTGTGACCTTTGATCACCAGGGAAATGTGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TTGTTGCAGATACATCTGGTCCAGCTATCCTTTGCTTAGGAAAACCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TTGTTGCAGATACATCTGGTCCAGCTATCCTTTGCTTAGGAAAACCTGAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GAGTTTCCAGTACCGAAGCCCATGGTCACTCATGGTCTTTCGCATCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GAGTTTCCAGTACCGAAGCCCATGGTCACTCATGGTCTTTCGCATCCTGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GGCTCTTACCTTCACCAAGGAGAATTCTCTTCTTGTGCTGGACACAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GGCTCTTACCTTCACCAAGGAGAATTCTCTTCTTGTGCTGGACACAGCAT

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1151 CTCATTCTATAAAAGTCTATAAAGTTGACTGGGGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 CTCATTCTATAAAAGTCTATAAAGTTGACTGGGGG