seq1 = pF1KE3752.tfa, 474 bp
seq2 = pF1KE3752/gi568815582f_1214031.tfa (gi568815582f:1214031_1424790), 210760 bp

>pF1KE3752 474
>gi568815582f:1214031_1424790 (Chr16)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-150  (100263-100346)   100% ->
151-223  (101624-101696)   98% ->
224-333  (106144-106253)   100% ->
334-413  (106408-106487)   100% ->
414-474  (110700-110760)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGGGATCGCCCTCAGCAGACTCGCCCAGGAGAGGAAAGCATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGGGATCGCCCTCAGCAGACTCGCCCAGGAGAGGAAAGCATGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAAAGACCACCCATTT         GGTTTCGTGGCTGTCCCAACAAAAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 GAAAGACCACCCATTTGTA...CAGGGTTTCGTGGCTGTCCCAACAAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCCCGATGGCACGATGAACCTCATGAACTGGGAGTGCGCCATTCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100288 ATCCCGATGGCACGATGAACCTCATGAACTGGGAGTGCGCCATTCCAGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGAAAGGG         ACTCCGTGGGAAGGAGGCTTGTTCAAACTACG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100338 AAGAAAGGGGTA...CAGACTCCGTGGGAAGGAGGCTTGTTTAAACTACG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GATGCTTTTCAAAGATGATTATCCATCTTCGCCACCAAAAT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101656 GATGCTTTTCAAAGATGATTATCCATCTTCGCCACCAAAATGTA...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GTAAATTCGAACCACCATTATTTCACCCGAATGTGTACCCTTCGGGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106144 GTAAATTCGAACCACCATTATTTCACCCGAATGTGTACCCTTCGGGGACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTGTGCCTGTCCATCTTAGAGGAGGACAAGGACTGGAGGCCAGCCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106194 GTGTGCCTGTCCATCTTAGAGGAGGACAAGGACTGGAGGCCAGCCATCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AATCAAACAG         ATCCTATTAGGAATACAGGAACTTCTAAATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 106244 AATCAAACAGGTA...CAGATCCTATTAGGAATACAGGAACTTCTAAATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AACCAAATATCCAAGACCCAGCTCAAGCAGAGGCCTACACGATTTACTG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 106439 AACCAAATATCCAAGACCCAGCTCAAGCAGAGGCCTACACGATTTACTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    414         CCAAAACAGAGTGGAGTACGAGAAAAGGGTCCGAGCACAAGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106489 TT...CAGCCAAAACAGAGTGGAGTACGAGAAAAGGGTCCGAGCACAAGC

    500     .    :    .
    456 CAAGAAGTTTGCGCCCTCA
        |||||||||||||||||||
 110742 CAAGAAGTTTGCGCCCTCA