seq1 = pF1KE3721.tfa, 1239 bp
seq2 = pF1KE3721/gi568815588r_50207145.tfa (gi568815588r:50207145_50444114), 236970 bp

>pF1KE3721 1239
>gi568815588r:50207145_50444114 (Chr10)

(complement)

1-623  (100001-100623)   99% ->
624-741  (116793-116910)   100% ->
742-895  (132700-132853)   100% ->
896-1062  (135967-136133)   100% ->
1063-1239  (136794-136970)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGAAGTGGTTTATTGGTCACCCAAGAAGGTGGCAGACTGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGAAGTGGTTTATTGGTCACCCAAGAAGGTGGCAGACTGGCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGAATGCTATGCCAGAATACTGTGAGCCTCTGGAGCATTTCACAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGAATGCTATGCCAGAATACTGTGAGCCTCTGGAGCATTTCACAGGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGACTTGATCAACCTAACCCAAGAGGATTTCAAAAAACCCCCCTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGACTTGATCAACCTAACCCAAGAGGATTTCAAAAAACCCCCCTTGTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGAGTCTCCTCTGACAACGGGCAGCGGCTCCTGGACATGATAGAAACCCT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGAGTCTCCTCTGACAATGGGCAGCGGCTCCTGGACATGATAGAAACCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAAATGGAGCACCATTTGGAAGCACACAAGAACGGCCATGCCAATGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAAATGGAGCACCATTTGGAAGCACACAAGAACGGCCATGCCAATGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTCAACATTGGCGTAGACATCCCCACCCCCGACGGCAGCTTCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTCAACATTGGCGTAGACATCCCCACCCCCGACGGCAGCTTCAGCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAGATTAAACCCAACGGGATGCCAAATGGGTATAGGAAAGAGATGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAGATTAAACCCAACGGGATGCCAAATGGGTATAGGAAAGAGATGATAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATCCCCATGCCAGAACTGGAGCGCTCTCAGTACCCCATGGAGTGGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATCCCCATGCCAGAACTGGAGCGCTCTCAGTACCCCATGGAGTGGGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGACTTTTCTGGCCTTTCTTTATGCACTTTCCTGTTTCGTTCTCACCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGACTTTTCTGGCCTTTCTTTATGCACTTTCCTGTTTCGTTCTCACCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGATGATCTCGGTCGTCCACGAACGAGTACCTCCTAAGGAGGTGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGATGATCTCGGTCGTCCACGAACGAGTACCTCCTAAGGAGGTGCAGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCCACTACCGGACACATTTTTTGACCATTTTAACCGGGTGCAGTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCCACTACCGGACACATTTTTTGACCATTTTAACCGGGTGCAGTGGGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTTCTATTTGTGAAATTAATGGCATGATCCTTGTAGGACTCTGGTTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTTCTATTTGTGAAATTAATGGCATGATCCTTGTAGGACTCTGGTTAATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CAGTGGCTGCTCTTAAAATACAA         GTCTATTATTAGCAGAAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100601 CAGTGGCTGCTCTTAAAATACAAGTA...TAGGTCTATTATTAGCAGAAG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 ATTTTTCTGCATAGTTGGCACGCTGTACCTGTATCGGTGTATTACAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116811 ATTTTTCTGCATAGTTGGCACGCTGTACCTGTATCGGTGTATTACAATGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATGTAACTACACTCCCAGTACCTGGTATGCATTTCAACTGTTCTCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116861 ATGTAACTACACTCCCAGTACCTGGTATGCATTTCAACTGTTCTCCGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742          CTTTTCGGAGACTGGGAAGCCCAACTGCGAAGAATAATGAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116911 GTA...CAGCTTTTCGGAGACTGGGAAGCCCAACTGCGAAGAATAATGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GCTCATTGCTGGAGGTGGCTTGTCTATCACTGGCTCTCACAACATGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132741 GCTCATTGCTGGAGGTGGCTTGTCTATCACTGGCTCTCACAACATGTGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 GGGACTATCTGTACAGCGGCCACACGGTCATGCTAACACTTACCTACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132791 GGGACTATCTGTACAGCGGCCACACGGTCATGCTAACACTTACCTACTTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TTTATCAAAGAGT         ATTCCCCTCGGCGACTCTGGTGGTATCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 132841 TTTATCAAAGAGTGTA...CAGATTCCCCTCGGCGACTCTGGTGGTATCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CTGGATTTGCTGGCTTCTCAGCGTAGTTGGAATCTTCTGTATTCTCTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135995 CTGGATTTGCTGGCTTCTCAGCGTAGTTGGAATCTTCTGTATTCTCTTAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CGCATGACCACTACACTGTGGACGTGGTGGTGGCATATTACATCACCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136045 CGCATGACCACTACACTGTGGACGTGGTGGTGGCATATTACATCACCACG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AGACTCTTCTGGTGGTATCACACTATGGCCAATCAGCAA         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 136095 AGACTCTTCTGGTGGTATCACACTATGGCCAATCAGCAAGTG...TAGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GCTAAAGGAAGCTTCCCAGATGAACCTCCTGGCCAGGGTGTGGTGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136796 GCTAAAGGAAGCTTCCCAGATGAACCTCCTGGCCAGGGTGTGGTGGTACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GGCCATTTCAGTACTTTGAAAAGAATGTCCAAGGAATTGTACCTCGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136846 GGCCATTTCAGTACTTTGAAAAGAATGTCCAAGGAATTGTACCTCGATCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 TACCATTGGCCTTTCCCCTGGCCAGTAGTCCACCTCAGTAGGCAAGTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136896 TACCATTGGCCTTTCCCCTGGCCAGTAGTCCACCTCAGTAGGCAAGTTAA

   1250     .    :    .    :    .
   1215 ATACAGCCGGCTGGTGAATGACACA
        |||||||||||||||||||||||||
 136946 ATACAGCCGGCTGGTGAATGACACA