seq1 = pF1KE3694.tfa, 276 bp
seq2 = pF1KE3694/gi568815581f_36111142.tfa (gi568815581f:36111142_36312566), 201425 bp

>pF1KE3694 276
>gi568815581f:36111142_36312566 (Chr17)

1-76  (100001-100076)   100% ->
77-189  (100635-100747)   100% ->
190-276  (101339-101425)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCTCTGCGTGACTGTCCTGTCTCTCCTCGTGCTAGTAGCTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCTCTGCGTGACTGTCCTGTCTCTCCTCGTGCTAGTAGCTGCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCTCTCTAGCACTCTCAGCACCAA         TGGGCTCAGACCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100051 CTGCTCTCTAGCACTCTCAGCACCAAGTA...CAGTGGGCTCAGACCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCACCGCCTGCTGCTTTTCTTACACCGCGAGGAAGCTTCCTCGCAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100650 CCACCGCCTGCTGCTTTTCTTACACCGCGAGGAAGCTTCCTCGCAACTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGGTAGATTACTATGAGACCAGCAGCCTCTGCTCCCAGCCAGCTGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100700 GTGGTAGATTACTATGAGACCAGCAGCCTCTGCTCCCAGCCAGCTGTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    190        GTATTCCAAACCAAAAGAGGCAAGCAAGTCTGCGCTGACCCCA
        >...>>>| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100750 G...TACGGATTCCAAACCAAAAGAGGCAAGCAAGTCTGCGCTGACCCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTGAGTCCTGGGTCCAGGAGTACGTGTATGACCTGGAACTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101382 GTGAGTCCTGGGTCCAGGAGTACGTGTATGACCTGGAACTGAAC