seq1 = pF1KE3689.tfa, 2055 bp
seq2 = pF1KE3689/gi568815596r_86503846.tfa (gi568815596r:86503846_86722866), 219021 bp

>pF1KE3689 2055
>gi568815596r:86503846_86722866 (Chr2)

(complement)

1-226  (99981-100206)   100% ->
227-366  (102398-102537)   100% ->
367-482  (110593-110708)   100% ->
483-2055  (117449-119021)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGCTGAAGCTTTTTTTCTTGCTCCTCTATTTCCTGGTCCTGTTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99981 ATGTGGCTGAAGCTTTTTTTCTTGCTCCTCTATTTCCTGGTCCTGTTCGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGGCCAGGTTTTTTGAGGCCATTGTGTGGTATGAAACTGGCATCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100031 CCTGGCCAGGTTTTTTGAGGCCATTGTGTGGTATGAAACTGGCATCTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCACCCAGCTGGTGGATCCGGTGGCGCTGAGCTTCAAGAAGCTGAAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100081 CCACCCAGCTGGTGGATCCGGTGGCGCTGAGCTTCAAGAAGCTGAAGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATTTTGGAGTGCCGGGGGTTGGGCTACTCAGGGTTGCCCGAGAAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100131 ATTTTGGAGTGCCGGGGGTTGGGCTACTCAGGGTTGCCCGAGAAGAAGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTCCGGGAGCTGGTGGAAAAGTCAG         GTGACTTGATGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100181 TGTCCGGGAGCTGGTGGAAAAGTCAGGCG...CAGGTGACTTGATGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTGAGCTCTATTCTGCTCTCAAGGAAGAAGAAGCATCCGAATCGGTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102413 GTGAGCTCTATTCTGCTCTCAAGGAAGAAGAAGCATCCGAATCGGTTTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGTACCAATTTCAGTGGTGAAATGCACTTCTATGAGCTTGTGGAAGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102463 AGTACCAATTTCAGTGGTGAAATGCACTTCTATGAGCTTGTGGAAGACAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AAAAGATGGCATCTGGCTGGTTCAG         GTCATAGCAAATGACA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102513 AAAAGATGGCATCTGGCTGGTTCAGGTA...TAGGTCATAGCAAATGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GAAGTCCCTTGGTGGGCAAAATTCACTGGGAGAAAATGGTTAAAAAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110609 GAAGTCCCTTGGTGGGCAAAATTCACTGGGAGAAAATGGTTAAAAAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCAAGATTTGGAATACGTACAGGCACATTTAACTGTTCCAGTGATCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110659 TCAAGATTTGGAATACGTACAGGCACATTTAACTGTTCCAGTGATCCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483          ATATTGCAGGAGAAGAGGCTGGGTCCGATCCACACTCATTA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110709 GTA...TAGATATTGCAGGAGAAGAGGCTGGGTCCGATCCACACTCATTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGTCTGTTCCACAAACAAGTACTTCAAAAGGGAAAGTCATGCTTAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117490 TGTCTGTTCCACAAACAAGTACTTCAAAAGGGAAAGTCATGCTTAAAGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TACAGTGGACGCAAGATTGAAGTAGAGCACATTTTTAAATGGATAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117540 TACAGTGGACGCAAGATTGAAGTAGAGCACATTTTTAAATGGATAACTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCATGCAGCTTCTCGGATCAAAACCATTTATAATGCTGAACACTTGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117590 TCATGCAGCTTCTCGGATCAAAACCATTTATAATGCTGAACACTTGAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AAGAATGGAATAAAAGTGATCAGTATTGGTTAAAAATATACCTATTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117640 AAGAATGGAATAAAAGTGATCAGTATTGGTTAAAAATATACCTATTTGCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AACCTTGACCAGCCCCCAGCTTTCTTCTCTGCACTAAGTATAAAGTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117690 AACCTTGACCAGCCCCCAGCTTTCTTCTCTGCACTAAGTATAAAGTTTAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 TGGAAGAGTTGAGTTTATTTTTGTTAATGTAGAAAATTGGGACAACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117740 TGGAAGAGTTGAGTTTATTTTTGTTAATGTAGAAAATTGGGACAACAAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GTTATATGACAGATATTGGCATATATAATATGCCATCATACATACTTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117790 GTTATATGACAGATATTGGCATATATAATATGCCATCATACATACTTAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 ACTCCTGAAGGAATTTACAGGTATGGAAACCACACAGGCGAATTTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117840 ACTCCTGAAGGAATTTACAGGTATGGAAACCACACAGGCGAATTTATATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCTTCAGGCCATGGATTCATTTTTGCGCTCATTACAACCCGAGGTAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117890 CCTTCAGGCCATGGATTCATTTTTGCGCTCATTACAACCCGAGGTAAATG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ATCTGTTTGTTTTGAGCTTGGTTCTAGTTAATCTTATGGCTTGGATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117940 ATCTGTTTGTTTTGAGCTTGGTTCTAGTTAATCTTATGGCTTGGATGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 TTATTTATTACACAAGGAGCTACCATAAAGCGATTTGTGGTTCTCATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117990 TTATTTATTACACAAGGAGCTACCATAAAGCGATTTGTGGTTCTCATAAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CACTTTAGGGACATATAATTCTCTATTAATTATTTCCTGGCTACCTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118040 CACTTTAGGGACATATAATTCTCTATTAATTATTTCCTGGCTACCTGTGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TGGGCTTTTTACAGCTACCTTACTTAGATAGCTTTTATGAATATAGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118090 TGGGCTTTTTACAGCTACCTTACTTAGATAGCTTTTATGAATATAGCTTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 AAATTGTTGAGATATTCCAATACAACCACACTGGCTTCATGGGTAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118140 AAATTGTTGAGATATTCCAATACAACCACACTGGCTTCATGGGTAAGGGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 AGACTGGATGTTTTACTCTTCACACCCAGCCCTGTTTCTCAGTACATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118190 AGACTGGATGTTTTACTCTTCACACCCAGCCCTGTTTCTCAGTACATACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TTGGTCATGGTTTACTAATTGATTACTTTGAGAAGAAGAGAAGGCGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118240 TTGGTCATGGTTTACTAATTGATTACTTTGAGAAGAAGAGAAGGCGCAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 AACAACAATGATGAAGTCAATGCCAATAACTTAGAATGGTTATCAAGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118290 AACAACAATGATGAAGTCAATGCCAATAACTTAGAATGGTTATCAAGTCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GTGGGACTGGTACACCAGCTACCTCTTCCACCCGATTGCTTCTTTTCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118340 GTGGGACTGGTACACCAGCTACCTCTTCCACCCGATTGCTTCTTTTCAGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 ACTTTCCTGTAGAATCTGATTGGGACGAAGACCCTGACTTATTCTTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118390 ACTTTCCTGTAGAATCTGATTGGGACGAAGACCCTGACTTATTCTTGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 CGCTTAGCTTTCCCTGACCTTTGGCTTCACCCTCTGATACCAACTGATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118440 CGCTTAGCTTTCCCTGACCTTTGGCTTCACCCTCTGATACCAACTGATTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 TATTAAAAACTTACCAATGTGGCGATTTAAATGTCTTGGAGTCCAGTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118490 TATTAAAAACTTACCAATGTGGCGATTTAAATGTCTTGGAGTCCAGTCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 AAGAGGAAATGTCGGAGGGGTCTCAAGATACTGAAAATGACTCGGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118540 AAGAGGAAATGTCGGAGGGGTCTCAAGATACTGAAAATGACTCGGAAAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1624 GAGAACACAGACACTTTGAGTAGTGAGAAGGAAGTATTTGAAGATAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118590 GAGAACACAGACACTTTGAGTAGTGAGAAGGAAGTATTTGAAGATAAGCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1674 AAGCGTACTTCACAATTCTCCAGGAACAGCAAGTCACTGTGATGCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118640 AAGCGTACTTCACAATTCTCCAGGAACAGCAAGTCACTGTGATGCTGAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1724 CTTGTTCATGTGCCAATAAATATTGTCAGACCAGCCCATGTGAAAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118690 CTTGTTCATGTGCCAATAAATATTGTCAGACCAGCCCATGTGAAAGGAAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1774 GGGAGGTCATATGGATCATATAACACTAATGAAGATATGGAACCTGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118740 GGGAGGTCATATGGATCATATAACACTAATGAAGATATGGAACCTGATTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1824 GTTAACTTGGCCTGCTGATATGCTGCACTGTACTGAATGTGTTGTTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118790 GTTAACTTGGCCTGCTGATATGCTGCACTGTACTGAATGTGTTGTTTGCC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1874 TAGAGAATTTTGAAAATGGATGTTTGCTAATGGGGTTGCCTTGTGGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118840 TAGAGAATTTTGAAAATGGATGTTTGCTAATGGGGTTGCCTTGTGGTCAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1924 GTGTTTCATCAGAATTGCATTGTGATGTGGTTGGCTGGGGGCCGACATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118890 GTGTTTCATCAGAATTGCATTGTGATGTGGTTGGCTGGGGGCCGACATTG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1974 TTGCCCTGTTTGCCGGTGGCCTTCTTATAAAAAAAAGCAGCCATATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118940 TTGCCCTGTTTGCCGGTGGCCTTCTTATAAAAAAAAGCAGCCATATGCAC

   2050     .    :    .    :    .    :
   2024 AACACCAGCCCTTGTCAAATGATGTCCCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 118990 AACACCAGCCCTTGTCAAATGATGTCCCATCT